β-内酰胺环代表有价值的部分,可以诱导
抑制剂与其靶标共价结合。在这项研究中,我们探索了具有β-内酰胺亲电战斗部的二肽和三肽作为登革热和西尼罗河病毒NS2B-
NS3蛋白酶的
抑制剂。具有(3S)-β-内酰胺部分的三肽显示出最高的活性,在生化和
细胞分析中IC50和
EC50值在较低的微摩尔范围内。对登革热
蛋白酶的活性通常高于对西尼罗河病毒
蛋白酶的活性。该化合物对脱靶凝血酶和胰
蛋白酶无活性。
液相色谱-质谱实验表明,三肽-β-内酰胺
抑制剂以两种不同的结合方式与
蛋白酶结合。只有一种结合模式会导致共价但可逆的 β-内酰胺环与催化
丝氨酸相互作用,随后释放具有打开的β-内酰胺环的
抑制剂。其他结合方式导致肽主链的裂解。该观察结果提供了第一个实验证据,表明黄病毒蛋白酶抑制剂中的苄氧基苯基甘
氨酸位于酶的主要位点。