2'-deoxyadenosine-5'-(3-phosphono-L-alanine) phosphoramidate | 1263428-07-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 2'-deoxyadenosine-5'-(3-phosphono-L-alanine) phosphoramidate
• 英文别名: 3-phosphono-L-Ala-dAMP；2'-deoxyadenosine-5'-(3-phosphono-L-alanine)phosphoramidate；(2R)-2-[[[(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]amino]-3-phosphonopropanoic acid
• CAS: 1263428-07-4
• 化学式: C₁₃H₂₀N₆O₁₀P₂
• 分子量: 482.284
• InChiKey: MFILFMXRDSHRSA-RBXMUDONSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.1
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  253
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧腺苷-5'-单磷酸 在 N-乙基吗啉 、 3-phosphono acid hydrochloride 、 三苯基膦 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 76.5h， 生成 2'-deoxyadenosine-5'-(3-phosphono-L-alanine) phosphoramidate
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL PHOSPH(ON)ATE- AND SULF(ON)ATE-BASED PHOSPHATE MODIFIED NUCLEOSIDES USEFUL AS SUBSTRATES FOR POLYMERASES AND AS ANTIVIRAL AGENTS
  [FR] NOUVEAUX NUCLÉOSIDES MODIFIÉS AVEC UN PHOSPHATE, À BASE DE PHOSPH(ON)ATE ET DE SULF(ON)ATE, UTILES COMME SUBSTRATS POUR LES POLYMÉRASES ET COMME AGENTS ANTIVIRAUX

  摘要：

  这项发明提供了由结构式（I）表示的磷酸酯修饰核苷，其中W为O或S，B、R1、R3和R2的定义如本文所述。这些化合物可作为DNA/RNA聚合酶的底物使用，特别是作为抗HIV-1的抗病毒药物。

  公开号：

  WO2011069688A1

文献信息

• NOVEL PHOSPH(ON)ATE- AND SULF(ON)ATE-BASED PHOSPHATE MODIFIED NUCLEOSIDES USEFUL AS SUBSTRATES FOR POLYMERASES AND AS ANTIVIRAL AGENTS
  申请人：Herdewijn Piet

  公开号：US20120245029A1

  公开（公告）日：2012-09-27

  This invention provides phosphate-modified nucleosides represented by the structural formula (I): wherein W is O or S, and wherein B, R 1 ; R 3 and R 2 . are as defined herein. These compounds are useful as substrates for DNA/RNA polymerases, and as anti-viral agents in particular against HIV-1.

  这项发明提供了由结构式(I)表示的磷酸修饰核苷酸，其中W为O或S，而B、R1、R2和R3如此处所定义。这些化合物可作为DNA/RNA聚合酶的底物，特别是在抗击HIV-1方面作为抗病毒剂。
• 3-Phosphono-l-alanine as pyrophosphate mimic for DNA synthesis using HIV-1 reverse transcriptase
  作者：Shiqiong Yang、Mathy Froeyen、Eveline Lescrinier、Philippe Marlière、Piet Herdewijn

  DOI：10.1039/c0ob00554a

  日期：——

  phosph(on)ate amino acid phosphoramidate analogues of deoxynucleotides were synthesized as potential substrates for HIV-1 reverse transcriptase. Taurine, L-cysteic acid, 3-phosphono-L-alanine, O-sulfonato-L-serine, and O-phospho-L-serine were investigated as leaving groups in an enzyme catalyzed DNA synthesis protocol. Among these analogues, the phosphonate congener performed best and 3-phosphono-L-alanine

  合成了一系列脱氧核苷酸的硫酸盐和磷酸盐氨基酸氨基磷酸酯类似物作为HIV-1逆转录酶的潜在底物。 牛磺酸， L-半胱氨酸， 3-膦基-L-丙氨酸，ø -sulfonato-大号-丝氨酸，和O-磷酸-L-丝氨酸作为酶催化的DNA合成方案中的离去基团进行了研究。在这些类似物中，膦酸酯同类物表现最好，3-膦基-L-丙氨酸 可以被认为是拟南芥的焦磷酸盐（PPi）部分的出色模仿 脱氧腺苷三磷酸用于核酸的酶促合成。在单核苷酸掺入测定过程中，使用3-膦酰基L -Ala-dAMP作为底物可在60分钟内以50μM的速率将P + 1链转化为95％（浓度比L -Asp-低10倍）dAMP），并改善了结合动力学，减少了停滞现象。对于所研究的序列，掺入的效率是碱基依赖性的，并且以递减的顺序排列（A≥T = G> C）。在所有情况下，合并均遵循Watson-Crick规则。