摘要:
碱基翻转,即核碱基到螺旋外位置的构象变化,是受损 DNA 酶促修复的关键步骤。一种可以检测游离溶液中翻转物种而不对 DNA 进行共价修饰的分析将是可取的。报道了一种简单、灵敏且快速的检测方法的设计和合成,该检测方法使用锌循环和常用的荧光报告基团丹磺酰与嘧啶进行特异性非共价结合。锌循环单元与翻转出的胸腺嘧啶碱基的结合导致丹酰基团的荧光特性发生变化,这不同于与双链 DNA 的非特异性结合或插入翻转入或翻转出的物种。使用荧光光谱和检测在 533 ± 5 nm 处测试该测定,使用正常和无碱基双链 DNA 作为阴性和阳性对照。将获得的数据拟合到单位点结合模型,以确定涉及碱基翻转的两步过程的平衡常数......