Comparative Analysis of Small Molecules and Histone Substrate Analogues as LSD1 Lysine Demethylase Inhibitors
作者:Jeffrey C. Culhane、Dongqing Wang、Paul M. Yen、Philip A. Cole
DOI:10.1021/ja909996p
日期:2010.3.10
inhibition, herein we further our analysis of warheads in peptide scaffolds to include the chlorovinyl, endo-cyclopropylamine, and hydrazine-functionalities as LSD1 inactivators. We find that chlorovinyl-H3 is a mechanism-based LSD1 inactivator whereas endo-cyclopropylamine-H3 does not show time-dependent inactivation. The hydrazine-H3 was shown to be the most potent LSD1 suicide inhibitor yet reported
LSD1 是一种黄素依赖性组蛋白去甲基化酶,可氧化去除组蛋白 H3 的 Lys-4 中的甲基。LSD1 属于胺氧化酶超家族,它利用分子氧将胺转化为亚胺,然后水解裂解为甲醛。在先前的研究中,已经表明单胺氧化酶抑制支架如炔丙胺和环丙胺可以作为 LSD1 的基于机制的灭活剂。炔丙胺-组蛋白 H3 肽类似物是有效的 LSD1 抑制剂,而小分子抗抑郁药 MAO 炔类抑制剂如 pargyline 不抑制 LSD1。相比之下,小分子 MAO 环丙胺抑制剂反苯环丙胺是一种时间依赖性 LSD1 抑制剂,但外环丙胺肽底物类似物不是。为了进一步了解 LSD1 抑制中小分子与肽的关系,本文进一步分析了肽支架中的弹头,将氯乙烯、内环丙胺和肼官能团作为 LSD1 灭活剂。我们发现氯乙烯基-H3 是一种基于机制的 LSD1 灭活剂,而内环丙胺-H3 不显示时间依赖性灭活。肼-H3 被证明是迄今为止报道的最有效的 LSD1