N9-benzyl-N6-methoxyadenine | 115693-37-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: N9-benzyl-N6-methoxyadenine
• 英文别名: 6H-Purin-6-one, 1,9-dihydro-9-(phenylmethyl)-, O-methyloxime；9-benzyl-N-methoxy-9H-purin-6-imine
• CAS: 115693-37-3；129409-02-5
• 化学式: C₁₃H₁₃N₅O
• 分子量: 255.28
• InChiKey: QUHZFIRMSLEWPS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.15
• 拓扑面积：
  64.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N9-benzyl-N6-methoxyadenine 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基乙酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 28.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Targeting cytotoxicity and tubulin polymerization by metal–carbene complexes on a purine tautomer platform

  摘要：

  这项研究描述了基于嘌呤稀有互变异构体的银（Agⁱ）和汞（Hgⁱⁱ）-卡宾配合物的合成、结构研究和与微管结合的情况。这些配合物通过与微管相互作用表现出细胞毒性，通过结合到靠近GTP结合位点的位置来实现。

  DOI：

  10.1039/c4dt00529e
• 作为产物：
  描述：

  溴甲苯 在 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 二甲基亚砜 、 正丁醇 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 N9-benzyl-N6-methoxyadenine
  参考文献：
  名称：

  Targeting cytotoxicity and tubulin polymerization by metal–carbene complexes on a purine tautomer platform

  摘要：

  这项研究描述了基于嘌呤稀有互变异构体的银（Agⁱ）和汞（Hgⁱⁱ）-卡宾配合物的合成、结构研究和与微管结合的情况。这些配合物通过与微管相互作用表现出细胞毒性，通过结合到靠近GTP结合位点的位置来实现。

  DOI：

  10.1039/c4dt00529e

文献信息

• Design, synthesis and structure–activity relationships of a series of 9-substituted adenine derivatives as selective phosphodiesterase type-4 inhibitors
  作者：Pierre Raboisson、Claire Lugnier、Christian Muller、Jean-Marie Reimund、Dominique Schultz、Guillaume Pinna、Alain Le Bec、Hélène Basaran、Laurent Desaubry、François Gaudiot、Mohamed Seloum、Jean-Jacques Bourguignon

  DOI：10.1016/s0223-5234(02)01446-0

  日期：2003.2

  Adenine derivatives substituted in position 9 have been demonstrated to have potent cyclic nucleotide phosphodiesterase (PDE) inhibition properties with high selectivity toward PDE-4. Starting from our initial lead compound 9-(2-fluorobenzyl)-N(6)-methyl-2-trifluoromethyladenine (4, NCS613), we designed and synthesized a new series of 9-substituted derivatives for developing structure-activity relationship

  已经证明在9位取代的腺嘌呤衍生物具有有效的环核苷酸磷酸二酯酶（PDE）抑制特性，并且对PDE-4具有高选择性。从我们最初的先导化合物9-（2-氟苄基）-N（6）-甲基-2-三氟甲基腺嘌呤（4，NCS613）开始，我们设计并合成了一系列新的9-取代衍生物，用于开展结构-活性关系研究。这一系列新的衍生物显示出更高的效价和更好的选择性。在腺嘌呤环的三个不同位置上并行完成结构修饰，并得到以下观察结果：（i）引入亲脂性取代基（如三氟甲基），C-2位的正丙基或碘对于PDE-4抑制活性和对其他同工酶的选择性都有利；（ii）用2-甲氧基取代基对N9苄基进行官能化，导致活性更高的化合物；（iii）用其他氨基取代N（6）-甲基氨基部分对活性是有害的。在所有制备的衍生物中，9-（2-甲氧基苄基）-N（6）-甲基-2-三氟甲基腺嘌呤（9r），9-（2-甲氧基苄基）-N（6）-甲基-2-n-丙基腺嘌呤（9s） ），
• Purines. XXIX. Syntheses of 9-alkyl-2-deuterio-N6-methoxyadenines and 2-deuterio-N6,9-dimethyladenine: Tautomerism in 9-substituted N6-alkoxyadenines.
  作者：TOZO FUJII、TOHRU SAITO、TAISUKE ITAYA、KYOKO KIZU、YUKINARI KUMAZAWA、SATOSHI NAKAJIMA

  DOI：10.1248/cpb.35.4482

  日期：——

  Cyclizations of the alkoxyamidines 7a, i with formic acid gave N6-methoxy-9-methyladenine (8a) and 9-benzyl-N6-methoxyadenine (8i). Replacement of formic acid by formic-d acid-d in these cyclizations afforded the 2-deuterated species 13a and 13i. A similar cyclization of 22, obtained from 21 by alkaline hydrolysis, with formic-d acid-d yielded 2-deuterio-N6-methoxy-1, 9-dimethyladenine (24). The N6-methyl isomer 19 was prepared from 13a by treatment with NaH and MeI. Comparison of the proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR) spectrum of 8a in Me2SO-d6 with that of 13a revealed that 8a exists as an equilibrated 1 : 3.5 mixture of the amino (type 14 or 15) and the imino (type 16 or 17) forms. The deuterated species 19 and 24 were utilized for interpretation of the 1H-NMR spectra of the amino-form model 18 and the imino-form model 23. The existence of amino-imino tautomerism in 8a was also supported by ultraviolet and infrared spectroscopic evidence. Such tautomerism, with a preference for the imino form, in Me2SO-d6 was found to be common to 13 other 9-substituted N6-alkoxyadenines (type 8) including adenosine analogues. On the other hand, comparison of the 1H-NMR spectra of 11, N6, 9-dimethyladenine (12), and N6, N6, 9-trimethyladenine (36) indicated that 12 exists solely in the amino form in CDCl3 or Me2SO-d6.

  烷氧基脒7a、7i与甲酸的环化反应分别得到了N6-甲氧基-9-甲基腺嘌呤（8a）和9-苄基-N6-甲氧基腺嘌呤（8i）。在这些环化反应中，用重氢甲酸（formic-d酸-d）替代甲酸得到了2-氘化的物种13a和13i。类似地，从21通过碱水解获得的22与重氢甲酸的环化反应得到了2-氘代-N6-甲氧基-1,9-二甲基腺嘌呤（24）。N6-甲基异构体19是通过NaH和MeI处理13a制备的。8a在二甲亚砜-d6中的质子核磁共振（1H-NMR）谱与13a的谱图对比显示，8a以1:3.5的比例平衡存在氨基（类型14或15）和亚氨基（类型16或17）形式。氘代物种19和24用于解释氨基形式模型18和亚氨基形式模型23的1H-NMR谱图。8a中存在的氨基-亚氨基互变异构现象也得到了紫外和红外光谱证据的支持。这种在二甲亚砜-d6中偏好亚氨基形式的互变异构现象在其他13种9-取代的N6-烷氧基腺嘌呤（类型8）中普遍存在，包括腺苷类似物。另一方面，N6,9-二甲基腺嘌呤（12）和N6,N6,9-三甲基腺嘌呤（36）的1H-NMR谱图对比表明，12在CDCl3或二甲亚砜-d6中仅以氨基形式存在。
• Antimicrobial and cytotoxic activity of agelasine and agelasimine analogs
  作者：Anders Vik、Erik Hedner、Colin Charnock、Linda W. Tangen、Ørjan Samuelsen、Rolf Larsson、Lars Bohlin、Lise-Lotte Gundersen

  DOI：10.1016/j.bmc.2007.03.086

  日期：2007.6

  Agelasine and agelasimine derivatives with substantially less complicated terpenoid side chains compared to the naturally occurring compounds have been synthesized and their ability to inhibit growth of microorganisms and cancer cells has been studied. Compounds with excellent activity against cancer cell lines (MIC ca. 1 microM for the most potent compounds), including a drug resistant renal cell

  与天然化合物相比，已经合成了具有实质上不那么复杂的萜类化合物侧链的Agelasine和agelasimine衍生物，并研究了它们抑制微生物和癌细胞生长的能力。已经鉴定出对癌细胞系具有优异活性的化合物（对于最有效的化合物，MIC约为1 microM），包括抗药性肾细胞系。研究的大多数化合物还表现出广谱的抗菌活性，包括抗结核分枝杆菌的活性。
• Crystal engineering with a purine rare tautomer: structures and luminescence properties
  作者：Shruti Khanna、Sandeep Verma

  DOI：10.1039/c4ce00611a

  日期：——

  living systems through unfavorable interactions with biomolecules, interacts with purine nucleobases through N7 imino nitrogen and induces modifications by altering amino–imino tautomeric equilibrium. Herein, we report unique crystallographic signatures of cadmium complexes of N9-benzyl-N6-methoxyadenine, a rare imino tautomer of adenine. These complexes exhibit a variety of coordination numbers and spatial

  镉是一种众所周知的金属，它通过与生物分子的不利相互作用而对生物系统有毒，它通过N7亚氨基氮与嘌呤核碱基相互作用，并通过改变氨基-亚氨基互变异构平衡而引起修饰。在此，我们报道了N 9-苄基-N 6-甲氧基腺嘌呤（稀有的腺嘌呤亚氨基互变异构体）镉配合物的独特晶体学特征。这些配合物表现出各种配位数和空间几何形状，突出了核碱基形成各种超分子结构的能力，从而使人们能够更好地理解金属与DNA的相互作用。配合物1中的Cd 2+离子的配位数为4，且四面体的几何形状畸变，而配合物2和3是六配位的，其中2显示离散的扭曲的八面体几何形状，而3显示为双核络合物。另一方面，复合物4表现出不太常见的七边形配位模式，具有五边形双锥体的几何形状。还报道了这些镉络合物的发光性质。
• Crystallographic Signatures of <i>N</i>⁶-Methoxyadenine Imino Tautomer–Silver Complexes
  作者：Shruti Khanna、Sandeep Verma

  DOI：10.1021/cg300231r

  日期：2012.6.6

  Detailed crystallographic analysis of four silver complexes of N9-benzyl-N-6-methoxyadenine, 1, on the basis of three different counteranions and silver ion stoichiometry, is discussed in this article. 1 is a rare tautomer of adenine, which exhibits promutagenic behavior as it partly mimics hydrogen bond donor and acceptor properties of guanine and mispairs with cytosine. Complexes 2 and 4 exhibit discrete Ag2L2 dimer, while complex 3 shows two AgL2 units in addition to a Ag2L2 dimer, all in a head-to tail fashion. Complex 5, on the other hand, shows four AgL2 units coordinated in a head-to-head fashion affording a three-dimensional lattice stabilized by CH center dot center dot center dot F interactions. Various noncovalent interactions such as hydrogen bonding, CH-pi interactions, argentophilic interactions, and Ag-pi interactions stabilize these complexes.