5'-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-2',3'-O-isopropylideneadenosine-8-methyl-(8(1)->5'-N)-5'-amino-5'-deoxy-6-(hydroxymethyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine | 1256245-18-7

• 分子结构分类: 有机化合物
• 英文名称: 5'-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-2',3'-O-isopropylideneadenosine-8-methyl-(8(1)->5'-N)-5'-amino-5'-deoxy-6-(hydroxymethyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[[9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[2,3-dimethylbutan-2-yl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-6-aminopurin-8-yl]methylamino]methyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-6-(hydroxymethyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1256245-18-7
• 化学式: C₃₅H₅₄N₈O₁₀Si
• 分子量: 774.947
• InChiKey: KCCMIXVCLPFCTP-AYHBNZRKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.03
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  216
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-2',3'-O-isopropylideneadenosine-8-methyl-(8(1)->5'-N)-5'-amino-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylidene-6-{[(4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy]methyl}uridine 在 三乙基硅烷 、 二氯乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.17h， 以73%的产率得到5'-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-2',3'-O-isopropylideneadenosine-8-methyl-(8(1)->5'-N)-5'-amino-5'-deoxy-6-(hydroxymethyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和主链的寡核苷酸类似物。第26章

  摘要：

  自身互补氨基亚甲基联A * [n]的U *二核苷23 - 26通过醛的还原偶联制备10和叠氮化物8。在U * [n]的A *序列的异构体19 - 21类似地从醛制备14和叠氮化物3。C（6 / I）为23 – 26和C（8 / I）为19 – 21的取代基强烈支持顺构构象。A * [n] U *二核苷23的缔合作用比序列异构的U *更强[n] A *二核苷19。的A * [n]的U *二核苷23和24准比更强烈的类似物缺乏在C（6 / I）的取代基的，而U * [n]的A *二核苷19个联营弱于的模拟无C（8 / I）上的取代基。而23和24形式的环状双链体大多由沃森-克里克型碱基配对，25只形成线性关联。U * [n] A *二核苷19主要形成线性双链体和更高的缔合体，而21形成循环双工，显示沃森–克里克和Hoogsteen型碱基配对。氨基亚甲基连接的二核苷的环状双链体同时显示了接头的g

  DOI：

  10.1002/hlca.201000217