Lysine-Reactive <i>N</i>-Acyl-<i>N</i>-aryl Sulfonamide Warheads: Improved Reaction Properties and Application in the Covalent Inhibition of an Ibrutinib-Resistant BTK Mutant
serum-containing medium, because of its high intrinsic reactivity. In this study, we sought to modify the structure of the NASA warhead and found that N-acyl-N-aryl sulfonamides (ArNASAs) are promising electrophiles for use in a lysine-targeted covalent inhibition strategy. We prepared a focused library of ArNASA derivatives with diverse structures and reactivity and identified several warhead candidates with
靶蛋白的共价抑制在药物发现领域受到广泛关注。目前大多数共价药物利用半胱氨酸对适度亲电子试剂的高反应性。然而,越来越需要能够靶向赖氨酸残基的弹头,以扩大共价药物蛋白的范围,并处理对半胱氨酸靶向共价药物具有抗性突变的新兴蛋白。我们最近开发了N-酰基-N-烷基磺酰胺 (NASA) 作为赖氨酸靶向亲电子试剂。尽管其成功应用,但这种 NASA 弹头由于其高内在反应性,在生理环境(例如含血清介质)中不稳定。在这项研究中,我们试图修改 NASA 弹头的结构,并发现N-酰基-N-芳基磺酰胺 (ArNASA) 是有前途的亲电子试剂,可用于赖氨酸靶向共价抑制策略。我们制备了一个具有不同结构和反应性的 ArNASA 衍生物的重点库,并鉴定了几种候选弹头,它们具有抑制水解介导的失活和减少与脱靶蛋白的非特异性反应,而不牺牲对目标的反应性。这些反应特性使得能够在血清存在的情况下改善细胞内热休克蛋白 90 (HSP90)