1-ethynyl-5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazole | 1206196-96-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 1-ethynyl-5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazole
• 英文别名: 1-Ethynyl-5,6-dimethylbenzimidazole
• CAS: 1206196-96-4
• 化学式: C₁₁H₁₀N₂
• 分子量: 170.214
• InChiKey: UUDFISUWKMUWFW-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  325.0±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.02±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  17.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-ethynyl-5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazole 在 氘代甲醇 作用下， 以100 %的产率得到1-(ethynyl-d)-5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazole
  参考文献：
  名称：

  Cu(OAc)2 催化叠氮化物-Ynamine (3 + 2) 环加成反应的机理基础

  摘要：

  铜催化的叠氮化物-炔环加成 (CuAAC) 反应在整个化学和生物科学中用作连接工具。尽管 CuAAC 很普遍，但仍需要开发更有效的方法来形成低 Cu 负载量的 1,4-三唑连接产物。在本文中，我们公开了乙酸铜(II)催化的炔胺-叠氮化物(3 + 2)环加成反应的机理模型。使用多核核磁共振波谱、电子顺磁共振波谱和高效液相色谱分析，确定了双催化循环。首先，通过末端炔胺的 Glaser-Hay 偶联形成二炔物质，形成能够催化炔胺-叠氮化物 (3 + 2) 环加成的 Cu(I) 物质。其次，ynamine结构的苯并咪唑单元具有多种作用：协助C-H活化、Cu配位以及在(3+2)环加成完成后形成反应后静息态Cu络合物。最后，通过添加同位素标记的炔胺和叠氮化物底物形成标记的 1,4-三唑产物，显示了 Cu 静息态复合物的重新激活。这项工作为使用混合价双核催化铜物种与铜配位炔烃结合使用以在 CuAAC 反

  DOI：

  10.1021/jacs.4c03348
• 作为产物：
  描述：

  5,6-dimethyl-1-((triisopropylsilyl)ethynyl)-1H-benzo[d]imidazole 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.5h， 以88%的产率得到1-ethynyl-5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazole
  参考文献：
  名称：

  确定CuAAC反应中与速率无关的化学选择性的起源：速率确定步骤中炔烃的特定位移

  摘要：

  我们报告了铜催化的叠氮化物-炔烃点击（CuAAC）反应中炔烃依赖性化学选择性的动力学和光谱分析。对六种炔烃亚型的研究表明，芳香族乙胺类的速率决定步骤（RDS）从乙炔形成转变为叠氮化物的连接/迁移插入事件，从而实现了与总速率无关的化学选择性。

  DOI：

  10.1002/anie.201612288

文献信息

• Glutathione Mediates Control of Dual Differential Bio‐orthogonal Labelling of Biomolecules
  作者：Frederik Peschke、Andrea Taladriz‐Sender、Matthew J. Andrews、Allan J. B. Watson、Glenn A. Burley

  DOI：10.1002/anie.202313063

  日期：2023.12.11

  Traditional approaches to bio‐orthogonal reaction discovery have focused on developing reagent pairs that react with each other faster than they are metabolically degraded. Glutathione (GSH) is typically responsible for the deactivation of most bio‐orthogonal reagents. Here we demonstrate that GSH promotes a Cu‐catalysed (3+2) cycloaddition reaction between an ynamine and an azide. We show that GSH acts as a redox modulator to control the Cu oxidation state in these cycloadditions. Rate enhancement of this reaction is specific for ynamine substrates and is tuneable by the Cu:GSH ratio. This unique GSH‐mediated reactivity gradient is then utilised in the dual sequential bio‐orthogonal labelling of peptides and oligonucleotides via two distinct chemoselective (3+2) cycloadditions.

  摘要发现生物正交反应的传统方法侧重于开发能以比新陈代谢降解更快的速度相互反应的试剂对。谷胱甘肽（GSH）通常会导致大多数生物正交试剂失活。在这里，我们证明 GSH 可促进铜催化的(3+2)环加成反应。我们发现 GSH 可作为氧化还原调节剂，在这些环加成反应中控制铜的氧化态。该反应的速率增强对ynamine底物具有特异性，并可通过Cu:GSH比例进行调节。这种由 GSH 介导的独特反应梯度随后被用于通过两种不同的化学选择性（3+2）环化反应对肽和寡核苷酸进行双序列生物正交标记。
• Cu-Catalyzed N<i>-</i>Alkynylation of Imidazoles, Benzimidazoles, Indazoles, and Pyrazoles Using PEG as Solvent Medium
  作者：Glenn A. Burley、David L. Davies、Gerry A. Griffith、Michael Lee、Kuldip Singh

  DOI：10.1021/jo902466f

  日期：2010.2.5

  A facile and efficient Cu(I)-catalyzed cross-coupling method is reported for the preparation of N-alkynyl or N-bromoalkenyl heteroarenes from bromoalkynes. Generally superior yields and functional group tolerance were obtained with microwave (MW) irradiation using imidazole, benzimidazole, pyrazole, and indazole substrates and poly(ethylene glycol) 400 (PEG400) as an additive. We speculate that PEG400 acts as both a Cu(I)-stabilizing ligand as well as a phase transfer solvent.
• CYCLOADDITION REACTIONS
  申请人：[en]UNIVERSITY OF STRATHCLYDE

  公开号：WO2023247966A1

  公开（公告）日：2023-12-28

  The present disclosure relates to copper-catalysed cycloaddition reactions. In particular, the use of copper-catalysed cycloaddition reactions in bioconjugation reactions, e.g. bioconjugation reactions involving the use of an ynamine as a substrate. The methods and reactants disclosed herein may find particular application in bioconjugation reactions involving biomolecules such as peptides and oligonucleotides.