2'-2H1-cytidine | 380883-63-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-2H1-cytidine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3-deuterio-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 380883-63-6
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₅
• 分子量: 244.211
• InChiKey: UHDGCWIWMRVCDJ-FUDJUWGOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-2H1-cytidine 在 hexahistidine tagged-human deoxycytidine kinase 、 L-1,4-二硫代苏糖醇 、 5’-三磷酸腺苷 作用下， 反应 0.17h， 以100%的产率得到[2'-2H]-CMP
  参考文献：
  名称：

  Zipse, Hendrik; Artin, Erin; Wnuk, Stanislaw, Journal of the American Chemical Society, 2009, vol. 131, p. 200 - 211

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-(4-toluoyl)-α/β-D-ribofuranose-2-2H1 在 三甲基氯硅烷 、 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 2'-2H1-cytidine
  参考文献：
  名称：

  [2'- 2 H 1 ]-核糖核苷的合成

  摘要：

  的新合成Ç（2'） -氘代核糖核苷由3,5-二-起始要么已经完成ø -苄基-1- ø甲基α，β -D-呋喃核糖（1B）或2,3- ø -异亚丙基-D-核糖（14），在两种情况下掺入的D> 97原子％。前者适合于核糖呋喃糖部分的多位氘化或13 C / 2 H多重双标记的要求，而后者特别适合于单位2 H标记的酶反应机理研究。

  DOI：

  10.1002/hlca.200490069

文献信息

• SYNTHETIC STUDIES TO IMPROVE THE DEUTERIUM LABELLING IN NUCLEOSIDES FOR FACILITATING STRUCTURAL STUDIES OF LARGE RNAS BY HIGH-FIELD NMR SPECTROSCOPY
  作者：Mrinal K. Kundu、Anna Trifonova、Zoltán Dinya、András Földesi、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1081/ncn-100002549

  日期：2001.3.31

  Synthetic studies to prepare ribonucleosides deuterated at C2′ and the application of the developed procedures for the synthesis of 2 H 5 -ribonucleosides from 1,2-O-isopropylidene-3-O-benzyl-ribofuranose-3,4,5,5′- 2 H 4 have been reported.

  制备在C2'氘代的核糖核苷的合成研究以及已开发的程序从1,2-O-异亚丙基-3-O-苄基-呋喃核糖-3,4,5,5'合成2 H 5-核糖核苷的应用-报告了2 H 4。