5-(bromomethyl)-1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-3-((2-(trimethylsilyl)ethoxy)methyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1334214-52-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(bromomethyl)-1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-3-((2-(trimethylsilyl)ethoxy)methyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• CAS: 1334214-52-6
• 化学式: C₃₈H₅₉BrN₂O₆Si₃
• 分子量: 804.057
• InChiKey: SZNXNKFFYGTAJG-LBFZIJHGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.47
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  80.92
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 5-(bromomethyl)-1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-3-((2-(trimethylsilyl)ethoxy)methyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 正丁基锂 、 二异丙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 C₇₆H₁₂₀N₄O₁₂Si₆
  参考文献：
  名称：

  晶体结构和修复研究揭示了紫外线诱导的孢子光产物DNA损伤的身份和碱基配对特性

  摘要：

  紫外线是DNA损伤的主要原因之一。在孢子DNA中，由于遗传物质的异常堆积，形成了特殊的孢子光产物病灶（SP病灶），该酶被孢子光产物裂解酶（Spl）（一种S-腺苷甲硫氨酸（SAM）自由基）酶修复。我们在这里报告缺少磷酸二酯主链的DNA SP损伤类似物的合成和DNA掺入。寡核苷酸用于修复研究，并与聚合酶作为模板共结晶，以阐明SP病变的构型并提供有关病变碱基配对特性的信息。结构分析与修复研究一起使我们能够清楚地了解优先修复的病变非对映异构体的身份。

  DOI：

  10.1002/chem.201100177
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-tert-butyldiphenylsilylthymidine 在 咪唑 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 偶氮二异丁腈 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 140.0h， 生成 5-(bromomethyl)-1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-3-((2-(trimethylsilyl)ethoxy)methyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  晶体结构和修复研究揭示了紫外线诱导的孢子光产物DNA损伤的身份和碱基配对特性

  摘要：

  紫外线是DNA损伤的主要原因之一。在孢子DNA中，由于遗传物质的异常堆积，形成了特殊的孢子光产物病灶（SP病灶），该酶被孢子光产物裂解酶（Spl）（一种S-腺苷甲硫氨酸（SAM）自由基）酶修复。我们在这里报告缺少磷酸二酯主链的DNA SP损伤类似物的合成和DNA掺入。寡核苷酸用于修复研究，并与聚合酶作为模板共结晶，以阐明SP病变的构型并提供有关病变碱基配对特性的信息。结构分析与修复研究一起使我们能够清楚地了解优先修复的病变非对映异构体的身份。

  DOI：

  10.1002/chem.201100177