(2R,3S,5R)-2-((((2-chlorophenoxy)(((2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)oxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate | 85231-40-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: (2R,3S,5R)-2-((((2-chlorophenoxy)(((2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)oxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
• CAS: 85231-40-9
• 化学式: C₃₁H₃₆ClN₄O₁₄P
• 分子量: 755.072
• InChiKey: PHUTXDHJEGFQBT-KOZKOKFRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.79
• 重原子数：
  51.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  236.54
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  16.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine-3'-O-(2-chlorophenyl)phosphate triethylammonium salt 、 (2R,3S,5R)-2-((((2-chlorophenoxy)(((2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)oxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate 在 N-甲基咪唑 、 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 作用下， 反应 0.25h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Efficient and flexible access to fully protected trinucleotides suitable for DNA synthesis by automated phosphoramidite chemistry

  摘要：

  本文介绍了一种高效的三核苷酸磷酰胺保护合成方法，适用于逐个密码子合成结构基因组合文库；该方法的基础是在两个寡聚体末端使用一对正交的保护基团，并可灵活选择从二聚体到三聚体的链延伸方向。

  DOI：

  10.1039/cc9960002677
• 作为产物：
  描述：

  在 三氯乙酸 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 (2R,3S,5R)-2-((((2-chlorophenoxy)(((2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)oxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  Efficient and flexible access to fully protected trinucleotides suitable for DNA synthesis by automated phosphoramidite chemistry

  摘要：

  本文介绍了一种高效的三核苷酸磷酰胺保护合成方法，适用于逐个密码子合成结构基因组合文库；该方法的基础是在两个寡聚体末端使用一对正交的保护基团，并可灵活选择从二聚体到三聚体的链延伸方向。

  DOI：

  10.1039/cc9960002677