((2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl ((2R,3S,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl) methyl phosphate | 93134-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: ((2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl ((2R,3S,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl) methyl phosphate
• CAS: 93134-61-3
• 化学式: C₄₈H₅₀N₅O₁₄P
• 分子量: 951.924
• InChiKey: PLYBUPOPJHUWGW-MRUDJDBFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.47
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  229.99
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 ((2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl ((2R,3S,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl) methyl phosphate 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以80%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  基于二聚体亚磷酰胺和酚或核苷核的分支DNA杂化物的溶液相合成

  摘要：

  DNA臂上带有“ CG拉链”的分支寡核苷酸从微摩尔溶液中组装成材料。它们的合成由于固相合成中的低产率而变得复杂。在这里，我们提出了一种基于二聚体和酚核的亚磷酰胺的溶液相合成方法，该方法可产生六臂或四臂杂化体，产率高达61％。在杂种水平上，仅需通过沉淀或色谱法纯化最终产物。通过固溶相途径共制备了五种不同的杂种，包括新杂种（TCG）4具有四（三唑基苯基）金刚烷核心和三聚体DNA臂的TTPA。该新方法比固相合成更容易扩大规模，每酚醇使用不超过4当量的亚磷酰胺，并提供常规途径通过可预测的碱基配对相互作用组装的新型材料。

  DOI：

  10.1021/jo202505h
• 作为产物：
  描述：

  N⁴-Benzoyl-5'-O-(dimethoxytrityl)-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxycytidine 在 四丁基氟化铵 、 zinc dibromide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 ((2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl ((2R,3S,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl) methyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  Improvements in oligodeoxyribonucleotide synthesis: methyl N,N-dialkylphosphoramidite dimer units for solid support phosphite methodology

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00199a032

文献信息

• A practical dinucleotide phosphoramidite chemistry for de novo DNA synthesis via block coupling
  作者：Anzhe Shi、Liyan Liu、Fei Wang、Xinxiu Deng、Xiaoyang He、Shengqi Wang

  DOI：10.1016/j.tetlet.2024.155106

  日期：2024.6