(5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid)-(2→3)-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-β-D-glucopyranosyl-(1→1)-(2S,3R,4E)-2-amino-4-octadecene-1,3-diol | 94458-63-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 鞘脂
• 英文名称: (5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid)-(2→3)-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-β-D-glucopyranosyl-(1→1)-(2S,3R,4E)-2-amino-4-octadecene-1,3-diol
• 英文别名: (2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[(E,2S,3R)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-enoxy]-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylic acid
• CAS: 94458-63-6
• 化学式: C₄₁H₇₄N₂O₂₀
• 分子量: 915.04
• InChiKey: QLMGGRZACLACKO-PJSUIWAYSA-N

物化性质

• 沸点：
  1152.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.40±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  28
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.9
• 拓扑面积：
  370
• 氢给体数：
  14
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid)-(2→3)-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-β-D-glucopyranosyl-(1→1)-(2S,3R,4E)-2-amino-4-octadecene-1,3-diol 生成 (2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[(2S,3R)-2-amino-3-hydroxy-4,5-ditritiooctadecoxy]-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  SCHWARZMANN, GUNTER;SANDHOFF, KONRAD, METH. ENZYMOL. VOL. 138, ORLANDO E. A.,(1987) 319-341

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  2,3,6,2',3',4',6'-hepta-O-acetyl-α-D-lactosyl trichloroacetimidate 在 盐酸 、 Hoveyda-Grubbs catalyst second generation 、 CMP-sialic acid synthetase 、 α-2,3-sialyltransferase from Campylobacter jejuni 、 sodium methylate 、 溶剂黄146 、 胞苷-5’-三磷酸 、 magnesium chloride 、 zinc dibromide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 (5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid)-(2→3)-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-β-D-glucopyranosyl-(1→1)-(2S,3R,4E)-2-amino-4-octadecene-1,3-diol
  参考文献：
  名称：

  鞘糖脂及相关衍生物化学酶促合成的多样性导向策略

  摘要：

  开发了一种以多样性为导向的策略，将酶促聚糖组装和通过化学选择性交叉复分解和N-酰化的现场脂质重塑相结合，用于从常见的简单糖苷开始的鞘糖脂 (GSL) 合成。该策略通过一系列天然 GSL 和 GSL 衍生物进行了验证，并显示出几个优点。最值得注意的是，它实现了聚糖和脂质的双向多样化，包括引入设计的分子标签，以提供对生物学研究和应用有用的功能化 GSL。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.0c02847

文献信息

• Efficient synthesis of non-natural ganglioside (pseudo-GM3) and fluorescent labelled lysoGM3 on the basis of polymer-assisted enzymatic strategy
  作者：Kuriko Yamada、Susumu Matsumoto、Shin-Ichiro Nishimura

  DOI：10.1039/a809729a

  日期：——

  The versatility of polymer-assisted enzymatic synthesis of non-natural and biologically significant glycolipid derivatives was demonstrated by constructing pseudo-ganglioside GM3 1 having the trisaccharide sequence Neu5Acα- (2→6)Galβ(1→4)Glc and a fluorescent labelled lysoGM3 2.

  通过构建伪神经节苷脂GM3 1（其具有三糖序列Neu5Acα-(2→6)Galβ(1→4)Glc）和荧光标记的溶血GM3 2，展示了聚合物辅助酶合成非天然和生物重要的甘油脂衍生物的多样性。
• The total synthesis of ganglioside GM3
  作者：Richard I. Duclos

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)00121-x

  日期：2000.10

  beta-Gal-(1'' --> 3'/4')-GlcNAc alpha-(2''' --> 3'')-sialyltransferase enzyme, and was evaluated as a synthetic intermediate to ganglioside GM3. The chemical total synthesis of ganglioside GM3 was performed on one of the largest scales yet reported. The highlights of this synthesis include minimizing the steps necessary to prepare the lactosyl acceptor as a useful anomeric mixture, which was present in

  审查了神经节苷脂GM3（NeuAc alpha3Gal beta4Glc beta1Cer）的先前合成，并研究了化学酶和化学全合成方法。在化学酶学方法中，（2S，3R，4E）-5'''-乙酰基-α-神经氨酸-（2'''-> 3''）-β-吡喃半乳糖基-（1''-> 4'使用重组β-Gal-（1''-> 3'可以轻松制备）-β-吡喃葡萄糖基-（1'-> 1）-2-叠氮基-4-十八碳烯1，，3-二醇（azidoGM3） / 4'）-GlcNAcα-（2'''-> 3''）-唾液酸转移酶，被评估为神经节苷脂GM3的合成中间体。神经节苷脂GM3的化学全合成以迄今报道的最大规模之一进行。该合成的亮点包括最小化制备作为有用的异头混合物的乳糖基受体所必需的步骤，对于与已知神经氨酰基供体的高度区域选择性和相当立体选择性的唾液酸化，过量存在以得到被保护的GM3三糖。合成方法通过充分表征的GM3三糖三氯乙亚氨
• Streamlined chemoenzymatic total synthesis of prioritized ganglioside cancer antigens
  作者：Hai Yu、Abhishek Santra、Yanhong Li、John B. McArthur、Tamashree Ghosh、Xiaoxiao Yang、Peng G. Wang、Xi Chen

  DOI：10.1039/c8ob01087k

  日期：——

  A highly efficient streamlined chemoenzymatic strategy for total synthesis of four prioritized ganglioside cancer antigens GD2, GD3, fucosyl GM1, and GM3 from commercially available lactose and phytosphingosine is demonstrated. Lactosyl sphingosine (LacβSph) was chemically synthesized (on a 13 g scale), subjected to sequential one-pot multienzyme (OPME) glycosylation reactions with facile C18-cartridge

  展示了一种高效的简化化学酶策略，可从市售乳糖和植物鞘氨醇中合成四种优先神经节苷脂类癌抗原GD2，GD3，岩藻糖基GM1和GM3。化学合成了乳糖基鞘氨醇（LacβSph）（13 g规模），进行了连续一锅多酶（OPME）糖基化反应，并进行了简便的C18碳粉纯化，然后改善了酰化条件，形成了目标神经节苷脂，包括岩藻糖基GM1，以前从未合成过。
• Chemoenzymatic synthesis and biological evaluation of ganglioside GM3 and lyso-GM3 as potential agents for cancer therapy
  作者：Tingshen Li、Xiaodan Wang、Peijie Dong、Peng Yu、Yongmin Zhang、Xin Meng

  DOI：10.1016/j.carres.2021.108431

  日期：2021.11

  A highly efficient chemoenzymatic method for synthesizing ganglioside GM3 and lyso-GM3 was reported here. Enzymatic extension of the chemically synthesized lactosyl sphingosine using efficient one-pot multienzyme (OPME) reaction allowed glycosylation to be carried out in aqueous solutions realizing the greening of reactions. Ganglioside GM3 was synthesized through 10 steps with a total yield of 22%

  本文报道了一种高效的化学酶法合成神经节苷脂 GM3 和 lyso-GM3。使用高效的一锅多酶（OPME）反应对化学合成的乳糖基鞘氨醇进行酶促延伸，使得糖基化可以在水溶液中进行，实现了反应的绿色化。神经节苷脂GM3经过10步合成，总收率为22%。 Lyso-GM3 对于各种衍生化非常有用。抗增殖活性研究表明，这些带有鞘氨醇的化合物14 – 16比相应的带有神经酰胺的 lyso-GM3 表现出更强的效力。所有神经节苷脂GM3和lyso-GM3均能有效抑制黑色素瘤B16-F10细胞的迁移。这些化学酶法合成的GM3和lyso-GM3表现出抗肿瘤活性，为寻找新的抗肿瘤药物用于癌症治疗提供了有价值的前景。
• Chemoenzymatic Total Synthesis of GM3 Gangliosides Containing Different Sialic Acid Forms and Various Fatty Acyl Chains
  作者：Hai Yu、Madhusudhan Reddy Gadi、Yuanyuan Bai、Libo Zhang、Lei Li、Jun Yin、Peng G. Wang、Xi Chen

  DOI：10.1021/acs.joc.1c00450

  日期：2021.7.2

  diverse GM3 gangliosides containing various sialic acid forms and different fatty acyl chains in low cost, an improved process was developed to chemically synthesize lactosyl sphingosine from an inexpensive l-serine derivative. It was then used to obtain GM3 sphingosines from diverse modified sialic acid precursors by an efficient one-pot multienzyme sialylation system containing Pasteurella multocida

  神经节苷脂是一种含唾液酸的鞘糖脂，已在所有脊椎动物的细胞膜中发现。它们的重要生物学功能由聚糖和神经酰胺脂质成分共同贡献。GM3 是一种主要的神经节苷脂，也是许多其他更复杂的神经节苷脂的前体。为了以低成本获得结构多样的含有各种唾液酸形式和不同脂肪酰基链的 GM3 神经节苷脂，开发了一种改进的工艺，以从廉价的l-丝氨酸衍生物化学合成乳糖基鞘氨醇。然后将其用于通过有效的一锅多酶唾液酸化系统从多种修饰的唾液酸前体中获得 GM3 鞘氨醇，该系统含有多杀性巴氏杆菌唾液酸转移酶 3 (PmST3 )糖核苷酸的产生。然后使用高效的化学酰化和简便的 C18 滤芯纯化工艺来安装不同长度和不同修饰的脂肪酰基链。化学酶法代表了一种强大的全合成策略，可以访问结构定义的 GM3 神经节苷脂库以探索其功能。