1-[2-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3-C-[(trimethylsilyl)ethynyl]-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil | 162611-20-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-[2-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3-C-[(trimethylsilyl)ethynyl]-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil
• 英文别名: 1-[(2R,3R,4R,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-4-(2-trimethylsilylethynyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 162611-20-3
• 化学式: C₂₀H₃₄N₂O₆Si₂
• 分子量: 454.671
• InChiKey: PIXBZZKWSRHZAU-XNWPKKHHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.18±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.84
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[2-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3-C-[(trimethylsilyl)ethynyl]-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil 在 吡啶 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 1-[2,5-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3-C-ethynyl-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  通过向3'-β-乙炔基尿苷自由基加成苯乙烯基或巯基进行环化。3'-β-乙炔基是否是核糖核苷酸还原酶中的自旋陷阱？

  摘要：

  原位生成的苯乙烯基或噻吩基与AIBN在（2'-5'-二-O-叔丁基二甲基甲硅烷基-3'-C-乙炔基-β-D-呋喃呋喃糖基）尿嘧啶（2）上的反应得到60％和17％的收率分别环化了加合物3和4，其中通过向三键上加成苯乙烯基或噻吩基而形成的乙烯基与碱反应。3'-β-乙炔基尿苷二磷酸酯和三磷酸酯可能是核糖核苷酸还原酶瞬时巯基自由基的自旋阱。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(97)01308-7
• 作为产物：
  描述：

  2',5'-bis-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-ketouridine 在 正丁基锂 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 水 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 1-[2-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3-C-[(trimethylsilyl)ethynyl]-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  乙炔基铈试剂的非对映选择性加成和Barton-McCombie反应是合成C-3'-乙炔基核糖核苷和C-3'-乙炔基-2'-脱氧核糖核苷的关键步骤。

  摘要：

  我们描述了从相应的核苷开始制备3'-炔基尿苷4a和-腺苷4b以及3'-炔基-2'-脱氧尿苷16a和-腺苷16b的方法。通过使乙炔基铈-锂试剂在3'-酮核苷上与未保护的C-5'处的羟基反应，可获得所需的C-3'叔醇立体化学。通过Barton-McCombie反应在适当的条件下进行2'-脱氧，其中在三键上抑制了氢化锡的添加。报道了对C-3'修饰的核苷的抗HIV活性的评估。

  DOI：

  10.1021/jo9704568

文献信息

• Nucleosides and Nucleotides. 175. Structural Requirements of the Sugar Moiety for the Antitumor Activities of New Nucleoside Antimetabolites, 1-(3-<i>C</i>-Ethynyl-β-<scp>d</scp>-<i>r</i><i>ibo</i>-pentofuranosyl)cytosine and -uracil
  作者：Hideshi Hattori、Eisuke Nozawa、Tomoharu Iino、Yuichi Yoshimura、Satoshi Shuto、Yuji Shimamoto、Makoto Nomura、Masakazu Fukushima、Motohiro Tanaka、Takuma Sasaki、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jm9801814

  日期：1998.7.1

  1-(3-C-ethynyl-beta-d-ribo-pentofuranosyl)uracil (EUrd) and its cytosine congener (ECyd) as potential multifunctional antitumor nucleoside antimetabolites. They showed potent and broad-spectrum antitumor activity against various human and mouse tumor cells in vitro and in vivo. To clarify the structure-activity relationship of the sugar moiety, various 3'-C-carbon-substituted analogues, such as 1-propynyl

  我们以前设计1-（3-C-乙炔基-β-d-核糖基戊呋喃糖基）尿嘧啶（EUrd）及其胞嘧啶同源物（ECyd）作为潜在的多功能抗肿瘤核苷抗代谢物。他们在体外和体内显示出对各种人类和小鼠肿瘤细胞的有效和广谱抗肿瘤活性。为了阐明糖部分的结构-活性关系，合成了ECyd和EUrd的各种3'-C-碳取代的类似物，例如1-丙炔基，1-丁炔基，乙烯基，乙基和环丙基衍生物。我们还制备了具有不同构型的ECyd和EUrd的3'-脱氧类似物和3'-同源物，以确定3'-羟基的作用以及3'-碳原子与乙炔基之间的长度以及2'- ECyd的乙炔基衍生物可确定乙炔基的空间要求。这些核苷对小鼠白血病L1210和人KB细胞的体外肿瘤细胞生长抑制活性表明ECyd和EUrd是该系列中最有效的抑制剂，对于L1210细胞，IC50值为0.016和0.13 microM，对于L1210细胞，IC50值为0.028和0.029 microM
• PREPARATION OF 1-(3-C-(PROPA-1,2-DIENYL)-D-<i>RIBO</i>-PENTOFURANOSYL)URACIL, AN ALLENIC NUCLEOSIDE
  作者：Jérôme Dauvergne、Alain Burger、Jean-François Biellmann

  DOI：10.1081/ncn-100107189

  日期：2001.12.31

  The Crabbé reaction was extended to the preparation of C-3′-allenyl-uridine. The effects of solvent and protecting group on the reaction were studied. The conversion in refluxing dioxan of disilyl either 3 proceeds to the corresponding allenic nucleoside 7; whereas, in refluxing THF the Mannich base 5 was obtained. Fully deprotected Mannich base and allenic uridines 6 and 9 were tested for their antitumor

  Crabbé反应扩展到C-3'-烯基-尿苷的制备。研究了溶剂和保护基对反应的影响。二甲苯基中的二甲苯基在回流的二恶烷中的转化进行到相应的烯丙基核苷7; 而在回流THF中得到曼尼希碱5。测试了完全脱保护的曼尼希碱和烯丙基尿苷6和9的抗肿瘤活性。
• Cyclization by free radical addition of stannyl or thiyl radical to 3′-β-ethynyl uridine. Is the 3′-β-ethynyl group a spin trap in ribonucleotide reductase?
  作者：Pierre M.J Jung、Jérôme Dauvergne、Alain Burger、Jean-François Biellmann

  DOI：10.1016/s0040-4039(97)01308-7

  日期：1997.8

  Reaction of a stannyl or a thiyl radical, generated in situ with AIBN, on (2′-5′-di-O-tert-butyldimethylsilyl-3′-C-ethynyl-β-D-ribofuranosyl)uracil (2) gave in 60% and 17% yield respectively cyclized adducts 3 and 4 where the vinylic radical, formed by addition of stannyl or thiyl radical to the triple bond, reacted with the base. The 3′-β-ethynyl uridine di- and triphosphates could be a spin trap

  原位生成的苯乙烯基或噻吩基与AIBN在（2'-5'-二-O-叔丁基二甲基甲硅烷基-3'-C-乙炔基-β-D-呋喃呋喃糖基）尿嘧啶（2）上的反应得到60％和17％的收率分别环化了加合物3和4，其中通过向三键上加成苯乙烯基或噻吩基而形成的乙烯基与碱反应。3'-β-乙炔基尿苷二磷酸酯和三磷酸酯可能是核糖核苷酸还原酶瞬时巯基自由基的自旋阱。
• Rapid and efficient stereocontrolled synthesis of C-3′-ethynyl ribo and xylonucleosides by organocerium additions to 3′-ketonucleosides
  作者：Pierre M.J Jung、Alain Burger、Jean-Francois Biellmann

  DOI：10.1016/0040-4039(94)02434-d

  日期：1995.2

  In order to prepare new anti-retroviral nucleoside analogues, the effect of the group at C-5' on the addition of lithium and cerium trimethylsilylacetylide on 3'-ketonucleosidcs (R(1) = H, R(1) = TBDMS) derived from adenosine and uridine was studied. The best results in respect of yield (56 to 81%) and diastereoselectivity (95:5 to >98:2) were obtained with a cerium reagent (RCcCl(2)).
• Diastereofacial Selective Addition of Ethynylcerium Reagent and Barton−McCombie Reaction as the Key Steps for the Synthesis of <i>C</i>-3‘-Ethynylribonucleosides and of <i>C</i>-3‘-Ethynyl-2‘-deoxyribonucleosides
  作者：Pierre M. J. Jung、Alain Burger、Jean-François Biellmann

  DOI：10.1021/jo9704568

  日期：1997.11.1

  starting from the corresponding nucleosides. The desired stereochemistry of the C-3' tertiary alcohol was obtained by reaction of an ethynylcerium-lithium reagent on a 3'-ketonucleoside with the hydroxyl group at C-5' unprotected. The 2'-deoxygenation was performed by a Barton-McCombie reaction under appropriate conditions where the addition of tin hydride to the triple bond was suppressed. Evaluation of

  我们描述了从相应的核苷开始制备3'-炔基尿苷4a和-腺苷4b以及3'-炔基-2'-脱氧尿苷16a和-腺苷16b的方法。通过使乙炔基铈-锂试剂在3'-酮核苷上与未保护的C-5'处的羟基反应，可获得所需的C-3'叔醇立体化学。通过Barton-McCombie反应在适当的条件下进行2'-脱氧，其中在三键上抑制了氢化锡的添加。报道了对C-3'修饰的核苷的抗HIV活性的评估。