5-methoxycarbonylmethylaminomethyl-2'-deoxyuridine | 1233946-54-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-methoxycarbonylmethylaminomethyl-2'-deoxyuridine
• CAS: 1233946-54-7
• 化学式: C₁₃H₁₉N₃O₇
• 分子量: 329.31
• InChiKey: OEDDFNVYKCNQOH-IVZWLZJFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.56
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  142.88
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-methoxycarbonylmethylaminomethyl-2'-deoxyuridine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 作用下， 以68%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methoxycarbonylmethylaminomethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  RNA-cleaving 10–23 deoxyribozyme with a single amino acid-like functionality operates without metal ion cofactors

  摘要：

  通过化学合成获得了一系列 10â23 个脱氧核糖核酸酶（D2âD9），它们在催化核心的第 4、5、8 或 15 位含有单个氨基酸核苷（thr6dA、hisam6dA、hisam5dU 和 ncmnm5dU）。对这些脱氧核糖酶的催化效率进行了筛选，发现在 1 mM Mg2+ 的存在下，其中两种在第 8 位含有 hisam5dU（D8）或 ncmnm5dU（D9）的 RNA 核酶的活性是其未修饰前体的数倍。此外，在无镁的 TRIS 或 PIPES 缓冲液中，这些酶能够催化位于互补 RNA 底物的 5â²-GpU-3â² 序列之间的磷酸二酯键的裂解。当 pH 值大于 7 时，裂解反应的效率最高。

  DOI：

  10.1039/b9nj00705a
• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 吡啶 、 2,6-二甲基吡啶 、 甲醇 、 dipotassium peroxodisulfate 、 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 三乙酰氧基硼氢化钠 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 28.0h， 生成 5-methoxycarbonylmethylaminomethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  RNA-cleaving 10–23 deoxyribozyme with a single amino acid-like functionality operates without metal ion cofactors

  摘要：

  通过化学合成获得了一系列 10â23 个脱氧核糖核酸酶（D2âD9），它们在催化核心的第 4、5、8 或 15 位含有单个氨基酸核苷（thr6dA、hisam6dA、hisam5dU 和 ncmnm5dU）。对这些脱氧核糖酶的催化效率进行了筛选，发现在 1 mM Mg2+ 的存在下，其中两种在第 8 位含有 hisam5dU（D8）或 ncmnm5dU（D9）的 RNA 核酶的活性是其未修饰前体的数倍。此外，在无镁的 TRIS 或 PIPES 缓冲液中，这些酶能够催化位于互补 RNA 底物的 5â²-GpU-3â² 序列之间的磷酸二酯键的裂解。当 pH 值大于 7 时，裂解反应的效率最高。

  DOI：

  10.1039/b9nj00705a