2'-O-{[(S)-1-(2-nitrophenyl)ethoxy]methyl}adenosine 5'-(methyl phosphate) 3'-O-{N-{[(2-nitrobenzyl)oxy]carbonyl}-D-phenylalaninate} | 312710-21-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: 2'-O-{[(S)-1-(2-nitrophenyl)ethoxy]methyl}adenosine 5'-(methyl phosphate) 3'-O-{N-{[(2-nitrobenzyl)oxy]carbonyl}-D-phenylalaninate}
• CAS: 312710-21-7
• 化学式: C₃₇H₃₉N₈O₁₅P
• 分子量: 866.735
• InChiKey: BRICXFMCSGVYGV-KYVCVVJBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.46
• 重原子数：
  61.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  303.98
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-{[(S)-1-(2-nitrophenyl)ethoxy]methyl}adenosine 5'-(methyl phosphate) 3'-O-{N-{[(2-nitrobenzyl)oxy]carbonyl}-D-phenylalaninate} 在 Tris*HCl buffer 作用下， 以 水 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 adenosine 5'-(methyl phosphate) 2'-(D-phenylalaninate) 、 adenosine 5'-(methyl phosphate) 3'-(D-phenylalaninate)
  参考文献：
  名称：

  用于合成 3'(2')-O-氨基酰化 RNA 序列的新型氟化物不稳定核碱基保护基团

  摘要：

  为了开发一种全合成氨酰化 t-RNA 和类似物的通用方法，我们描述了稳定的氨酰化 RNA 片段的合成，这些片段在连接后可能导致氨酰化 t-RNA 结构. 具有氟化物不稳定的 2'-O-[(三异丙基甲硅烷基)-氧基]甲基 (=tom) 糖保护和 N-{{2-[(三异丙基甲硅烷基)氧基]苄基}氧基}羰基 (=tboc) 碱基的新型 RNA 亚磷酰胺制备了-保护基团，以及固体支持物。具有正交（光不稳定）2'-O-[(S)-1-(2-硝基苯基)乙氧基]甲基 (=(S)-npeom) 基团的固定化 N6-tboc 保护腺苷。从这些构件中，制备了六聚体寡核糖核苷酸。通过标准下的自动合成。条件。脱离固体支撑物后，得到的完全受保护的序列用 L-苯丙氨酸衍生物氨基酰化。携带光不稳定的N-保护基团。在去除氟化物不稳定的糖和核碱基保护基团后，获得了仍然稳定的、部分用光不稳定基团保护的氨基酰化RNA序列的前体。温和条件下的光解导致

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000906)83:9<2477::aid-hlca2477>3.0.co;2-9
• 作为产物：
  描述：

  1-(1-Chloromethoxy-ethyl)-2-nitro-benzene 在 二氯乙酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 5-苄硫基四氮唑 、 二丁基二氯化锡 、 碘 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 4-吡咯烷基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 甲胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 1,2-二氯乙烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.99h， 生成 2'-O-{[(S)-1-(2-nitrophenyl)ethoxy]methyl}adenosine 5'-(methyl phosphate) 3'-O-{N-{[(2-nitrobenzyl)oxy]carbonyl}-D-phenylalaninate}
  参考文献：
  名称：

  用于合成 3'(2')-O-氨基酰化 RNA 序列的新型氟化物不稳定核碱基保护基团

  摘要：

  为了开发一种全合成氨酰化 t-RNA 和类似物的通用方法，我们描述了稳定的氨酰化 RNA 片段的合成，这些片段在连接后可能导致氨酰化 t-RNA 结构. 具有氟化物不稳定的 2'-O-[(三异丙基甲硅烷基)-氧基]甲基 (=tom) 糖保护和 N-{{2-[(三异丙基甲硅烷基)氧基]苄基}氧基}羰基 (=tboc) 碱基的新型 RNA 亚磷酰胺制备了-保护基团，以及固体支持物。具有正交（光不稳定）2'-O-[(S)-1-(2-硝基苯基)乙氧基]甲基 (=(S)-npeom) 基团的固定化 N6-tboc 保护腺苷。从这些构件中，制备了六聚体寡核糖核苷酸。通过标准下的自动合成。条件。脱离固体支撑物后，得到的完全受保护的序列用 L-苯丙氨酸衍生物氨基酰化。携带光不稳定的N-保护基团。在去除氟化物不稳定的糖和核碱基保护基团后，获得了仍然稳定的、部分用光不稳定基团保护的氨基酰化RNA序列的前体。温和条件下的光解导致

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000906)83:9<2477::aid-hlca2477>3.0.co;2-9