1,7-dihydro-5-iodo-4-methoxy-7-(β-D-ribofuranosyl)-2H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one | 873792-79-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 吡咯并嘧啶核苷和核苷酸
• 英文名称: 1,7-dihydro-5-iodo-4-methoxy-7-(β-D-ribofuranosyl)-2H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one
• 英文别名: 1,7-dihydro-5-iodo-4-methoxy-7-(β-D-ribofuranosyl)-2H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-amine；7-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-iodo-4-methoxy-1H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one
• CAS: 873792-79-1
• 化学式: C₁₂H₁₄IN₃O₆
• 分子量: 423.164
• InChiKey: MHWJKQNZJGIKDU-IOSLPCCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,7-dihydro-5-iodo-4-methoxy-7-(β-D-ribofuranosyl)-2H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one 在 磷酸三甲酯 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三甲基氯硅烷 、 三乙胺 、 sodium iodide 、 三氯氧磷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 31.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  遗传密码扩展有利于生物物理研究中 RNA 的位置选择性标记

  摘要：

  大自然依赖于高保真度地读取和合成遗传密码。因此，与规范的 A-T 和 G-C 碱基对正交的核酸构件特别适合促进核酸的位置特异性标记。在这里，我们使用正交 kappa-黄苷碱基对进行标记 RNA 的体外转录。我们设计了一种改进的合成路线，在固相合成中获得 kappa 核苷脱氧形式的亚磷酰胺。通过该 DNA 模板，我们证明了体外转录过程中黄嘌呤核苷的可靠掺入。使用核磁共振波谱法，我们表明黄嘌呤核苷仅在 RNA 螺旋中引入微小的结构变化。我们还合成了一种可点击的 7-脱氮黄苷，它允许用荧光团或其他标签对转录的 RNA 分子进行位点特异性修饰。

  DOI：

  10.1002/chem.201904623
• 作为产物：
  描述：

  4-chloro-5-iodo-2-(pivaloylamino)-7-[(2,3,5-tri-O-benzoyl)-β-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 在 溶剂黄146 、 sodium nitrite 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 1,7-dihydro-5-iodo-4-methoxy-7-(β-D-ribofuranosyl)-2H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  遗传密码扩展有利于生物物理研究中 RNA 的位置选择性标记

  摘要：

  大自然依赖于高保真度地读取和合成遗传密码。因此，与规范的 A-T 和 G-C 碱基对正交的核酸构件特别适合促进核酸的位置特异性标记。在这里，我们使用正交 kappa-黄苷碱基对进行标记 RNA 的体外转录。我们设计了一种改进的合成路线，在固相合成中获得 kappa 核苷脱氧形式的亚磷酰胺。通过该 DNA 模板，我们证明了体外转录过程中黄嘌呤核苷的可靠掺入。使用核磁共振波谱法，我们表明黄嘌呤核苷仅在 RNA 螺旋中引入微小的结构变化。我们还合成了一种可点击的 7-脱氮黄苷，它允许用荧光团或其他标签对转录的 RNA 分子进行位点特异性修饰。

  DOI：

  10.1002/chem.201904623

文献信息

• An Efficient Synthesis Of 7-Functionalized 7-Deazapurine β-D- Or β-L-Ribonucleosides: Glycosylation Of Pyrrolo[2,3-D]Pyrimidines With 1-O-Acetyl-2,3,5-Tri-O-Benzoyl-D-Or L-Ribofuranose
  作者：Xiaohua Peng、Frank Seela

  DOI：10.1080/15257770701490332

  日期：2007.11.26

  The glycosylation reaction performed with 7-halogenated 7-deazapurines employing commercially available 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-D- or L-ribofuranoses is described.

  描述了使用可商购的1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-D-或L-呋喃呋喃糖酶用7-卤代7-脱氮嘌呤进行的糖基化反应。
• 7-Functionalized 7-Deazapurine Ribonucleosides Related to 2-Aminoadenosine, Guanosine, and Xanthosine:  Glycosylation of Pyrrolo[2,3-<i>d</i>]pyrimidines with 1-<i>O</i>-Acetyl-2,3,5-tri-<i>O</i>-benzoyl-<scp>d</scp>-ribofuranose
  作者：Frank Seela、Xiaohua Peng

  DOI：10.1021/jo0516640

  日期：2006.1.1

  The Silyl-Hilbert-Johnson reaction as well as the nucleobase-anion glycosylation of a series of 7-deazapurines has been investigated, and the 7-functionalized 7-deazapurine ribonucleosides were prepared. Glycosylation of the 7-halogenated 6-chloro-2-pivaloylamino-7-deazapurines 9b-d with 1-O-acetyl2,3,5-tri-O-benzOyl-D-ribofuranose (5) gave the beta-D-nucleosides 11b-d (73-75% yield), which were transformed to a number of novel 7-halogenated 7-deazapurine ribonucleosides (2b-d, 3b-d, and 4b-d) related to guanosine, 2-aminoadenosine, and xanthosine. 7-Alkynyl derivatives (2e-i, 3e-h, or 4g) have been prepared from the corresponding 7-iodonucleosides 2d, 3d, or 4d employing the palladium-catalyzed Sonogashira cross-coupling reaction. The 7-halogenated 2-amino-7-deazapurine ribonucleosides with a reactive 6-chloro substituent (18b-d) were synthesized in an alternative way using nucleobase-anion glycosylation performed on the 7-halogenated 2-arnino-6-chloro-7-deazapurines 13b-d with 5-0-[(1,1dimethylethyl)dimethylsilyl]-2,3-O-(1-methylethylidene)-alpha-D-ribofuranosyl chloride (17). Compounds 18b-d have been converted to the nucleosides 19b-d carrying reactive substituents in the pyrimidine moiety. Conformational analysis of selected nucleosides on the basis of proton coupling constants and using the program PSEUROT showed that these ribonucleosides exist in a preferred S conformation in solution.