methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate | 1402555-55-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate
• 英文别名: Methyl 6-[[3-[2-[(2-chloroacetyl)amino]ethylcarbamoyloxy]-3-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)propyl]-methylamino]-6-oxohexanoate；methyl 6-[[3-[2-[(2-chloroacetyl)amino]ethylcarbamoyloxy]-3-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)propyl]-methylamino]-6-oxohexanoate
• CAS: 1402555-55-8
• 化学式: C₂₄H₃₅ClN₄O₁₀
• 分子量: 575.016
• InChiKey: PUMIMCZYTDVXBG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  178
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以16.7 mg的产率得到1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oic acid
  参考文献：
  名称：

  环笼 Morpholinos：胚胎基因功能的构象门控探针

  摘要：

  感觉有点笼统：基于吗啉代的反义试剂已通过寡核苷酸环化（见方案）被笼子笼罩，从而能够对斑马鱼胚胎和幼虫中的基因表达进行光控制。使用这些试剂，已经检查了发育中的胰腺中外分泌细胞命运承诺的时间。

  DOI：

  10.1002/anie.201201690
• 作为产物：
  描述：

  甲基脂肪酰氯 在 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.33h， 生成 methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate
  参考文献：
  名称：

  环笼 Morpholinos：胚胎基因功能的构象门控探针

  摘要：

  感觉有点笼统：基于吗啉代的反义试剂已通过寡核苷酸环化（见方案）被笼子笼罩，从而能够对斑马鱼胚胎和幼虫中的基因表达进行光控制。使用这些试剂，已经检查了发育中的胰腺中外分泌细胞命运承诺的时间。

  DOI：

  10.1002/anie.201201690

文献信息

• CYCLIZING LINKER AND CYCLIC CAGED MORPHOLINOS
  申请人：CHEN JAMES K.

  公开号：US20130066059A1

  公开（公告）日：2013-03-14

  A bifunctional and photocleavable linker for cyclizing a morpholino-based oligonucleotide, having the formula: with the Linker as a photoactive group derivatized spacer molecule that presents two functional groups for cyclizing a selected morpholino and with the R group as a photoactive group utilized in the process of photocleavage and the X and Z groups are functional groups utilized for attachment to a morpholino to generate a cyclic structure.

  一种用于环化基于吗啡诺的寡核苷酸的双功能光解链联剂，具有以下公式：其中链联剂作为一个光活性基团衍生的间隔分子，呈现两个功能基团以环化所选的吗啡诺，R基团作为在光解过程中使用的光活性基团，X和Z基团是用于连接到吗啡诺以生成环状结构的功能基团。
• Optical Control of MicroRNA Function in Zebrafish Embryos
  作者：Wes Brown、Anirban Bardhan、Kristie Darrah、Michael Tsang、Alexander Deiters

  DOI：10.1021/jacs.2c04479

  日期：2022.9.21