methyl (3S)-3-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-methoxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]-3-aminopropanoate;2,2,2-trifluoroacetic acid | 758711-30-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (3S)-3-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-methoxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]-3-aminopropanoate;2,2,2-trifluoroacetic acid
• CAS: 758711-30-7
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₁₂H₂₁NO₆
• 分子量: 389.326
• InChiKey: WBKPYNQIGOBRCA-HWCJFCIXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (3S)-3-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-methoxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]-3-aminopropanoate;2,2,2-trifluoroacetic acid 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 methyl (3S)-3-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-methoxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]-3-[[2-[[(3S)-3-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-methoxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]-3-[[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]acetyl]amino]propanoyl]amino]acetyl]amino]propanoate
  参考文献：
  名称：

  α/β-肽的设计：三残基转角基序和非手性甘氨酸对螺旋和转角的影响的研究

  摘要：

  新颖的三残基螺旋-转角二级结构，在N末端由一个螺旋形核，在肽生成具有“β-Caa-大号-Ala-大号-Ala，”“β-Caa-大号-Ala-γ- Caa'和'β-Caa- L -Ala -δ-Caa'（其中β - Caa是C-连接的碳-β-氨基酸，γ - Caa是C-连接的碳-γ-氨基酸，而δ -Caa是C末端的C-连接的碳δ-氨基酸）。这些转弯结构通过NH（i）/ CO（i +2）（i +2是肽中的最后一个残基）之间的12元，14元和15元（mr）氢键来稳定（i +2是肽中的最后一个残基） CO（i）/ NH（i）之间的mr氢键+2）。此外，设计了一系列α/β-肽，并用交替的甘氨酸（Gly）和（S）-β-Caa合成，以研究非手性α残基对螺旋结构和螺旋结构的影响。与以前的结果相反，C末端的三个“β-α-β”残基（α-残基为Gly）仅通过13-mr的正向氢键（类似于一个α-转角）来稳定。进行

  DOI：

  10.1002/asia.201000438
• 作为产物：
  描述：

  三氟乙酸 、 methyl (3S)-3-[(tert-butoxy)carbonylamino]-3-[6-methoxy-2,2-dimethyl-(3aR,6S,6aR)-tetrahydrofuro-[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]propanoate 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 methyl (3S)-3-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-methoxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]-3-aminopropanoate;2,2,2-trifluoroacetic acid
  参考文献：
  名称：

  α/β-肽的设计：三残基转角基序和非手性甘氨酸对螺旋和转角的影响的研究

  摘要：

  新颖的三残基螺旋-转角二级结构，在N末端由一个螺旋形核，在肽生成具有“β-Caa-大号-Ala-大号-Ala，”“β-Caa-大号-Ala-γ- Caa'和'β-Caa- L -Ala -δ-Caa'（其中β - Caa是C-连接的碳-β-氨基酸，γ - Caa是C-连接的碳-γ-氨基酸，而δ -Caa是C末端的C-连接的碳δ-氨基酸）。这些转弯结构通过NH（i）/ CO（i +2）（i +2是肽中的最后一个残基）之间的12元，14元和15元（mr）氢键来稳定（i +2是肽中的最后一个残基） CO（i）/ NH（i）之间的mr氢键+2）。此外，设计了一系列α/β-肽，并用交替的甘氨酸（Gly）和（S）-β-Caa合成，以研究非手性α残基对螺旋结构和螺旋结构的影响。与以前的结果相反，C末端的三个“β-α-β”残基（α-残基为Gly）仅通过13-mr的正向氢键（类似于一个α-转角）来稳定。进行

  DOI：

  10.1002/asia.201000438

文献信息

• Design and Synthesis of Diastereomeric β³-Peptides from (<i>R</i>,<i>R</i>)/(<i>S</i>,<i>S</i>)-APyC and (<i>R</i>)/(<i>S</i>)-β³-Caa: Determination of Enantiomeric Handedness
  作者：Gangavaram V. M. Sharma、Hajari Ravindranath、Akkala Bhaskar、Katukuri Sirisha、Kallaganti V. S. Ramakrishna、Akella V. S. Sarma

  DOI：10.1002/ejoc.201501053

  日期：2016.1

  We have previously reported enantiomeric α/β- and β-peptides derived from aminopyrancarboxylic acids (APyCs). We now report the synthesis of diastereomeric β-peptides synthesized from alternating (R,R)/(S,S)-APyCs and C-linked carbo β3-amino acids [(R)/(S)-β3-Caas] and their conformational analysis. Extensive studies of these peptides revealed the presence of enantiomeric helical structures, that is

  我们之前曾报道过衍生自氨基吡喃羧酸 (APyCs) 的对映体 α/β- 和 β-肽。我们现在报告了由交替的 (R,R)/(S,S)-APyCs 和 C-linkedcarbo β3-氨基酸 [(R)/(S)-β3-Caas] 合成的非对映体 β-肽的合成及其构象分析。对这些肽的广泛研究揭示了对映体螺旋结构的存在，即左旋和右旋 12/10 螺旋，它们通过吡喃氧原子和随后的酰胺质子之间的五元静电相互作用很好地稳定。因此，该研究表明，无论肽的性质如何，APyC 单体都会影响螺旋旋向性的结果，如 NMR、CD 和分子动力学 (MD) 分析所确定的那样。
• Ring Closing and Macrocyclization of β-Dipeptides by Olefin Metathesis
  作者：Basker Sundararaju、Tailor Sridhar、Mathieu Achard、Gangavaram V. M. Sharma、Christian Bruneau

  DOI：10.1002/ejoc.201300608

  日期：2013.10

  β-Dipeptides containing allyl groups at different positions on the peptide backbone were prepared. Ring-closing metathesis of these β-dipeptides with the use of a ruthenium catalyst led to medium-sized cyclic β-dipeptides and macrocyclic tetrapeptides, depending on the nature of the allylic substitution on the β-dipeptides.

  制备在肽骨架不同位置含有烯丙基的β-二肽。使用钌催化剂对这些 β-二肽进行闭环复分解产生中等大小的环状 β-二肽和大环四肽，这取决于 β-二肽上烯丙基取代的性质。
• Hybrid Helices: Motifs for Secondary Structure Scaffolds in Foldamers
  作者：Gangavaram V. M. Sharma、Nagula Chandramouli、Madavi Choudhary、Pendem Nagendar、Kallaganti V. S. Ramakrishna、Ajit C. Kunwar、Peter Schramm、Hans-Jörg Hofmann

  DOI：10.1021/ja907074u

  日期：2009.12.2

  The concept of "hybrid helices" as a new motif for foldamers is presented. Hybrid helices can be realized by a combination of two or more different types of homologous and hybrid peptides, for example, beta-peptides and alpha/beta- and alpha/gamma-hybrid peptides, within the same oligomer. The different helix types of the various peptide foldamer classes are maintained and form a regular helix along the sequence of the oligomer. The transition from one helix type to another was found to be rather smooth with high compatibility of the different helix types. Such hybrid helices represent novel motifs of secondary structure scaffolds. They open up the possibility to change the direction of helix propagation in a subtle manner. Hybrid helices enrich the arsenal of defined foldamer structures for a structural and functional mimicry of native peptides and proteins.