H-bAla(3S-BuNH2)-bLeu(R)-bLys(S)-bAla(3S-EtO2H)-bLeu(R)-D-Asp(1)-ol.N(1)bAla(3S-Bn(4-OH))-OH | 1359144-18-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: H-bAla(3S-BuNH2)-bLeu(R)-bLys(S)-bAla(3S-EtO2H)-bLeu(R)-D-Asp(1)-ol.N(1)bAla(3S-Bn(4-OH))-OH
• 英文别名: (3R)-3-[[(3S)-6-amino-3-[[(3R)-3-[[(3S)-3,7-diaminoheptanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]amino]-5-[[(3R)-1-[[(2R)-4-[[(2S)-1-carboxy-3-(4-hydroxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-hydroxy-4-oxobutan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-3-yl]amino]-5-oxopentanoic acid
• CAS: 1359144-18-5
• 化学式: C₄₄H₇₅N₉O₁₂
• 分子量: 922.133
• InChiKey: KFVWOWRXALYEAZ-DDWCTGGPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.8
• 重原子数：
  65
• 可旋转键数：
  34
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  368
• 氢给体数：
  13
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-缬氨酸 、 Boc-β3Tyr(tBu)-OH 、 Boc-β3Lys(Alloc)-OH 、 FMOC-O-叔丁基-L-丝氨酸 、 Fmoc-L-天冬氨酸 4-烯丙酯 、 N2-Fmoc-N5-烯丙氧基羰基-L-鸟氨酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 、 哌啶 作用下， 以 二氯甲烷 、 N-甲基吡咯烷酮 、 甲醇 为溶剂， 反应 21.0h， 以39%的产率得到H-bAla(3S-BuNH2)-bLeu(R)-bLys(S)-bAla(3S-EtO2H)-bLeu(R)-D-Asp(1)-ol.N(1)bAla(3S-Bn(4-OH))-OH
  参考文献：
  名称：

  Positional screening and NMR structure determination of side-chain-to-side-chain cyclized β³-peptides

  摘要：

  许多β-肽在有机溶剂中折叠成14 螺旋二级结构，但在水中形成类似的14 螺旋需要额外的稳定元素。特别是短β-肽在水溶液中的14 螺旋稳定性至关重要，因为掺入稳定元素的自由度有限。在这里，我们展示了连接两个β-氨基酸侧链的单个内酰胺桥如何在水中产生短β3-肽的高14螺旋特征。使用 CD 和 NMR 光谱和结构计算进行的比较研究揭示了侧链到侧链环化的强大 14 螺旋诱导能力及其在 β3 肽支架上相对于 pH 和离子强度的最佳位置影响。内酰胺桥理想地结合在β3 肽的N 末端区域，在那里它限制了肽主链的构象灵活性。内酰胺桥在甲醇和水中诱导出类似程度的 14 螺旋构象。基于所提出的内酰胺桥β3 肽的第一个高分辨率NMR 3D 结构，折叠显示出很大程度的高有序性，无论是在主链还是在侧链中，导致高度紧凑和稳定的折叠结构。

  DOI：

  10.1039/c1ob06422c

文献信息

• Positional screening and NMR structure determination of side-chain-to-side-chain cyclized β³-peptides
  作者：Esther Vaz、Sonja A. Dames、Matthias Geyer、Luc Brunsveld

  DOI：10.1039/c1ob06422c

  日期：——

  Many β-peptides fold in a 14-helical secondary structure in organic solvents, but similar 14-helix formation in water requires additional stabilizing elements. Especially the 14-helix stabilization of short β-peptides in aqueous solution is critical, due to the limited freedom for incorporating stabilizing elements. Here we show how a single lactam bridge, connecting two β-amino acid side-chains, can lead to high 14-helix character in short β3-peptides in water. A comparative study, using CD and NMR spectroscopy and structure calculations, revealed the strong 14-helix inducing power of a side-chain-to-side-chain cyclization and its optimal position on the β3-peptide scaffold with respect to pH and ionic strength effects. The lactam bridge is ideally incorporated in the N-terminal region of the β3-peptide, where it limits the conformational flexibility of the peptide backbone. The lactam bridge induces a 14-helical conformation in methanol and water to a similar extent. Based on the presented first high resolution NMR 3D structure of a lactam bridged β3-peptide, the fold shows a large degree of high order, both in the backbone and in the side-chains, leading to a highly compact and stable folded structure.

  许多β-肽在有机溶剂中折叠成14 螺旋二级结构，但在水中形成类似的14 螺旋需要额外的稳定元素。特别是短β-肽在水溶液中的14 螺旋稳定性至关重要，因为掺入稳定元素的自由度有限。在这里，我们展示了连接两个β-氨基酸侧链的单个内酰胺桥如何在水中产生短β3-肽的高14螺旋特征。使用 CD 和 NMR 光谱和结构计算进行的比较研究揭示了侧链到侧链环化的强大 14 螺旋诱导能力及其在 β3 肽支架上相对于 pH 和离子强度的最佳位置影响。内酰胺桥理想地结合在β3 肽的N 末端区域，在那里它限制了肽主链的构象灵活性。内酰胺桥在甲醇和水中诱导出类似程度的 14 螺旋构象。基于所提出的内酰胺桥β3 肽的第一个高分辨率NMR 3D 结构，折叠显示出很大程度的高有序性，无论是在主链还是在侧链中，导致高度紧凑和稳定的折叠结构。