5-(3-aminopropyl)cytidine | 1340586-68-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(3-aminopropyl)cytidine
• 英文别名: 4-amino-5-(3-aminopropyl)-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1340586-68-6
• 化学式: C₁₂H₂₀N₄O₅
• 分子量: 300.315
• InChiKey: IPELQPOBAGJQOM-TURQNECASA-N

物化性质

• 沸点：
  588.2±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.73±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.7
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(3-aminopropyl)cytidine 在 三乙基硅烷 、 四氯三氧化二磷 、 palladium(II) hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 DP₄A-3',5'-pCp
  参考文献：
  名称：

  Modified Nucleotides Methods and Kits

  摘要：

  修改核苷酸，以及使用可以检测它们并导致修改核苷酸的基团或标签（例如生物素）来修改核苷酸的方法，以及在定量和定性分析中使用修改核苷酸的方法。具有结构（I）的修改核苷酸化合物：（P1）（P2）-核苷（Nus）-连接基团（Alk）-连接基团（Lnk）-可观察标签（Obs）（I）。

  公开号：

  EP2669291A1
• 作为产物：
  描述：

  5-碘胞苷 在 三乙基硅烷 、 ammonium hydroxide 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 palladium hydroxide, 20 wt% on carbon 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 45.0h， 生成 5-(3-aminopropyl)cytidine
  参考文献：
  名称：

  Site-specific fluorescence labelling of RNA using bio-orthogonal reaction of trans-cyclooctene and tetrazine

  摘要：

  一种带有trans-环辛烯基团修饰的胞嘧啶三磷酸核苷类似物被通过体外转录嵌入miR-122的序列中。

  DOI：

  10.1039/c4cc02435d

文献信息

• MODIFIED NUCLEOTIDES METHODS AND KITS
  申请人：Etienne Christopher L.

  公开号：US20120252691A1

  公开（公告）日：2012-10-04

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修饰核苷酸及其修饰方法，使用含有生物素等标记的基团修饰核苷酸，使其能够被检测，从而得到修饰后的核苷酸，并且使用修饰后的核苷酸进行定量和定性分析的方法。
• MODIFIED NUCLEOTIDES
  申请人：Opperman Kay

  公开号：US20110262917A1

  公开（公告）日：2011-10-27

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸，以及使用分子或标记（如生物素）修饰核苷酸的方法，使其能够被检测并产生修改的核苷酸，以及在定量和定性分析中使用修改的核苷酸的方法。
• Modified nucleotides
  申请人：Opperman Kay

  公开号：US08536323B2

  公开（公告）日：2013-09-17

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸及其修饰方法，其中修饰物或标签（如生物素）使其可以检测，并导致修改后的核苷酸，并且使用修改后的核苷酸进行定量和定性分析的方法。
• Modified nucleotides methods and kits
  申请人：Etienne Christopher L.

  公开号：US09206216B2

  公开（公告）日：2015-12-08

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸及其修饰方法，包括使用生物素等标记或基团修饰核苷酸以便检测，从而得到修饰的核苷酸，以及利用修饰的核苷酸进行定量和定性检测的方法。
• Allele-targeted RNA interference
  申请人：UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS

  公开号：US20040214198A1

  公开（公告）日：2004-10-28

  The present invention provides siRNAs with modified bases in the antisense strand, e.g., 5-Iodo-Uridine (U(5I)), 5-Bromo-uridine (U(5Br)), or DAP, and methods for using the modified siRNAs to selectively down-regulate the expression of a mutant allele, even when the mutant mRNA differs from wild-type by only a single nucleotide.

  本发明提供了在反义链中具有修饰碱基（如 5-碘-尿苷 (U(5I))、5-溴-尿苷 (U(5Br))或 DAP）的 siRNA，以及使用修饰的 siRNA 选择性地下调突变等位基因表达的方法，即使突变 mRNA 与野生型只相差一个核苷酸。