(3S)-3-dihydronarbonolide | 81095-54-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酯类和类似物
• 英文名称: (3S)-3-dihydronarbonolide
• 英文别名: 3,6-dihydronarbonolide；3-hydroxy-narbonolide；(3R,4S,5R,6S,7S,9R,11E,13R,14R)-14-ethyl-4,6-dihydroxy-3,5,7,9,13-pentamethyl-1-oxacyclotetradec-11-ene-2,10-dione
• CAS: 81095-54-7
• 化学式: C₂₀H₃₄O₅
• 分子量: 354.487
• InChiKey: PMIAESMLUKERGJ-KJTGHOLMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  83.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3S)-3-dihydronarbonolide 在 tris(triphenylphosphine)ruthenium(II) chloride 作用下， 以 苯 为溶剂， 生成 narbonolide 、 Oxacyclotetradec-11-ene-2,6,10-trione,14-ethyl-4-hydroxy-3,5,7,9,13-pentamethyl-,(3R,4S,5S,7S,9R,11E,13R,14R)-
  参考文献：
  名称：

  Macrolide synthesis: narbonolide

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00347a061
• 作为产物：
  描述：

  在 2-乙烯基吡啶 、 sodium metabisulfite 、 glucose-6-phosphate dehydrogenase 、 D-半乳糖-6-磷酸 、 erythromycin thioesterase modified erythromycin module 6 、 NADP+ 、 维生素 C 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 20.0h， 以12.6%的产率得到(3S)-3-dihydronarbonolide
  参考文献：
  名称：

  通过杂化聚酮化合物合成酶探索选择性并创造结构多样性

  摘要：

  摘要工程化聚酮合酶 (PKS) 来产生新的代谢物需要了解底物处理过程中的催化失效点。越来越多的证据表明硫酯酶 (TE) 结构域是工程化 PKS 系统中的一个重要瓶颈。我们创建了一系列带有来自异源途径的交换 TE 结构域的混合 PKS 模块，并用天然和非天然聚酮化合物底物对它们进行挑战。野生型 PKS 模块与非天然底物配对的反应主要导致预期大环内酯的转化率较低。同样，带有非同源 TE 结构域的天然底物和混合 PKS 模块的产物形成也大大减少。相比之下，非天然底物被大多数含有底物兼容 TE 的混合模块转化，直接暗示该结构域作为主要的催化守门人，并强调其作为蛋白质工程目标的价值，以改善 PKS 途径中的模拟生产。

  DOI：

  10.1002/ange.202004991

文献信息

• Formal Total Synthesis of the Polyketide Macrolactone Narbonolide
  作者：Lakshmanan Venkatraman、Courtney C. Aldrich、David H. Sherman、Robert A. Fecik

  DOI：10.1021/jo050924a

  日期：2005.9.1

  An improved synthesis of (3S)-3-dihydronarbonolide is reported that constitutes a formal total synthesis of the 14-membered macrolactone antibiotic narbonolide. The key step was an intramolecular Nozaki−Hiyama−Kishi coupling to accomplish macrocyclization in improved yield. The high level of convergence will also allow us to rapidly synthesize narbonolide analogues for the study of enzymes in the pikromycin

  据报道，改进的（3S）-3-二氢那波内酯的合成构成了十四元大内酯类抗生素那波内酯的正式全合成。关键步骤是分子内的Nozaki-Hiyama-Kishi偶联，以提高产量实现大环化。高水平的融合也将使我们能够快速合成narbonolide类似物，以研究吡咯霉素生物合成途径中的酶。
• Synthesis and Biochemical Analysis of Complex Chain-Elongation Intermediates for Interrogation of Molecular Specificity in the Erythromycin and Pikromycin Polyketide Synthases
  作者：Jonathan D. Mortison、Jeffrey D. Kittendorf、David H. Sherman

  DOI：10.1021/ja9060596

  日期：2009.11.4

  The 6-deoxyerythronolide B synthase (DEBS) and pikromycin (Pik) polyketide synthase (PKS) are unique multifunctional enzyme systems that are responsible for the biosynthesis of the erythromycin and pikromycin 14-membered ring aglycones, respectively. Together, these natural product biosynthetic systems provide excellent platforms to examine the fundamental structural and catalytic elements that govern polyketide assembly, processing, and macrocyclization. In these studies, the native pentaketide intermediate for DEBS was synthesized and employed for in vitro chemoenzymatic synthesis of macrolactone products in engineered monomodules Ery5, Ery5-TE, and Ery6. A comparative analysis was performed with the corresponding Pik module 5 (PikAIII) and module 6 (PikAIV), dissecting key similarities and differences between these highly related PKSs. The data revealed that individual modules in the DEBS and Pik PKSs possess distinctive molecular selectivity profiles and suggest that substrate recognition has evolved unique characteristics in each system.
• COMBINATORIAL POLYKETIDE LIBRARIES PRODUCED USING A MODULAR PKS GENE CLUSTER AS SCAFFOLD
  申请人：Kosan Biosciences

  公开号：EP0979286B1

  公开（公告）日：2014-01-29
• Macrolide synthesis: narbonolide
  作者：Tatsuo Kaiho、Satoru Masamune、Tatsuo Toyoda

  DOI：10.1021/jo00347a061

  日期：1982.4
• Probing Selectivity and Creating Structural Diversity Through Hybrid Polyketide Synthases
  作者：Aaron A. Koch、Jennifer J. Schmidt、Andrew N. Lowell、Douglas A. Hansen、Katherine M. Coburn、Joseph A. Chemler、David H. Sherman

  DOI：10.1002/ange.202004991

  日期：2020.8.3

  AbstractEngineering polyketide synthases (PKS) to produce new metabolites requires an understanding of catalytic points of failure during substrate processing. Growing evidence indicates the thioesterase (TE) domain as a significant bottleneck within engineered PKS systems. We created a series of hybrid PKS modules bearing exchanged TE domains from heterologous pathways and challenged them with both

  摘要工程化聚酮合酶 (PKS) 来产生新的代谢物需要了解底物处理过程中的催化失效点。越来越多的证据表明硫酯酶 (TE) 结构域是工程化 PKS 系统中的一个重要瓶颈。我们创建了一系列带有来自异源途径的交换 TE 结构域的混合 PKS 模块，并用天然和非天然聚酮化合物底物对它们进行挑战。野生型 PKS 模块与非天然底物配对的反应主要导致预期大环内酯的转化率较低。同样，带有非同源 TE 结构域的天然底物和混合 PKS 模块的产物形成也大大减少。相比之下，非天然底物被大多数含有底物兼容 TE 的混合模块转化，直接暗示该结构域作为主要的催化守门人，并强调其作为蛋白质工程目标的价值，以改善 PKS 途径中的模拟生产。