methyl 2-(quinoline-2-carboxamido)acetate | 170488-10-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl 2-(quinoline-2-carboxamido)acetate
• 英文别名: N-(quinoline-2-carbonyl)-glycine-methyl ester；N-(Chinolin-2-carbonyl)-glycin-methylester；Methyl 2-(quinoline-2-carbonylamino)acetate
• CAS: 170488-10-5
• 化学式: C₁₃H₁₂N₂O₃
• mdl: MFCD10663124
• 分子量: 244.25
• InChiKey: FWWHIKKZDJYHNA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.153
• 拓扑面积：
  68.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-(quinoline-2-carboxamido)acetate 在 盐酸 、 水 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 1.0h， 以54.4 mg的产率得到2-(喹啉-2-羰基氨基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  片段对接和连接以发现十文字组蛋白去甲基化酶抑制剂

  摘要：

  抑制 Jumonji 去甲基酶的工具分子的开发可以用于研究癌症相关的转录。虽然 2,4-吡啶二甲酸 (2,4-PDCA) 等支架是有效的抑制剂，但它们的选择性有限。为了发现 KDM4 去甲基酶（几种癌症中过度表达的酶）的新抑制剂，我们将包含 600 000 个片段的文库对接到 KDM4A 的高分辨率结构中。最有趣的化学型是 5-氨基水杨酸盐​​，它以两个不同但重叠的方向对接。对接姿势为共价连接片段化合物的设计提供了信息，并进一步衍生化。这种组合方法将亲和力提高了约 3 个对数级，得到化合物35 ( K = 43 nM)。几种杂合抑制剂对 KDM4C 的选择性高于相关酶 FIH、KDM2A 和 KDM6B，但对 KDM3 和 KDM5 亚家族缺乏选择性。共晶结构证实了对接预测。这项研究将基于结构的对接的使用从片段发现扩展到片段连接优化，产生了新型 KDM4 抑制剂。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01527
• 作为产物：
  描述：

  喹醛酰氯 在 氢氧化钾 、 氯仿 、 硫酸 作用下， 生成 methyl 2-(quinoline-2-carboxamido)acetate
  参考文献：
  名称：

  Meyer; Graf, Biochemische Zeitschrift, 1930, vol. 229, p. 154,156

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Dynamic Combinatorial Mass Spectrometry Leads to Inhibitors of a 2-Oxoglutarate-Dependent Nucleic Acid Demethylase
  作者：Esther C. Y. Woon、Marina Demetriades、Eleanor A. L. Bagg、WeiShen Aik、Svetlana M. Krylova、Jerome H. Y. Ma、MunChiang Chan、Louise J. Walport、David W. Wegman、Kevin N. Dack、Michael A. McDonough、Sergey N. Krylov、Christopher J. Schofield

  DOI：10.1021/jm201417e

  日期：2012.3.8

  2-Oxoglutarate-dependent nucleic acid demethylases are of biological interest because of their roles in nucleic acid repair and modification. Although some of these enzymes are linked to physiology, their regulatory roles are unclear. Hence, there is a desire to develop selective inhibitors for them; we report studies on AlkB, which reveal it as being amenable to selective inhibition by small molecules. Dynamic combinatorial chemistry linked to mass spectrometric analyses (DCMS) led to the identification of lead compounds, one of which was analyzed by crystallography. Subsequent structure-guided studies led to the identification of inhibitors of improved potency, some of which were shown to be selective over two other 2OG oxygenases. The work further validates the use of the DCMS method and will help to enable the development of inhibitors of nucleic acid modifying 2OG oxygenases both for use as functional probes and, in the longer term, for potential therapeutic use.
• Docking and Linking of Fragments To Discover Jumonji Histone Demethylase Inhibitors
  作者：Magdalena Korczynska、Daniel D. Le、Noah Younger、Elisabet Gregori-Puigjané、Anthony Tumber、Tobias Krojer、Srikannathasan Velupillai、Carina Gileadi、Radosław P. Nowak、Eriko Iwasa、Samuel B. Pollock、Idelisse Ortiz Torres、Udo Oppermann、Brian K. Shoichet、Danica Galonić Fujimori

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.5b01527

  日期：2016.2.25

  Development of tool molecules that inhibit Jumonji demethylases allows for the investigation of cancer-associated transcription. While scaffolds such as 2,4-pyridinedicarboxylic acid (2,4-PDCA) are potent inhibitors, they exhibit limited selectivity. To discover new inhibitors for the KDM4 demethylases, enzymes overexpressed in several cancers, we docked a library of 600 000 fragments into the high-resolution

  抑制 Jumonji 去甲基酶的工具分子的开发可以用于研究癌症相关的转录。虽然 2,4-吡啶二甲酸 (2,4-PDCA) 等支架是有效的抑制剂，但它们的选择性有限。为了发现 KDM4 去甲基酶（几种癌症中过度表达的酶）的新抑制剂，我们将包含 600 000 个片段的文库对接到 KDM4A 的高分辨率结构中。最有趣的化学型是 5-氨基水杨酸盐​​，它以两个不同但重叠的方向对接。对接姿势为共价连接片段化合物的设计提供了信息，并进一步衍生化。这种组合方法将亲和力提高了约 3 个对数级，得到化合物35 ( K = 43 nM)。几种杂合抑制剂对 KDM4C 的选择性高于相关酶 FIH、KDM2A 和 KDM6B，但对 KDM3 和 KDM5 亚家族缺乏选择性。共晶结构证实了对接预测。这项研究将基于结构的对接的使用从片段发现扩展到片段连接优化，产生了新型 KDM4 抑制剂。
• Meyer; Graf, Biochemische Zeitschrift, 1930, vol. 229, p. 154,156
  作者：Meyer、Graf

  DOI：——

  日期：——