N-(1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-ylacetyl)glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinylglycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-N-(2-((2-ethoxy-2-oxoethyl)[(2-oxo-2H-chromen-3-yl)acetyl]amino)ethyl)-L-cysteinamide | 1309665-85-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-ylacetyl)glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinylglycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-N-(2-((2-ethoxy-2-oxoethyl)[(2-oxo-2H-chromen-3-yl)acetyl]amino)ethyl)-L-cysteinamide
• CAS: 1309665-85-7
• 化学式: C₄₇H₆₄N₁₄O₁₄S₂
• 分子量: 1113.24
• InChiKey: XZUHRILEAXMUSH-HEVIKAOCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.25
• 重原子数：
  77.0
• 可旋转键数：
  26.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  393.09
• 氢给体数：
  12.0
• 氢受体数：
  20.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-((4,7,10-tris[(tert-butoxy)carbonyl]-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetyl)-glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinylglycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-N-(2-((2-ethoxy-2-oxoethyl)[(2-oxo-2H-chromen-3-yl)acetyl]amino)ethyl)-L-cysteinamide 在 盐酸 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以70%的产率得到N-(1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-ylacetyl)glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinylglycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-N-(2-((2-ethoxy-2-oxoethyl)[(2-oxo-2H-chromen-3-yl)acetyl]amino)ethyl)-L-cysteinamide
  参考文献：
  名称：

  新型 PNA 结合 Cyclen 复合物的合成、DNA 结合和切割研究

  摘要：

  已经合成并表征了一种新型的附加香豆素的 PNA 结合循环衍生物配体 C1 及其铜 (II) 复合物 C2。这些化合物与 DNA 的相互作用通过吸收、荧光和粘度滴定以及 DNA 熔化和凝胶电泳实验进行了系统研究。DNA熔解和粘度滴定实验表明，C1的结合方式为沟结合，C2为多重结合方式，包括沟结合和静电结合。从吸收滴定数据，我们可以说 CT DNA 和两种化合物之间的主要相互作用可能是核碱基之间的 H 键。荧光研究表明，C1 与 d(A)9 的结合能力是其他寡脱氧核苷酸的两倍或三倍。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000084