tert-butyl (S)-3-(2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)propyl)-1H-indole-1-carboxylate | 1197868-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: tert-butyl (S)-3-(2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)propyl)-1H-indole-1-carboxylate
• CAS: 1197868-61-3
• 化学式: C₄₀H₄₁N₃O₆
• 分子量: 659.782
• InChiKey: XYVBQPDZSQISRQ-LJAQVGFWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.21
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  107.89
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (S)-3-(2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)propyl)-1H-indole-1-carboxylate 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  从常见的 γ-AApeptide 构建模块快速获取多类肽模拟物

  摘要：

  在此，我们报告了一种高效的新方法，用于制备理论上能够包含任何功能的 γ-AApeptides；该方法使用一些常见的 N-alloc γ-AApeptide 构建模块。更重要的是，使用相同的方法，也可以很容易地生成带有新型骨架支架的新类肽模拟物。我们的结果不仅证明了这种新合成方法的多功能性，而且强调了由此产生的新型肽模拟物在未来可能会发现离散的生物医学/生物材料应用的可能性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201301841
• 作为产物：
  描述：

  在 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 tert-butyl (S)-3-(2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)propyl)-1H-indole-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  γ-AApeptides: design, synthesis and evaluation

  摘要：

  一种新型肽类似物被称为“γ-AA肽”，已被描述。γ-AA肽的设计和合成，以及其对p53/MDM2相互作用的潜在生物活性得到了证明。研究还发现，γ-AA肽对蛋白酶降解具有高度抗性。开发特定序列的γ-AA肽可能会引领一系列具有新框架的肽类模拟物，有助于药物发现或肽/蛋白的模仿。

  DOI：

  10.1039/c0nj00943a

文献信息

• α-Helix-Mimicking Sulfono-γ-AApeptide Inhibitors for p53–MDM2/MDMX Protein–Protein Interactions
  作者：Peng Sang、Yan Shi、Junhao Lu、Lihong Chen、Leixiang Yang、Wade Borcherds、Sami Abdulkadir、Qi Li、Gary Daughdrill、Jiandong Chen、Jianfeng Cai

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00993

  日期：2020.2.13

  for the inhibition of protein-protein interactions (PPIs). Herein, we demonstrate that sulfono-γ-AApeptides can be rationally designed to mimic the p53 α-helix and inhibit p53-MDM2 PPIs. The best inhibitor, with Kd and IC50 values of 26 nM and 0.891 μM toward MDM2, respectively, is among the most potent unnatural peptidomimetic inhibitors disrupting the p53-MDM2/MDMX interaction. Using fluorescence polarization

  拟肽支架的使用是抑制蛋白相互作用的一种有前途的策略。在本文中，我们证明了可以合理设计磺基-γ-AA肽以模仿p53α-螺旋并抑制p53-MDM2 PPI。最好的抑制剂对MDM2的Kd和IC50值分别为26 nM和0.891μM，是破坏p53-MDM2 / MDMX相互作用的最有效的非天然拟肽抑制剂之一。使用荧光偏振分析，圆二色性，核磁共振波谱和计算模拟，我们证明了磺基-γ-AA肽采用类似于p53的螺旋结构，并通过结合到MDM2的疏水缝隙竞争性抑制p53-MDM2相互作用。有趣的是 通过增强p53转录活性并诱导MDM2和p21的表达，吻合的磺酰基-γ-AA肽显示出有希望的细胞活性。此外，磺基-γ-AA肽对蛋白水解表现出显着的抗性，从而增强了它们的生物学潜力。我们的结果表明，磺基-γ-AA肽是一类新型的破坏PPI的非天然螺旋折叠剂。
• Rational Design of Right-Handed Heterogeneous Peptidomimetics as Inhibitors of Protein–Protein Interactions
  作者：Yan Shi、Peng Sang、Junhao Lu、Pirada Higbee、Lihong Chen、Leixiang Yang、Timothy Odom、Gary Daughdrill、Jiandong Chen、Jianfeng Cai

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01638

  日期：2020.11.12

  Peptidomimetics have gained great attention for their function as protein-protein interaction (PPI) inhibitors. Herein, we report the design and investigation of a series of right-handed helical heterogeneous 1:1 alpha/Sulfono-gamma-AA peptides as unprecedented inhibitors for p53-MDM2 and p53-MDMX. The most potent helical heterogeneous 1:1 alpha/Sulfono-gamma-AA peptides were shown to bind tightly to MDM2 and MDMX, with K-d of 19.3 and 66.8 nM, respectively. Circular dichroism spectra, 2D-NMR spectroscopy, and the computational simulations suggested that these helical sulfono-gamma-AA peptides could mimic the critical side chains of p53 and disrupt p53/MDM2 PPI effectively. It was noted that these 1:1 alpha/Sulfono-gamma-AA peptides were completely resistant to proteolytic degradation, boosting their potential for biomedical applications. Furthermore, effective cellular activity is achieved by the stapled 1:1 alpha/Sulfono-gamma-AA peptides, evidenced by significantly enhanced p53 transcriptional activity and much more induced level of MDM2 and p21. The 1:1 alpha/Sulfono-gamma-AA peptides could be an alternative strategy to antagonize a myriad of PPIs.