摘要:
设计并评估了基于吲哚的叠氮基烯亚胺和环戊[b]吲哚甲基化物种类的DNA识别剂。识别过程涉及在主要沟槽中的选择性烷基化或插入相互作用。DNA切割是由于磷酸酯主链烷基化(水解切割)和N(7)-烷基化(哌啶切割)所致。使用富集的13C NMR光谱和X射线晶体学研究了乙亚胺的形成和结局。氮丙啶基烯亚胺特异性地使DNA的N(7)位烷基化,从而使氮丙啶基烷基化中心指向烷基化碱基的3'-或5'-磷酸。乙胺亚胺形成二聚体和三聚体,它们似乎可以识别多达三个碱基对的DNA。环戊[b]吲哚醌甲基化物可识别3'-GT-5' 对鸟嘌呤N(7)和胸腺嘧啶6-羰基氧进行测序和烷基化,导致这些碱基的水解去除。总之,描述了新型的DNA识别剂,并说明了13C富集和13C NMR在研究DNA烷基化反应中的用途。