5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine | 725735-79-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
• CAS: 725735-79-5
• 化学式: C₄₁H₃₈N₂O₈S
• 分子量: 718.827
• InChiKey: UUVFEQZENFDSOA-HKIDPNTFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.37±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.53
• 重原子数：
  52.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  129.08
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine 在 吡啶 、 lithium hydroxide 、 2-氯-1,3,2-苯并二氧磷杂环己烷-4-酮 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.92h， 生成
  参考文献：
  名称：

  C-5 Modified Nucleosides: Direct Insertion of Alkynyl-Thio Functionality in Pyrimidines

  摘要：

  A route is presented to append, in a single step, alkynyl thioesters to the 5-position of a pyrimidine ring of a nucleoside that is unprotected. These products should be useful to support in vitro selection experiments with functionalized DNA.

  DOI：

  10.1081/ncn-120022030
• 作为产物：
  描述：

  在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 氟化氢吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
  参考文献：
  名称：

  链内锁增加了双链体的稳定性和碱基配对的选择性。

  摘要：

  在相邻核苷碱基之间具有二硫键的寡脱氧核苷酸探针显示，RNA双链的双链体的熔点升高，最高可达7.6摄氏度。通过自动合成，弱配对的TT二聚体被锁定的2'-脱氧-5-（硫代炔基）尿苷残基取代。

  DOI：

  10.1039/c1cc14008f