含
氟氨基酸已被用作
磷酸吡ido醛(PLP)依赖性酶的基于机理的
抑制剂,并且对
氟对分子构象的影响也进行了广泛的研究和实际开发。在这项研究中,我们试图利用这些独特的特性来探测
天冬氨酸脱羧酶(ADC)酶的反应性和结合力,这是一类
丙酮酸依赖性脱羧酶的成员。由于已证明ADC活性对于结核分枝杆菌的毒力至关重要,因此以这种方式获得的信息可用于开发选择性靶向
丙酮酰依赖性酶(例如ADC)的
抑制剂,而不会影响宿主中PLP依赖性酶。为此,我们合成了大号-赤和大号-苏3- fluoroaspartate异构体并测试它们作为底物和/或所述的
抑制剂能力的结核分枝杆菌和大肠杆菌ADC酶。还使用了诱捕和基于MS的结合分析来确认两种异构体都进入了酶的活性位点。我们的研究表明,两种异构体均经过一次脱羧和
氟消除反应,生成烯胺产物,该产物可被捕获在活性位点内。有趣的是,烯胺/ ADC复杂,从形式大号-赤(但不是大号-苏)异构体足