Synthesis and Pairing Properties of 3′-Deoxyribopyranose (4′→2′)-Oligonucleotides (‘p-DNA')
作者:Damian Ackermann、Stefan Pitsch
DOI:10.1002/1522-2675(200205)85:5<1443::aid-hlca1443>3.0.co;2-u
日期:2002.5
The prepn. and the pairing properties of the new 3'-deoxyribopyranose (4'->2')-oligonucleotide (= p-DNA) pairing system, based on 3'-deoxy-b-D-ribo-pyranose nucleosides is presented. D-Xylose was efficiently converted to the prefunctionalized 3-deoxyribopyranose deriv. 4-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-3-deoxy-D-ribo-pyranose 1,2-diacetate (obtained as a 4:1 mixt. of a- and b-D-anomers). From this sugar
准备。并介绍了基于 3'-脱氧-bD-吡喃核糖核苷的新型 3'-脱氧吡喃核糖 (4'->2')-寡核苷酸 (= p-DNA) 配对系统的配对特性。D-木糖被有效地转化为预功能化的 3-脱氧吡喃核糖衍生物。4-O-[(叔丁基)二甲基甲硅烷基]-3-脱氧-D-核糖-吡喃糖 1,2-二乙酸酯(以 4:1 的 a-和 bD-端基异构体混合物形式获得)。从该糖结构单元中,制备了相应的、适当保护的胸腺嘧啶、鸟嘌呤、5-甲基胞嘧啶和嘌呤-2,6-二胺核苷亚磷酰胺。在最小的没有。的步骤。这些构建块在 DNA 合成仪上组装,在标准条件下一步脱保护后,以良好的收率获得相应的 p-DNA 寡核苷酸。条件,然后进行 HPLC 纯化。质量,p-DNA 表现出与 p-RNA 相同的配对行为,形成反平行的、专门的 Watson-Crick 配对双链体,比相应的 DNA 双链体强得多。三个相关(即,基于核糖-吡喃糖核苷)