N_α,N_δ,N_ω-tri-CBZ-L-arginine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N_α,N_δ,N_ω-tri-CBZ-L-arginine
• 英文别名: N^α,N^ω,N^ω'-Tris(benzyloxycarbonyl)-L-arginin；tri(benzyloxycarbonyl)-L-arginine；Tri-Z-L-Arg；Z3-Arg-OH；Z-α-Arg(Z²)-OH；Z-Arg(Z₂)；Z-S-Arg(Z2)-OH；Z-Arg(Z)2OH；Z-Arg-OH；(S)-2-(((Benzyloxy)carbonyl)amino)-5-((3,7-dioxo-1,9-diphenyl-2,8-dioxa-4,6-diazanonan-5-ylidene)amino)pentanoic acid；(2S)-5-[bis(phenylmethoxycarbonylamino)methylideneamino]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoic acid
• 化学式: C₃₀H₃₂N₄O₈
• 分子量: 576.606
• InChiKey: HZQIQHGUQPYWSW-VWLOTQADSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.5
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  165
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N_α,N_δ,N_ω-tri-CBZ-L-arginine 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 生成 L-arginine amide
  参考文献：
  名称：

  Weitzel; Renner; Guglielmi, Hoppe-Seyler's Zeitschrift fur Physiologische Chemie, 1971, vol. 352, # 12, p. 1617 - 1630

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  L(+)-n-cbz-鸟氨酸盐酸盐 在 甲醇 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 13.25h， 生成 N_α,N_δ,N_ω-tri-CBZ-L-arginine
  参考文献：
  名称：

  从氨基酸实际合成游离和受保护的胍基酸

  摘要：

  在一锅反应中合成了受保护的胍基酸。用二氯甲烷中的三甲基甲硅烷基氯，三乙胺，二碳苯甲氧基-S-甲基异硫脲处理氨基酸，然后通过用甲醇处理除去甲硅烷基，得到相应的碳苯甲酰胍基酸。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)00299-7

文献信息

• Discovery and Structure–Activity Relationships of Nociceptin Receptor Partial Agonists That Afford Symptom Ablation in Parkinson’s Disease Models
  作者：Uma Gayathri Kamakolanu、Michael E. Meyer、Dennis Yasuda、Willma E. Polgar、Matteo Marti、Daniela Mercatelli、Clarissa Anna Pisanò、Alberto Brugnoli、Michele Morari、Nurulain T. Zaveri

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b02134

  日期：2020.3.12

  activity to afford partial agonists with a range of efficacies. Compounds 4, 5, and 9 with agonist efficacies between 25% and 35% significantly attenuated motor deficits in the 6-OHDA-hemilesioned rat model of PD. Further, unlike NOP antagonists, which appear to worsen dyskinesia expression, these NOP partial agonists did not attenuate or worsen dyskinesia expression. The NOP partial agonists and their SAR

  开发了一系列新型的C（3）取代的哌啶基吲哚作为伤害感受肽阿片受体（NOP）部分激动剂，以探索药理学假设，即NOP部分激动剂将提供双重药理作用，以减轻帕金森氏病（PD）的运动症状和左旋多巴的发展引起的运动障碍。围绕C-3取代基的SAR研究了对NOP结合，内在活性和选择性的影响，并表明尽管C（3）取代的吲哚是选择性的，高亲和力的NOP配体，但C-的空间，极性和阳离子性质3个取代基影响内在活性，从而提供具有一定功效的部分激动剂。激动剂效率在25％到35％之间的化合物4、5和9在6-OHDA肥胖大鼠PD模型中显着减轻了运动功能障碍。进一步，与NOP拮抗剂似乎会加剧运动障碍的表达不同，这些NOP部分激动剂不会减弱或加剧运动障碍的表达。此处报道的NOP部分激动剂及其SAR可能有助于开发PD的非多巴胺能治疗。
• Studies on amino acids and peptides-III. 2,4-bis(4-methoxyphenyl)-1,3,2,4-dithiadiphosphetane 2,4-disulfide, , as a new racemization free coupling reagent in peptide synthesis
  作者：U. Pedersen、M. Thorsen、E.-E.A.M. El-Khrisy、K. Clausen、S.-O. Lawesson

  DOI：10.1016/0040-4020(82)80104-x

  日期：1982.1

  of N-protected amino acids (Z-Gly-OH, Boc-Gly-OH, Boc-S-Ser(Bzl)-OH, Boc-S-Tyr(Bzl)-OH, Z-S-Arg(Z2)-OH, and Z-S-Pro-OH), at room temperature in CH2Cl2 to give the intermediates , mixed anhydrides. When is treated with two moles of a base and one mole of the salt of an amino acid ester (TosOH·H-Gly-OBzl, HCl·H-Gly-OBzl, HCl·H-Gly-OEt, and HCl·H-S-Phe-OtBu) at 0°C, the expected peptide is isolated in

  容易获得的2,4-双（4-甲氧基苯基）-1,3,2,4-二硫代二膦2,4-二硫已与N-保护的氨基酸的盐（Z-Gly-OH，Boc- Gly-OH，Boc-S-Ser（Bzl）-OH，Boc-S-Tyr（Bzl）-OH，ZS-Arg（Z 2）-OH和ZS-Pro-OH），在室温下于CH 2中Cl 2给出中间体，混合酸酐。当用碱的两摩尔和氨基酸酯的盐的一摩尔处理（TOSOH·H -甘氨酸- OBzl计，盐酸·H -甘氨酸- OBzl计，盐酸·H -甘氨酸- OET，和HCl·HS- Phe-OtBu）在0°C时，预期的肽被分离出来，产量高。还发现LR在Z-Gly-S-Ala-OH和TosOH·HS-Leu-OBzl之间的片段偶联中是有用的试剂。通过HPLC测试该三肽（不需要去保护和根据Izumiya的氨基酸分析），并且未观察到差向异构化（＜0.7％）。
• Synthesis of the C-terminal octapeptide of pig oxyntomodulin. Lys-Arg-Asn-Lys-Asn-Asn-Ile-Ala: a potent inhibitor of pentagastrin-induced acid secretion
  作者：M. P. Audousset-Puech、C. Jarrousse、M. Dubrasquet、A. Aumelas、B. Castro、D. Bataille、Jean Martinez

  DOI：10.1021/jm00148a027

  日期：1985.10

  representing the C-terminal octapeptide of oxyntomodulin isolated from pig intestine is described. Its structure was confirmed by its 360-MHz 1H NMR spectra. The octapeptide was tested for its ability to inhibit pentagastrin-induced acid secretion, in the anaesthetized rat, in the conscious rat with chronic gastric fistula, and in the conscious cat with gastric chronic fistula. The octapeptide inhibits pentagastrin-induced

  描述了代表从猪肠分离的胃泌酸调节素的C端八肽的Lys-Arg-Asn-Lys-Asn-Asn-Ile-Ala的合成。其结构通过其360-MHz 1H NMR光谱证实。在麻醉的大鼠，患有慢性胃瘘的清醒大鼠和患有胃慢性瘘的清醒猫中，测试了八肽抑制五肽胃泌素诱导的酸分泌的能力。在所有三个模型中，八肽均抑制五肽胃泌素诱导的酸分泌。与母体激素催产激素调节剂相比，合成肽的效价低约150倍，但功效相同。提出并讨论了生物学数据。
• Thermodynamic studies of a series of homologous HIV-1 TAR RNA ligands reveal that loose binders are stronger Tat competitors than tight ones
  作者：Lise Pascale、Stéphane Azoulay、Audrey Di Giorgio、Laura Zenacker、Marc Gaysinski、Pascal Clayette、Nadia Patino

  DOI：10.1093/nar/gkt237

  日期：2013.6

  stronger Tat competitors than those forming tight ones, and thermal denaturation studies demonstrated that loose complexes are more stable than tight ones. This could be correlated to the fact that loose and tight ligands induce distinct RNA conformational changes as revealed by circular dichroism experiments, although nuclear magnetic resonance (NMR) experiments showed that the TAR binding site is the

  RNA 是一个主要的药物靶点，但调节 RNA 功能的小分子的设计仍然是一个巨大的挑战。在这种情况下，研究了一系列结构同源的“聚酰胺氨基酸”（PAA）作为 HIV-1 反式激活反应（TAR）RNA 配体。一项广泛的热力学研究揭示了焓-熵补偿现象的发生，导致所有 PAA 的 TAR 亲和力非常接近。然而，根据它们的结构，它们的结合模式和它们与 Tat 片段竞争的能力有很大不同。令人惊讶的是，与 TAR 形成松散复合物的 PAA 比形成紧密复合物的 PAA 更强，热变性研究表明松散复合物比紧密复合物更稳定。这可能与圆二色性实验揭示的松散和紧密配体诱导不同的 RNA 构象变化有关，尽管核磁共振 (NMR) 实验表明 TAR 结合位点在所有情况下都是相同的。最后，一些松散的 PAA 也显示出对 HIV 感染细胞的有希望的抑制活性。总之，这些结果有助于更好地理解 RNA 相互作用模式，这对于设计相关 RNA
• Nonpeptide Integrin Antagonists: RGD Mimetics Incorporating Substituted Azabicycloalkanes as Amino Acid Replacements
  作者：Leonardo Manzoni、Michele Bassanini、Laura Belvisi、Ilaria Motto、Carlo Scolastico、Massimo Castorina、Claudio Pisano

  DOI：10.1002/ejoc.200600840

  日期：2007.3

  Azabicyclo[4.3.0]alkanes appropriately substituted on both cycles have been synthesized as potential scaffold mimics of the RGD signaling motif of integrin. Two sets of functionalized azabicycloalkanes have been examined. In vitro assays established that 21 has a good affinity specifically for αvβ3. (© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)

  在两个循环中适当取代的氮杂双环 [4.3.0] 烷烃已被合成为整合素 RGD 信号基序的潜在支架模拟物。已经检查了两组官能化的氮杂双环烷烃。体外试验确定 21 对 αvβ3 具有良好的亲和力。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)