(S)-4-[2-(anthracen-9-ylmethoxy)ethyl]-2,2-dimethyl-1,3-dioxolane | 548430-92-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 蒽
• 英文名称: (S)-4-[2-(anthracen-9-ylmethoxy)ethyl]-2,2-dimethyl-1,3-dioxolane
• 英文别名: (4S)-4-[2-(anthracen-9-ylmethoxy)ethyl]-2,2-dimethyl-1,3-dioxolane
• CAS: 548430-92-8
• 化学式: C₂₂H₂₄O₃
• 分子量: 336.431
• InChiKey: ONUURDACBBMDRW-SFHVURJKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  27.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-4-[2-(anthracen-9-ylmethoxy)ethyl]-2,2-dimethyl-1,3-dioxolane 在 溶剂黄146 作用下， 以100%的产率得到(S)-4-(anthracen-9-ylmethoxy)-butane-1,2-diol
  参考文献：
  名称：

  嵌入核酸：接头长度和嵌入剂类型对其双链稳定性的影响

  摘要：

  合成了六个嵌入核酸的新实例，以评估寡核苷酸和嵌入剂之间的接头长度对其相应双链体和三链体的热稳定性的依赖性。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。††由丹麦国家研究基金会资助的一个研究中心，用于研究核酸化学生物学。

  DOI：

  10.1081/ncn-120027829
• 作为产物：
  描述：

  (S)-4-(2-羟乙基)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊环 、 9-氯甲基蒽 在 氢氧化钾 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 24.0h， 以90%的产率得到(S)-4-[2-(anthracen-9-ylmethoxy)ethyl]-2,2-dimethyl-1,3-dioxolane
  参考文献：
  名称：

  嵌入核酸：接头长度和嵌入剂类型对其双链稳定性的影响

  摘要：

  合成了六个嵌入核酸的新实例，以评估寡核苷酸和嵌入剂之间的接头长度对其相应双链体和三链体的热稳定性的依赖性。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。††由丹麦国家研究基金会资助的一个研究中心，用于研究核酸化学生物学。

  DOI：

  10.1081/ncn-120027829

文献信息

• PSEUDONUCLEOTIDE COMPRISING AN INTERCALATOR
  申请人：Christensen Ulf Bech

  公开号：US20100121056A1

  公开（公告）日：2010-05-13

  The present invention relates to intercalator pseudonucleotides. Intercalator pseudonucleotides according to the invention are capable of being incorporated into the backbone of a nucleic acid or nucleic acid analogue and they comprise an intercalator comprising a flat conjugated system capable of co-stacking with nucleobases of DNA. The invention also relates to oligonucleotides or oligonucleotide analogues comprising at least one intercalator pseudo nucleotide. The invention furthermore relates to methods of synthesising intercalator pseudo nucleotides and methods of synthesising oligonucleotides or oligonucleotide analogues comprising at least one intercalator pseudonucleotide. In addition, the invention describes methods of separating sequence specific DNA(s) from a mixture comprising nucleic acids, methods of detecting a sequence specific DNA (target DNA) in a mixture comprising nucleic acids and/or nucleic acid analogues and methods of detecting a sequence specific RNA in a mixture comprising nucleic acids and/or nucleic acid analogues. In particular said methods may involve the use of oligonucleotides comprising intercalator pseudo nucleotides. The invention furthermore relates to pairs of oligonucleotides or oligonucleotide analogues capable of hybridising to one another, wherein said pairs comprise at least one intercalator pseudonucleotide. Methods for inhibiting a DNAse and/or a RNAse and methods of modulating transcription of one or more specific genes are also described.

  本发明涉及插入剂伪核苷酸。本发明的插入剂伪核苷酸能够被合并到核酸或核酸类似物的骨架中，并且它们包括一个插入剂，该插入剂包含一个平面共轭系统，能够与DNA的碱基共堆叠。本发明还涉及至少包括一个插入剂伪核苷酸的寡核苷酸或寡核苷酸类似物。此外，本发明还涉及合成插入剂伪核苷酸的方法以及合成至少包括一个插入剂伪核苷酸的寡核苷酸或寡核苷酸类似物的方法。此外，本发明还描述了从包括核酸的混合物中分离序列特异性DNA的方法，检测包括核酸和/或核酸类似物的混合物中的序列特异性DNA（目标DNA）的方法，以及检测包括核酸和/或核酸类似物的混合物中的序列特异性RNA的方法。特别是所述方法可能涉及使用包括插入剂伪核苷酸的寡核苷酸。本发明还涉及能够杂交到一起的寡核苷酸或寡核苷酸类似物的配对，其中所述配对包括至少一个插入剂伪核苷酸。还描述了抑制DNA酶和/或RNA酶的方法以及调节一个或多个特定基因的转录的方法。
• Intercalating Nucleic Acids: The Influence of Linker Length and Intercalator Type on Their Duplex Stabilities
  作者：Ulf B. Christensen、Michael Wamberg、Farag A. G. El‐Essawy、Abd El‐Hamid Ismail、Christina B. Nielsen、Vyacheslav V. Filichev、Carsten H. Jessen、Michael Petersen、Erik B. Pedersen

  DOI：10.1081/ncn-120027829

  日期：2004.1.1

  examples of intercalating nucleic acids were synthesized in order to evaluate the dependence of the length of the linker between oligo and intercalator on the thermal stability of their corresponding duplexes and triplexes. †In honour and celebration of the 70th birthday of Professor Leroy B. Townsend. ††A research center funded by The National Danish Research Foundation for studies on nucleic acid chemical

  合成了六个嵌入核酸的新实例，以评估寡核苷酸和嵌入剂之间的接头长度对其相应双链体和三链体的热稳定性的依赖性。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。††由丹麦国家研究基金会资助的一个研究中心，用于研究核酸化学生物学。