cyclo[2-aminoisobutyryl-(S)-phenylalanyl-(R)-prolyl-(S)-2-aminosuberoyl-] | 104849-05-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo[2-aminoisobutyryl-(S)-phenylalanyl-(R)-prolyl-(S)-2-aminosuberoyl-]
• 英文别名: cyclo(-L-Asu-Aib-L-Phe-D-Pro-)；cyclo[Aib-Phe-D-Pro-Asu]；6-[(3S,9S,12R)-3-benzyl-6,6-dimethyl-2,5,8,11-tetraoxo-1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.3.0]pentadecan-9-yl]hexanoic acid
• CAS: 104849-05-0
• 化学式: C₂₆H₃₆N₄O₆
• 分子量: 500.595
• InChiKey: XIOIUSOXTCDCSK-SLFFLAALSA-N

物化性质

• 沸点：
  869.8±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.27±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  145
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclo[2-aminoisobutyryl-(S)-phenylalanyl-(R)-prolyl-(S)-2-aminosuberoyl-] 在 盐酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 11.0h， 以5 mg的产率得到(S)-2-氨基辛二酸
  参考文献：
  名称：

  Diheteropeptin, a Novel Substance with TGF-.BETA.-like Activity, Produced by a Fungus, Diheterospora chlamydosporia. II. Physico-chemical Properties and Structure Elucidation.

  摘要：

  通过核磁共振、质谱和化学研究，确定了 Diheterospora chlamydosporia Q58044 中的一种 TGF-β-like 活性物质 diheteropeptin (1) 的结构，它是一种新的环四肽，即环[2-氨基异丁酰-(S)-苯丙氨酰-(R)-丙氨酰-(2S, 8R, 9R)-2-amino-8, 9-dihydroxydecanoyl-]。

  DOI：

  10.7164/antibiotics.53.793
• 作为产物：
  描述：

  D-脯氨酸,1-[N-[N-[2-氨基-8-(1,1-二甲基乙氧基)-1,8-二羰基辛基]-2-甲基丙氨酰]-L-苯基丙氨酰]-,(S)-,单乙酸酯 在 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 65.0h， 生成 cyclo[2-aminoisobutyryl-(S)-phenylalanyl-(R)-prolyl-(S)-2-aminosuberoyl-]
  参考文献：
  名称：

  细胞抑制药和抗有丝分裂剂衣藻多菌素和HC毒素的类似物：氯甲基酮和重氮甲基酮官能化的环状四肽的合成和生物活性。

  摘要：

  据报道，有四种细胞抑制和抗有丝分裂剂衣藻多菌素和HC-毒素的新型类似物的合成和生物学活性，其中天然产物的反应性环氧酮侧链部分被氯甲基或重氮甲基酮官能团取代，但各自的12 -元环四肽环系统被保留。在每种情况下，线性四肽序列的合成都是通过常规方法实现的，并进行了设计，以使环化作用在脯氨酸上。使用适当保护的L-2-氨基磺酸（Asu）可以在环化后容易地同化所需的氯甲基和重氮甲基酮官能团。通过使用双（2-氧代-3-恶唑烷基）次膦酰氯（BOP-Cl）完成环化。环状产品的产量与或 在HC-毒素环系统的情况下，比以前报道的要好。Asu侧链酸的释放以及通过混合酸酐转化为重氮甲基酮并用HCl淬灭以生成氯甲基酮的方式可达到所需的官能度，HC-毒素类似物的收率极高，而衣藻多菌素的收率仅中等类似物。发现HC毒素氯甲基酮（IC50 = 30-40 ng / mL）和衣原体氯甲基酮（IC50 = 3-10 ng / m

  DOI：

  10.1021/jm00384a013

文献信息

• Chlamydocin–hydroxamic acid analogues as histone deacetylase inhibitors
  作者：Norikazu Nishino、Binoy Jose、Ryuzo Shinta、Tamaki Kato、Yasuhiko Komatsu、Minoru Yoshida

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.08.041

  日期：2004.11

  Chlamydocin-hydroxamic acid analogues were designed and synthesized as histone deacetylase (HDAC) inhibitors based on the structure and HDAC inhibitory activity of chlamydocin and trichostatin A. Chlamydocin is a cyclic tetrapeptide containing an epoxyketone moiety in the side chain that makes it an irreversible inhibitor of HDAC. We replaced the epoxyketone moiety of chlamydocin with hydroxamic acid to

  根据衣原霉素和曲古抑菌素A的结构和HDAC抑制活性，设计并合成了衣原霉素-异羟肟酸类似物作为组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。衣原霉素是环状四肽，在侧链中含有环氧酮部分，使其成为不可逆抑制剂。 HDAC。我们用异羟肟酸代替了衣原体的环氧酮部分，以设计有效且可逆的HDAC抑制剂。另外，对于一系列衣藻多菌素类似物系列，引入了许多氨基-环烷羧酸（Acc）而不是简单的氨基-异丁酸（Aib）。测试了所合成的化合物的HDAC抑制活性，结果表明其中许多是HDAC的有效抑制剂。用芳香族氨基酸代替衣原体的Aib残基增强了体内和体外的抑制活性。我们已经对衣原霉素-异羟肟酸类似物进行了圆二色性和分子模拟研究，并将其与衣原霉素的溶液结构进行了比较。
• CYCLIC PEPTIDES WITH AN ANTI-PARASITIC ACTIVITY
  申请人：Wong Yung-Sing

  公开号：US20120034593A1

  公开（公告）日：2012-02-09

  The present invention relates to a method for preparing a cyclic peptide with antiparasite activity and anticancer activity. The invention also relates to this peptide as an antiparasite agent, for example in the treatment of toxoplasmosis and as an anticancer agent. The invention also relates to the use of this cyclic peptide for treating organs ex vivo before transplantation.

  本发明涉及一种制备具有抗寄生虫活性和抗癌活性的环肽的方法。该发明还涉及将该肽作为抗寄生虫剂，例如在弓形虫病的治疗中以及作为抗癌剂的用途。该发明还涉及将该环肽用于移植前体外处理器官的用途。
• Divergent Access to Histone Deacetylase Inhibitory Cyclopeptides via a Late-Stage Cyclopropane Ring Cleavage Strategy. Short Synthesis of Chlamydocin
  作者：Gábor Zoltán Elek、Kaur Koppel、Dzmitry M. Zubrytski、Nele Konrad、Ivar Järving、Margus Lopp、Dzmitry G. Kananovich

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b03305

  日期：2019.10.18

  The efficacy of the proposed diversity-oriented approach has been validated by short stereoselective synthesis of natural product chlamydocin, containing a challenging-to-install fragment of (2S,9S)-2-amino-8-oxo-9,10-epoxydecanoic acid (Aoe) and a range of its analogues, derivatives of 2-amino-8-oxodecanoic and 2-aminosuberic acids.

  基于通过在通用的多能环丙醇前体中裂解环丙烷环的裂解来安装多个锌结合功能的后期安装，提出了一种访问组蛋白脱乙酰基酶抑制肽的统一的步骤经济策略。通过短立体选择性合成天然产物衣藻多菌素，证实了所提出的面向多样性的方法的功效，该产物含有（2 S，9 S）-2-氨基-8-氧代-9,10-的具有挑战性的安装片段环氧癸酸（Aoe）及其一系列类似物，2-氨基-8-氧十二烷酸和2-氨基丁二酸的衍生物。
• Evaluation of functional groups on amino acids in cyclic tetrapeptides in histone deacetylase inhibition
  作者：Md. Shahidul Islam、Mohammed P. I. Bhuiyan、Md. Nurul Islam、Tienabe Kipassa Nsiama、Naoto Oishi、Tamaki Kato、Norikazu Nishino、Akihiro Ito、Minoru Yoshida

  DOI：10.1007/s00726-011-0947-6

  日期：2012.6

  The naturally occurring cyclic tetrapeptide, chlamydocin, originally isolated from fungus , consists of alpha-aminoisobutyric acid, -phenylalanine, -proline and an unusual amino acid ()-2-amino-8-(()-oxiran-2-yl)-8-oxooctanoic acid (Aoe) and inhibits the histone deacetylases (HDACs), a class of regulatory enzymes. The epoxyketone moiety of Aoe is the key functional group for inhibition. The cyclic tetrapeptide scaffold is supposed to play important role for effective binding to the surface of enzymes. In place of the epoxyketone group, hydroxamic acid and sulfhydryl group have been applied to design inhibitor ligands to zinc atom in catalytic site of HDACs. In the research for more potent HDAC inhibitors, we replaced the epoxyketone moiety of Aoe with different functional groups and synthesized a series of chlamydocin analogs as HDAC inhibitors. Among the functional groups, methoxymethylketone moiety showed as potent inhibition as the hydroxamic acid. On the contrary, we confirmed that borate, trifruoromethylketone, and 2-aminoanilide are almost inactive in HDAC inhibition.
• US9133237B2
  申请人：——

  公开号：US9133237B2

  公开（公告）日：2015-09-15