2',3'-dideoxy-α-D-cytidine | 116561-09-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2',3'-dideoxy-α-D-cytidine
• 英文别名: ZINC00039907；4-amino-1-[(2S,5S)-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 116561-09-2
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₃
• 分子量: 211.221
• InChiKey: WREGKURFCTUGRC-XPUUQOCRSA-N

物化性质

• 沸点：
  415.0±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.57±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  88.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-dideoxy-α-D-cytidine 在 水合三氯化钌 、 potassium persulfate 、 potassium hydroxide 作用下， 反应 5.0h， 以83%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  A new class of pyrimidine nucleosides: inhibitors of hepatitis B and C viruses

  摘要：

  Hepatitis B virus (HBV) and hepatitis C virus (HCV) infections are major health threats worldwide leading to liver cirrhosis, liver cancer and mortality. Herein, we report a new category of dideoxy pyrimidine nucleosides possessing a 4'-carboxyl (or carboxymethyl) function (7-9, 13, 16, 17), which are discovered as potential antiviral agents. For the first time, these nucleosides are recognized to be inhibitors of HBV and/or HCV replication. Among 4'-carboxy compounds, 3',4'-didehydrothymidine (16) was most effective against DHBV, HBV and HCV. Modification of the 4'-position in compound 7 from a carboxyl to carboxymethyl group (17) did not affect the anti-HBV activity but greatly increased the anti-HCV activity. Importantly, 17 yielded synergistic antiviral effect when combined with ribavirin without toxicity. The activity exhibited by a single agent towards both hepatitis viruses and no detectable in vitro cytotoxicity make this new class of compounds of interest. (c) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2012.08.042
• 作为产物：
  描述：

  (5S)-5-(hydroxymethyl)-2-oxo-tetrahydrofuran 在 咪唑 、 四丁基氟化铵 、 二氯乙基铝 、 二异丁基氢化铝 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 32.75h， 生成 2',3'-dideoxy-α-D-cytidine
  参考文献：
  名称：

  对 LINE-1 迁移率具有抑制活性的 2,3-双脱氧-d-核糖衍生的嘧啶核苷的 NMR 研究

  摘要：

  嘧啶核苷类似物具有很高的药理学价值。它们显示出非常有用的抗 VIH、乙型肝炎病毒和抗癌活性的抗病毒活性，目前用于治疗这些疾病。鉴于其重要性，许多科学家修改了这些核苷类似物的结构，以寻求改善其特性、靶向特异性、功效并降低其毒性。由于这项研究，一些类似物被描述为具有改进的特性，其中包括源自 2,3-双脱氧-D-核糖的核苷，如齐多夫定 (AZT)、去羟肌苷 (ddI) 和扎西他滨 (ddC)。许多研究人员还研究了这些化合物的核磁共振谱。特别是，他们描述了异头构型对化合物中的 H 和 C NMR 信号的影响，例如，腺苷核苷或异核苷。作为我们抑制转座因子（如 LINE-1）研究的一部分，我们合成了（方案 1）18 种 2',3'-双脱氧核糖核苷性质的核苷类似物（化合物 1-18，图 1）及其相应的前体（化合物 19-36，图 2）和针对哺乳动物 LINE-1 逆转录转座的 1-18 检测，获得了非常

  DOI：

  10.1002/mrc.4942

文献信息

• Expeditious Syntheses of Sugar-Modified Nucleosides and Collections Thereof Exploiting Furan-, Pyrrole-, and Thiophene-Based Siloxy Dienes
  作者：Gloria Rassu、Franca Zanardi、Lucia Battistini、Enrico Gaetani、Giovanni Casiraghi

  DOI：10.1021/jm960400q

  日期：1997.1.1

  enriched 2',3'-dideoxynucleosides 14a-c (alpha and beta anomers of L- and D-series), 2',3'-dideoxy-4'-thionucleosides 21a-c (alpha and beta anomers of L- and D-series), and 2',3'-dideoxy-4'-azanucleosides 28a-c (beta anomers of L- and D-series) were synthesized, with uniform chemistry and high stereochemical efficiency, exploiting a triad of versatile heterocyclic siloxy dienes, namely, 2-(tert-but

  一系列单独的糖修饰的嘧啶核苷，包括对映体富集的2'，3'-二脱氧核苷14a-c（L和D系列的α和β端基异构体），2'，3'-二脱氧-4'-硫代核苷21a-合成了c（L和D系列的α和β端基异构体）和2'，3'-二脱氧-4'-氮杂核苷28a-c（L和D系列的β端基异构体）立体化学效率，利用三元组的多功能杂环甲硅烷氧基二烯，即2-（叔丁基二甲基甲硅烷氧基）呋喃（TBSOF），2-（叔丁基二甲基甲硅烷氧基）噻吩（TBSOT）和N-（叔丁氧基羰基）-2-（叔丁基二甲基甲硅烷氧基）吡咯（TBSOP）。合成方法有利地使用甘油醛丙酮化物的对映体（D-1和L-1）作为手性来源和甲酰基阳离子的合成等同物。
• Synthesis and Characterization of Specific Reverse Transcriptase Inhibitors for Mammalian LINE-1 Retrotransposons
  作者：Guillermo Banuelos-Sanchez、Laura Sanchez、Maria Benitez-Guijarro、Valentin Sanchez-Carnerero、Carmen Salvador-Palomeque、Pablo Tristan-Ramos、Meriem Benkaddour-Boumzaouad、Santiago Morell、Jose L. Garcia-Puche、Sara R. Heras、Francisco Franco-Montalban、Juan A. Tamayo、Jose L. Garcia-Perez

  DOI：10.1016/j.chembiol.2019.04.010

  日期：2019.8

  LINE-1-retroelements use different mechanisms for retrotransposition, although both involve the reverse transcription of an intermediate retroelement-derived RNA. Retrotransposon activity continues to effect the germline and somatic genomes, generating interindividual variability over evolution and potentially influencing cancer and brain physiology, respectively. However, relatively little is known about

  逆转座子是在哺乳动物基因组中扩增到惊人数量的一种可转座元件（TE），包括超过三分之一的人类和小鼠基因组。长时间散布的1类元素（LINE-1或L1）反转录转座子丰富，目前在人类和小鼠基因组中具有活跃的反转录元件。同样，两个基因组中都含有长末端重复序列（LTR）的逆转座子，尽管仅在小鼠中有活性。LTR和LINE-1-逆转录元件使用不同的逆转座子机制，尽管两者都涉及中间逆向元件衍生的RNA的逆转录。反转录转座子的活性继续影响种系和体细胞基因组，在进化过程中产生个体差异，并分别影响癌症和脑部生理。然而，关于逆转座的功能后果知之甚少。在这项研究中，我们已经合成和表征了针对哺乳动物LINE-1逆转座子的逆转录酶抑制剂，这可能有助于破译体内逆转座子的功能。
• [EN] 5'-HYDROGENPHOSPHONATES AND 5'-METHYLPHOSPHONATES OF SUGAR MODIFIED NUCLEOSIDES, COMPOSITIONS AND USES THEREOF
  申请人：SLOAN-KETTERING INSTITUTE FOR CANCER RESEARCH

  公开号：WO1991019727A1

  公开（公告）日：1991-12-26

  (EN) The present invention concerns compounds having one of the structures (I), (II), (III), wherein R is (a) or (b), R1 is hydrogen, halogen, an azido, an amino or an alkyl group of one to four carbons, R2 is hydrogen, halogen, an azido, an amino or an alkyl group of one to four carbons, R3 is hydrogen or an alkyl group of one to four carbons, X is a hydroxy, a thiol, or an amino group, Y is hydrogen, a halogen or an alkyl group of one to four carbons, and Z is a hydrogen, hydroxy, or an amino group. The present invention also provides pharmaceutical compositions comprising a pharmaceutically effective amount of a compound according to the subject invention and a pharmaceutically acceptable carrier. Finally, the invention provides methods to suppress viral infection.(FR) Composés possédant la structure (I), (II) ou (III), dans laquelle R représente (a) ou (b) R1 représente hydrogène, halogène, un groupe azido, amino ou alkyle ayant un à quatre carbones, R2 représente hydrogène, halogène un groupe azido, un groupe amino ou un groupe alkyle ayant un à quatre carbones, R3 représente hydrogène ou un groupe alkyle ayant un à quatre carbones, X représente un groupe hydroxy, thiol, ou amino, Y représente hydrogène, un groupe halogène ou alkyle ayant un à quatre carbones, et Z représente un groupe hydrogène, hydroxy, ou amino. On décrit aussi des compositions pharmaceutiques comprenant une quantité pharmaceutiquement efficace d'un composé selon la présente invention et un porteur pharmaceutiquement acceptable. On décrit enfin des procédés pour éliminer l'infection virale.

  本发明涉及具有结构（I），（II），（III）之一的化合物，其中R为（a）或（b），R1为氢，卤素，偶氮，氨基或具有一到四个碳的烷基基团，R2为氢，卤素，偶氮，氨基或具有一到四个碳的烷基基团，R3为氢或具有一到四个碳的烷基基团，X为羟基，硫醇或氨基基团，Y为氢，卤素或具有一到四个碳的烷基基团，Z为氢，羟基或氨基基团。本发明还提供了含有根据本发明的化合物的药物组成物和药学上可接受的载体的药物组合物。最后，本发明提供了抑制病毒感染的方法。
• NUCLEOSIDE DERIVATIVES AND PROCESS FOR THEIR PREPARATION
  申请人：RIKAGAKU KENKYUSHO

  公开号：EP0311694A1

  公开（公告）日：1989-04-19

  The present invention relates to dideoxynucleoside derivatives useful as antiviral agents, intermediates useful for synthesizing them and synthetic processes thereof. The processes of the present invention are characterized in that a mesyl group, a tosyl group or a trifluoromethanesulfonyl group is selectively introduced into the ribose 3'-position of the various nucleoside derivatives in which the base component, the ribose 2'-position, and 5'- position are protected and then treated with a base and a reducing agent to produce effectively intermediates useful for synthesizing dideoxynucleoside derivatives. By employing this process, various novel intermediadtes and dideoxynucleoside derivatives can be obtained. Further, the present invention provides the process for synthesizing the intermediates useful for synthesizing dideoxynucleoside derivatives, which comprises reacting an alkaline compound with nucleoside derivatives in which the base component, the ribose 2'-position and the ribose 5'-position are protected with pivaloyl groups and the ribose 3'-position is protected with a mesyl group, a tosyl group or a trifluoromethanesulfonyl group to selectively eliminate only the pivaloyl group of the base to thereby produce the intermediate.

  本发明涉及用作抗病毒剂的二脱氧核苷衍生物、用于合成它们的中间体及其合成工艺。 本发明工艺的特点是，在碱基成分、核糖 2'- 位和 5'- 位受到保护的各种核苷衍生物的核糖 3'- 位上，选择性地引入一个甲磺酰基、一个甲苯磺酰基或一个三氟甲磺酰基，然后用碱和还原剂处理，从而有效地生成用于合成双脱氧核苷衍生物的中间体。采用这种工艺可以获得各种新型中间体和二脱氧核苷衍生物。 此外，本发明还提供了用于合成二脱氧核苷衍生物的中间体的合成工艺，该工艺包括将碱性化合物与核苷衍生物反应，其中碱基成分、核糖 2'- 位和核糖 5'- 位被新戊酰基保护，核糖 3'- 位被甲磺酰基、甲苯磺酰基或三氟甲磺酰基保护，以选择性地只消除碱基的新戊酰基，从而生成中间体。
• Synthesis of the dideoxynucleosides "ddC" and "CNT" from glutamic acid, ribonolactone, and pyrimidine bases
  作者：Masami Okabe、Ruen Chu Sun、Steve Y. K. Tam、Louis J. Todaro、David L. Coffen

  DOI：10.1021/jo00255a021

  日期：1988.9