5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-2'-deoxyuridine | 1345412-72-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 5-[3-[2-[2-[2-(1-adamantyloxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1345412-72-7
• 化学式: C₂₈H₄₀N₂O₉
• 分子量: 548.634
• InChiKey: RRYAGAHMXNGVFB-XCNZQQSXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-2'-deoxyuridine 在 1,8-双二甲氨基萘 、 三氯氧磷 作用下， 以 磷酸三甲酯 为溶剂， 反应 6.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Diamondoid-modified DNA

  摘要：

  我们准备了新型的C5改性三磷酸盐和磷酰胺，具有功能性连接到核苷碱基的金刚石结构。通过使用不同长度的模板进行引物延伸实验，我们研究了这些改性三磷酸盐是否能够被酶催化地纳入DNA中，以及是否可以进一步延伸。我们发现所有三种改性核苷酸都可以在单核苷酸纳入实验中被纳入DNA，但在需要多次纳入改性核苷酸的两个模板中仅部分纳入。改性磷酰胺通过DNA合成器技术引入到寡核苷酸中。所形成的寡核苷酸结构通过圆二色性（CD）和熔点温度（Tm）测量进行检查，发现它们与未改性对应物适应了相似的螺旋构象。

  DOI：

  10.1039/c1ob05929g
• 作为产物：
  描述：

  1-溴金刚烷 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Diamondoid-modified DNA

  摘要：

  我们准备了新型的C5改性三磷酸盐和磷酰胺，具有功能性连接到核苷碱基的金刚石结构。通过使用不同长度的模板进行引物延伸实验，我们研究了这些改性三磷酸盐是否能够被酶催化地纳入DNA中，以及是否可以进一步延伸。我们发现所有三种改性核苷酸都可以在单核苷酸纳入实验中被纳入DNA，但在需要多次纳入改性核苷酸的两个模板中仅部分纳入。改性磷酰胺通过DNA合成器技术引入到寡核苷酸中。所形成的寡核苷酸结构通过圆二色性（CD）和熔点温度（Tm）测量进行检查，发现它们与未改性对应物适应了相似的螺旋构象。

  DOI：

  10.1039/c1ob05929g