N⁴-benzoyl-1-trimethylsilylcytosine | 238096-55-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N⁴-benzoyl-1-trimethylsilylcytosine
• 英文别名: N-(2-((1-trimethylsilyl)oxy)pyrimidin-4-yl)benzamide；N-(2-oxo-1-trimethylsilylpyrimidin-4-yl)benzamide
• CAS: 238096-55-4
• 化学式: C₁₄H₁₇N₃O₂Si
• 分子量: 287.393
• InChiKey: XTPBUHKXEAPUTQ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.13±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.18
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  61.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-benzoyl-1-trimethylsilylcytosine 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 18.5h， 生成 N⁴-benzoyl-1-[5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2,3-dideoxy-2,3-didehydro-2-fluoro-4-thio-β-D-ribofuranosyl]cytosine
  参考文献：
  名称：

  D-2'，3'-didehydro-2'，3'-dideoxy-2'-fluoro-4'-thionucleosides的立体选择性合成和抗病毒活性。

  摘要：

  由于2'，3'-didehydro-2'，3'-dideoxy-2'-氟核苷对HIV-1和HBV表现出令人感兴趣的抗病毒作用，因此，合成等位取代的4'-硫代核苷令人感兴趣。 4'-氧被硫原子取代。为了研究结构活性关系，从关键中间体（2R，4S）-1-O-乙酰-5-O-（叔丁基二苯基甲硅烷基）-2,3-二脱氧-2-氟-合成了各种嘧啶和嘌呤核苷。由2，3-O-异亚丙基-D-甘油醛1以13个步骤制备2-苯基硒基-4-硫代-β-D-呋喃呋喃糖苷8。在人外周血单核（PBM）细胞中评估了合成化合物对HIV-1的抗病毒活性，其中包括胞苷17、5-氟胞苷18，腺苷24，和2-氟腺苷32显示中等至有效的抗HIV活性（分别为EC（50）1.3、11.6、8.1和1.2 microM）。值得注意的是，2-氟腺苷类似物32显示出抗病毒效力以及高细胞毒性（对于PBM，CEM和Vero，IC（50）分别为1.5、1.1和7

  DOI：

  10.1021/jm020246+
• 作为产物：
  描述：

  N4-苯甲酰基胞嘧啶 、 lithium hexamethyldisilazane 在 ammonium sulfate 作用下， 生成 N⁴-benzoyl-1-trimethylsilylcytosine
  参考文献：
  名称：

  Tetrofuranose nucleoside phosphonic acids: Synthesis and properties

  摘要：

  描述了新的等电子、非同构的磷酸酯类核苷酸5'-磷酸的类似物，其磷酸基直接连接在糖环的C4'位置。这些类似物是通过从四氧杂环磷酸酯合成物和硅化的核碱基进行核苷化反应合成的。制备了具有D-和L-系列中erythro和threo构型的嘧啶化合物，并通过核磁共振谱学确定了它们的结构。核磁共振构象研究的结果显示，所有计算的构象体现出典型的核苷酸范围内的最大皱曲。在所有化合物中，S-型构象体更受青睐，并在α-D-threo-化合物中更为显著。对胸苷磷酸酶抑制的研究表明，所制备的磷酸类化合物之一是该酶的竞争性抑制剂（K_i = 4 μM）。

  DOI：

  10.1135/cccc2011038

文献信息

• Synthesis and Anti-HCV Activities of 4′-Fluoro-2′-Substituted Uridine Triphosphates and Nucleotide Prodrugs: Discovery of 4′-Fluoro-2′-<i>C</i>-methyluridine 5′-Phosphoramidate Prodrug (<b>AL-335</b>) for the Treatment of Hepatitis C Infection
  作者：Guangyi Wang、Natalia Dyatkina、Marija Prhavc、Caroline Williams、Vladimir Serebryany、Yujian Hu、Yongfei Huang、Jinqiao Wan、Xiangyang Wu、Jerome Deval、Amy Fung、Zhinan Jin、Hua Tan、Kenneth Shaw、Hyunsoon Kang、Qingling Zhang、Yuen Tam、Antitsa Stoycheva、Andreas Jekle、David B. Smith、Leonid Beigelman

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00143

  日期：2019.5.9

  We report the synthesis and biological evaluation of a series of 4'-fluoro-2'- C-substituted uridines. Triphosphates of the uridine analogues exhibited a potent inhibition of hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase with IC50 values as low as 27 nM. In an HCV subgenomic replicon assay, the phosphoramidate prodrugs of these uridine analogues demonstrated a very potent activity with EC50 values as low

  我们报告了一系列 4'-fluoro-2'- C-取代尿苷的合成和生物学评价。尿苷类似物的三磷酸盐表现出对丙型肝炎病毒 (HCV) NS5B 聚合酶的有效抑制作用，IC50 值低至 27 nM。在 HCV 亚基因组复制子测定中，这些尿苷类似物的氨基磷酸酯前药表现出非常有效的活性，EC50 值低至 20 nM。先导化合物 AL-335 (53) 在体外单次口服剂量后，在人原代肝细胞和 Huh-7 细胞以及狗肝脏中表现出高水平的三磷酸核苷。化合物 53 被选择用于临床开发，在 1 期和 2 期试验中显示出有希望的结果。
• Synthesis of novel 3′-C-methyl-apionucleosides: an asymmetric construction of a quaternary carbon by Claisen rearrangement
  作者：Joon H. Hong、Mu-Yun Gao、Yongseok Choi、Yung-Chi Cheng、Raymond F. Schinazi、Chung K. Chu

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)00005-7

  日期：2000.8

  The synthesis of 2,3-dideoxy-3-C-(hydroxymethyl)-3-C-methyl-D-glycero-tetrofuranosyl++ + nucleosides was accomplished in high enatiomeric purity (98.5% ee) via [3,3]-sigmatropic Claisen rearrangement of (E)(S)-5-benzyloxy-1-tert-butyldimethylsilanyloxy-4-methyl-pent-3- en-2-ol prepared from 2,3-O-isopropylidene-D-glyceraldehyde. The synthesized nucleosides were assayed against human immunodeficiency

  2,3-二脱氧-3-C-（羟甲基）-3-C-甲基-D-甘油-呋喃呋喃糖基++ +核苷的合成是通过[3,3]-σ克莱森体系以高对映体纯度（98.5％ee）完成。由2，3-O-异亚丙基-D-甘油醛制得的（E）（S）-5-苄氧基-1-叔丁基二甲基甲硅烷基氧基-4-甲基-戊-3-烯-2-醇的重排。分别在人外周血单核细胞（PBM）和2.2.15细胞中检测合成的核苷抗人免疫缺陷病毒（HIV）和乙型肝炎病毒。6-氨基-9- [2,3-二脱氧-3-C-（羟甲基）-3-C-甲基-β-D-甘油-四呋喃糖基] -2-氟嘌呤显示出中等的抗病毒活性（EC50 = 2.55 microM） HIV-1菌株和6-氨基-9- [3-脱氧-3-C-（羟甲基）-3-甲基-α-D-甘油-呋喃呋喃糖基] -2-氟嘌呤表现出有效的抗HIV活性（EC50 = 0。
• Ex-Chiral-Pool Synthesis of β-Hydroxyphosphonate Nucleoside Analogues
  作者：Franck Gallier、Suzanne Peyrottes、Christian Périgaud

  DOI：10.1002/ejoc.200600562

  日期：2007.2

  A new series of mononucleotide analogues bearing a nonhydrolysable P–C bond instead of the P–O phosphate linkage is presented. We intend to set up an approach that allows the synthesis of β-hydroxyphosphonate nucleoside analogues as a single diastereoisomer. In this respect, the key “sugar-phosphonate” intermediate was obtained through an Arbusov reaction from an iodosugar derivative in which the stereochemistry

  介绍了一系列带有不可水解的 P-C 键而不是 P-O 磷酸键的单核苷酸类似物。我们打算建立一种方法，允许将 β-羟基膦酸酯核苷类似物合成为单一的非对映异构体。在这方面，关键的“糖-膦酸酯”中间体是通过阿布索夫反应从碘糖衍生物获得的，其中 β-羟基的立体化学由起始材料的选择决定，并保留在所得的核苷酸类似物中。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)
• Structure−Activity Relationships of 2‘-Fluoro-2‘,3‘-unsaturated <scp>d</scp>-Nucleosides as Anti-HIV-1 Agents
  作者：Kyeong Lee、Yongseok Choi、Giuseppe Gumina、Wen Zhou、Raymond F. Schinazi、Chung K. Chu

  DOI：10.1021/jm010418n

  日期：2002.3.1

  We studied the structure-activity relationships of a series of 2'-fluoro-2',3'-unsaturated D-nucleosides against HIV-1 in human peripheral blood mononuclear (PBM) cells. The target compounds 10-21 and 28-33 were prepared by N-glycosylation of the acetate 4, which was readily prepared from 2,3-O-isopropylidene-D-glyceraldehyde in five steps. Among the newly synthesized nucleosides, 2-amino-6-chloropurine

  我们研究了人类外周血单核（PBM）细胞中一系列针对HIV-1的2'-氟-2'，3'-不饱和D-核苷的构效关系。通过乙酸酯4的N-糖基化制备目标化合物10-21和28-33，乙酸酯4容易地由2，3-O-异亚丙基-D-甘油醛分五个步骤制备。在新合成的核苷中，有2-氨基-6-氯嘌呤（11），腺嘌呤（14），肌苷（16），鸟嘌呤（18），2,6-二氨基嘌呤（20）和5-氟胞嘧啶（30）衍生物。发现具有EC（50）值分别为4.3、0.44、1.0、2.6、3.0和0.82 microM的有趣的抗HIV活性。还检查了有关拉米夫定耐药变体（M184V）对标题核苷的耐药性的影响，
• Synthesis and properties of 2′-O,4′-C-Ethylene-Bridged nucleic acids (ENA) as effective antisense oligonucleotides
  作者：Koji Morita、Miho Takagi、Chikako Hasegawa、Masakatsu Kaneko、Shinya Tsutsumi、Junko Sone、Tomio Ishikawa、Takeshi Imanishi、Makoto Koizumi

  DOI：10.1016/s0968-0896(03)00115-9

  日期：2003.5

  bridged nucleic acids (2',4'-BNA) or locked nucleic acids (LNA). Both the 2'-O,4'-C-ethylene- and propylene-linkage within these nucleosides restrict the sugar puckering to the N-conformation of RNA as do 2',4'-BNA/LNA. Furthermore, ethylene-bridged nucleic acids (ENA) having 2'-O,4'-C-ethylene nucleosides had considerably increased the affinity to complementary RNA, and were as high as that of 2',4'-BNA/LNA

  合成了新型双环核苷，2'-O，4'-C-乙烯核苷和2'-O，4'-C-丙烯核苷，作为反义寡核苷酸的构建基块，以进一步优化2'-O，4'-桥连核酸（2'，4'-BNA）或锁定核酸（LNA）的C-亚甲基键。这些核苷中的2'-O，4'-C-乙烯-和丙烯键都将糖的褶皱限制为RNA的N-构象，就像2'，4'-BNA / LNA一样。此外，具有2'-O，4'-C-乙烯核苷的乙烯桥连核酸（ENA）大大提高了对互补RNA的亲和力，并且与2'，4'-BNA / LNA（DeltaT （m）＝ + 3，每次修改约5摄氏度。另一方面，添加2'-O，4' 寡核苷酸中的-C-丙烯修饰导致与互补RNA的亲和力降低。至于对核酸酶的稳定性，在寡核苷酸中掺入一个2'-O，4'-C-乙烯或一个2'-O，4'-C-丙烯核苷可显着提高其对核酸外切酶的抗性至大于2'的程度。 ，4'-BNA / LNA。这些结果表明ENA比2'，4'-BNA