N-(1-(3-chloropropyl)-5-((5-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl)carbamoyl)-1H-pyrrol-3-yl)-4-formamido-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide | 1442482-50-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并吡啶类
• 英文名称: N-(1-(3-chloropropyl)-5-((5-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl)carbamoyl)-1H-pyrrol-3-yl)-4-formamido-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide
• CAS: 1442482-50-9
• 化学式: C₂₅H₃₄ClN₉O₄
• 分子量: 560.056
• InChiKey: ADUVVSDGZLZCRY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.94
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  147.32
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(1-(3-chloropropyl)-5-((5-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl)carbamoyl)-1H-pyrrol-3-yl)-4-formamido-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide 在 sodium azide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以70%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  一组正交定位的二氨基、N-甲酰胺、吡咯和咪唑聚酰胺的设计、合成和 DNA 结合特性

  摘要：

  与单氨基/单阳离子对应物相比，正交定位的二氨基/双阳离子聚酰胺 (PA) 具有良好的水溶性和增强的结合亲和力，同时保留了 DNA 小沟和序列特异性。描述了以下二氨基 PA 的合成和 DNA 结合特性：fI P I ( 3a )、fI P P ( 4 )、f -P IP ( 5 ) 和 fP P P ( 6 )。磷表示1-丙基氨基连接到杂环的N1-位的位点。通过 DNase I 足迹、热变性、圆二色滴定、生物传感器表面等离子体共振 (SPR) 和等温滴定量热法 (ITC) 研究评估二氨基 PA 与 DNA 的结合。根据 SPR 研究，与单氨基类似物 f- 相比，fI P I ( 3a ) 结合更强烈 ( K eq  = 2.4 × 10 8  M -1 ) 并且与其同源序列 5'-ACGCGT-3' 具有相当的序列选择性IPI ( 1 )。fI P I ( 3a的结合) 到 5'-ACGCGT-3'

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2013.04.001
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-4-硝基-1H-咪唑-2-羧酸 在 草酰氯 、 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 54.92h， 生成 N-(1-(3-chloropropyl)-5-((5-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl)carbamoyl)-1H-pyrrol-3-yl)-4-formamido-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  一组正交定位的二氨基、N-甲酰胺、吡咯和咪唑聚酰胺的设计、合成和 DNA 结合特性

  摘要：

  与单氨基/单阳离子对应物相比，正交定位的二氨基/双阳离子聚酰胺 (PA) 具有良好的水溶性和增强的结合亲和力，同时保留了 DNA 小沟和序列特异性。描述了以下二氨基 PA 的合成和 DNA 结合特性：fI P I ( 3a )、fI P P ( 4 )、f -P IP ( 5 ) 和 fP P P ( 6 )。磷表示1-丙基氨基连接到杂环的N1-位的位点。通过 DNase I 足迹、热变性、圆二色滴定、生物传感器表面等离子体共振 (SPR) 和等温滴定量热法 (ITC) 研究评估二氨基 PA 与 DNA 的结合。根据 SPR 研究，与单氨基类似物 f- 相比，fI P I ( 3a ) 结合更强烈 ( K eq  = 2.4 × 10 8  M -1 ) 并且与其同源序列 5'-ACGCGT-3' 具有相当的序列选择性IPI ( 1 )。fI P I ( 3a的结合) 到 5'-ACGCGT-3'

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2013.04.001