2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-(2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl)benzamide | 1422389-91-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-(2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl)benzamide
• 英文别名: 2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide
• CAS: 1422389-91-0
• 化学式: C₁₉H₂₀ClFN₄O₃
• 分子量: 406.844
• InChiKey: QHWMIGPLLWYRIR-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  500.9±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.374±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  81.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-(2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl)benzamide 在 tin(II) chloride dihdyrate 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 7.0h， 以73.4%的产率得到N-(5-amino-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)-2-chloro-4-fluoro-3-methylbenzamide
  参考文献：
  名称：

  基于结构的设计和小分子抑制剂的合成干扰MLL1-WDR5的相互作用

  摘要：

  MLL1复合物催化H3K4的甲基化，并在具有MLL融合蛋白的急性白血病的发展中起重要作用。靶向MLL1-WDR5蛋白-蛋白相互作用（PPI）以抑制MLL1复合物的组蛋白甲基转移酶的活性是治疗急性白血病的一种新策略。WDR5-47（IC 50  = 0.3μM）被定义为干扰MLL1-WDR5相互作用的强力小分子。在这里，我们描述了基于结构的设计和小分子抑制剂的合成以阻断MLL1-WDR5 PPI。尤其是，化合物23（IC 50  = 104 nM）是最有效的小分子，其效力是WDR5-47的约3倍。我们还通过对接研究讨论了这些系列化合物的SAR，这可能会刺激更有效的化合物。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.04.032
• 作为产物：
  描述：

  2-氯-6-氟甲苯 在 吡啶 、 aluminum (III) chloride 、 氯化亚砜 、 溴 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 17.5h， 生成 2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-(2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  基于结构的设计和小分子抑制剂的合成干扰MLL1-WDR5的相互作用

  摘要：

  MLL1复合物催化H3K4的甲基化，并在具有MLL融合蛋白的急性白血病的发展中起重要作用。靶向MLL1-WDR5蛋白-蛋白相互作用（PPI）以抑制MLL1复合物的组蛋白甲基转移酶的活性是治疗急性白血病的一种新策略。WDR5-47（IC 50  = 0.3μM）被定义为干扰MLL1-WDR5相互作用的强力小分子。在这里，我们描述了基于结构的设计和小分子抑制剂的合成以阻断MLL1-WDR5 PPI。尤其是，化合物23（IC 50  = 104 nM）是最有效的小分子，其效力是WDR5-47的约3倍。我们还通过对接研究讨论了这些系列化合物的SAR，这可能会刺激更有效的化合物。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.04.032

文献信息

• Synthesis, Optimization, and Evaluation of Novel Small Molecules as Antagonists of WDR5-MLL Interaction
  作者：Yuri Bolshan、Matthäus Getlik、Ekaterina Kuznetsova、Gregory A. Wasney、Taraneh Hajian、Gennadiy Poda、Kong T. Nguyen、Hong Wu、Ludmila Dombrovski、Aiping Dong、Guillermo Senisterra、Matthieu Schapira、Cheryl H. Arrowsmith、Peter J. Brown、Rima Al-awar、Masoud Vedadi、David Smil

  DOI：10.1021/ml300467n

  日期：2013.3.14

  The WD40-repeat protein WDRS plays a critical role in maintaining the integrity of MLL complexes and fully activating their methyltransferase function. MLL complexes, the trithorax-like family of SET1 methyltransferases, catalyze trimethylation of lysine 4 on histone 3, and they have been widely implicated in various cancers. Antagonism of WDR5 and MLL subunit interaction by small molecules has recently been presented as a practical way to inhibit activity of the MLL1 complex, and N-(2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-substituted-phenyl) benzamides were reported as potent and selective antagonists of such an interaction. Here, we describe the protein crystal structure guided optimization of prototypic compound 2 (K-dis = 7 mu M), leading to identification of more potent antagonist 47 (K-dis = 0.3 mu M).
• METHODS AND COMPOUNDS FOR THE TREATMENT OF GENETIC DISEASE
  申请人：Design Therapeutics, Inc.

  公开号：US20210238226A1

  公开（公告）日：2021-08-05

  The present disclosure relates to compounds and methods for modulating the expression of dmpk, atxn1, atxn2, atxn3, cacna1a, atxn7, ppp2r2br tbp, htt, jph3r ar, or atn1 and treating diseases and conditions in which dmpk, atxn1, atxn2, atxn3, cacna1a, atxn1, ppp2r2b, tbp, htt, jph3, ar, or atn1 plays an active role. The compound can be a transcription modulator molecule having a first terminus, a second terminus, and oligomeric backbone, wherein: a) the first terminus comprises a DNA-binding moiety capable of noncovalently binding to a nucleotide repeat sequence CAG or CTG; b) the second terminus comprises a protein-binding moiety binding to a regulatory molecule that modulates an expression of a gene comprising the nucleotide repeat sequence CAG or CTG; and c) the oligomeric backbone comprising a linker between the first terminus and the second terminus.
• Structure-based design and synthesis of small molecular inhibitors disturbing the interaction of MLL1-WDR5
  作者：Dong-Dong Li、Wei-Lin Chen、Xiao-Li Xu、Fen Jiang、Lei Wang、Yi-Yue Xie、Xiao-Jin Zhang、Xiao-Ke Guo、Qi-Dong You、Hao-Peng Sun

  DOI：10.1016/j.ejmech.2016.04.032

  日期：2016.8

  WDR5-47 (IC50 = 0.3 μM) was defined as a potent small molecule to disturb the interaction of MLL1-WDR5. Here, we described structure-based design and synthesis of small molecular inhibitors to block MLL1-WDR5 PPI. Especially, compound 23 (IC50 = 104 nM) was the most potent small molecular, and about 3-times more potent than WDR5-47. We also discussed the SAR of these series of compounds with docking study

  MLL1复合物催化H3K4的甲基化，并在具有MLL融合蛋白的急性白血病的发展中起重要作用。靶向MLL1-WDR5蛋白-蛋白相互作用（PPI）以抑制MLL1复合物的组蛋白甲基转移酶的活性是治疗急性白血病的一种新策略。WDR5-47（IC 50  = 0.3μM）被定义为干扰MLL1-WDR5相互作用的强力小分子。在这里，我们描述了基于结构的设计和小分子抑制剂的合成以阻断MLL1-WDR5 PPI。尤其是，化合物23（IC 50  = 104 nM）是最有效的小分子，其效力是WDR5-47的约3倍。我们还通过对接研究讨论了这些系列化合物的SAR，这可能会刺激更有效的化合物。