1-[3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenyl]cytosine | 1180533-51-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-[3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenyl]cytosine
• 英文别名: 4-Amino-1-[3,5-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]phenyl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1180533-51-0
• 化学式: C₂₄H₄₁N₃O₃Si₂
• 分子量: 475.779
• InChiKey: KIVDWBFRJCOWCV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.86
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  77.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenyl]cytosine 在 盐酸 、 sodium nitrite 、 水 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 76.0h， 以85%的产率得到1-[3,5-双(羟甲基)苯基]嘧啶-2,4-二酮
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and properties of a novel molecular beacon containing a benzene-phosphate backbone at its stem moiety

  摘要：

  本文描述了一种新型分子信标（MB）的合成及其性能，该分子信标的茎部分含有苯基磷酸骨架。研究发现，随着苯基磷酸骨架的引入，MB的荧光强度得到了稳定。此外，含有苯基磷酸骨架的MB对DNase I（内切酶）的抗性强于由天然DNA和2′-O-甲基-RNA组成的MB。这些结果表明，含有苯基磷酸骨架的MB相较于由天然DNA和2′-O-甲基-RNA组成的MB更具优势。

  DOI：

  10.1039/b901631g
• 作为产物：
  描述：

  3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenylboronic acid 、 胞嘧啶 在 四甲基乙二胺 、 氧气 、 copper(II) acetate monohydrate 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以91%的产率得到1-[3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenyl]cytosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and properties of a novel molecular beacon containing a benzene-phosphate backbone at its stem moiety

  摘要：

  本文描述了一种新型分子信标（MB）的合成及其性能，该分子信标的茎部分含有苯基磷酸骨架。研究发现，随着苯基磷酸骨架的引入，MB的荧光强度得到了稳定。此外，含有苯基磷酸骨架的MB对DNase I（内切酶）的抗性强于由天然DNA和2′-O-甲基-RNA组成的MB。这些结果表明，含有苯基磷酸骨架的MB相较于由天然DNA和2′-O-甲基-RNA组成的MB更具优势。

  DOI：

  10.1039/b901631g

文献信息

• Synthesis and properties of a novel molecular beacon containing a benzene-phosphate backbone at its stem moiety
  作者：Yoshihito Ueno、Akihiro Kawamura、Keiji Takasu、Shinji Komatsuzaki、Takumi Kato、Satoru Kuboe、Yoshiaki Kitamura、Yukio Kitade

  DOI：10.1039/b901631g

  日期：——

  This paper describes the synthesis and properties of a novel molecular beacon (MB) containing a benzene-phosphate backbone at its stem moiety. The fluorescence intensity of MBs was found to stabilize by the introduction of the benzene-phosphate backbone at its stem moiety. Furthermore, an MB containing the benzene-phosphate backbone was more resistant to DNase I (endonuclease) than an MB comprising natural DNA and 2′-O-methyl-RNA. These results indicate that the MB with the benzene-phosphate backbone is superior as a molecular beacon as compared to the MB composed of natural DNA and 2′-O-methyl-RNA.

  本文描述了一种新型分子信标（MB）的合成及其性能，该分子信标的茎部分含有苯基磷酸骨架。研究发现，随着苯基磷酸骨架的引入，MB的荧光强度得到了稳定。此外，含有苯基磷酸骨架的MB对DNase I（内切酶）的抗性强于由天然DNA和2′-O-甲基-RNA组成的MB。这些结果表明，含有苯基磷酸骨架的MB相较于由天然DNA和2′-O-甲基-RNA组成的MB更具优势。