4-[(R)-2’,3’-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino]-1’-oxopropyl]aminobenzoic acid | 1332927-79-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-[(R)-2’,3’-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino]-1’-oxopropyl]aminobenzoic acid
• 英文别名: 4-[(R)-2′,3′-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino]-1′-oxopropyl]aminobenzoic acid；4-[(R)-2',3'-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino]-1'-oxopropyl]aminobenzoic acid
• CAS: 1332927-79-3
• 化学式: C₃₄H₅₃N₃O₁₁
• 分子量: 679.808
• InChiKey: WPNFDAODHKCUDL-XMMPIXPASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.66
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  178.08
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[(R)-2’,3’-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino]-1’-oxopropyl]aminobenzoic acid 、 在 N,N-二异丙基乙胺 、 4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 12.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用核糖核酸验证的分子动力学模拟对高甘露糖型寡糖显示糖基决定簇的构象分析

  摘要：

  动态糖适应性：柔性寡糖的动态视图补充了晶体学数据。通过NMR数据验证的分子模拟显示了三触角十二糖的动态构象集合，其末端葡萄糖残基为分子伴侣识别的决定簇。我们的发现表明了一种诱导拟合机制，分子伴侣通过该机制适应其靶标的糖基触角。

  DOI：

  10.1002/cbic.201600595
• 作为产物：
  描述：

  (R)-2,3-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino] propionic acid 、 对氨基苯甲酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 17.0h， 以35%的产率得到4-[(R)-2’,3’-bis[di(tert-butoxycarbonylmethyl)amino]-1’-oxopropyl]aminobenzoic acid
  参考文献：
  名称：

  N-连接寡糖的NMR构象分析的顺磁性镧系元素标记

  摘要：

  甜蜜的测量：顺磁性标签被提议作为碳水化合物构象NMR分析的新工具。可以将新设计的镧系元素螯合标签附着到所有N-连接的寡糖之间共享的常见二糖核心上（见图），从而提供有关糖苷键构象的可靠信息。这一成功为各种具有生物学意义的糖链的构象研究打开了大门。

  DOI：

  10.1002/chem.201100856

文献信息

• Exploration of Conformational Spaces of High-Mannose-Type Oligosaccharides by an NMR-Validated Simulation
  作者：Takumi Yamaguchi、Yoshitake Sakae、Ying Zhang、Sayoko Yamamoto、Yuko Okamoto、Koichi Kato

  DOI：10.1002/anie.201406145

  日期：2014.10.6

  oligosaccharides, which harbor intracellular glycoprotein‐fate determinants in their triantennary structures. The experimentally validated REMD simulation provided quantitative views of the dynamic conformational ensembles of the complicated, branched oligosaccharides, and indicated significant expansion of the conformational space upon removal of a terminal mannose residue during the functional glycan‐processing

  探索柔性生物大分子的构象空间对于定量了解其分子识别过程的能量学至关重要。我们将稳定的同位素和镧系元素辅助NMR方法与复制-交换分子动力学（REMD）模拟结合使用，获得了对高甘露糖型寡糖构象动力学的原子描述，该构象动力学在其三触角结构中包含细胞内糖蛋白命运决定因素。 。经过实验验证的REMD模拟提供了复杂的分支寡糖动态构象集合的定量视图，并表明在功能性聚糖加工途径中去除末端甘露糖残基后构象空间显着扩展。