Role of hydrogen bonding in ligand interaction with the N-methyl-D-aspartate receptor ion channel
作者:Paul D. Leeson、Robert W. Carling、Kim James、Julian D. Smith、Kevin W. Moore、Erik H. F. Wong、Raymond Baker
DOI:10.1021/jm00167a005
日期:1990.5
available structurally rigid dibenzoazabicyclo[x.y.z]alkanes, by using molecular modeling techniques, uncovered a highly significant correlation between affinity and a proposed ligand-active site hydrogen bonding vector (r = 0.950, p less than 0.001). These results are used to generate a pharmacophore of the MK-801 recognition site/PCP receptor, which accounts for the binding of all of the known ligands
取代[3H] MK-801(dizocilpine,1)与大鼠脑膜的结合已用于评估与1相关的新型二苯并环烯胺对N上离子通道结合位点(也称为苯环利定或PCP受体)的亲和力-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)亚型的兴奋性氨基酸受体。与许多其他在中枢神经系统中起作用的药物一样,这些化合物包含疏水性芳族部分和碱性氮原子。这些配体的构象刚度提供了独特的机会来评估影响活性部位识别的特定几何性质的重要性,特别是氮原子在氢键相互作用中的作用。1和环同源的环辛烯胺的烃取代类似物的相对亲和力(IC50)说明了芳基环和C-5甲基的大小受限的疏水键合的重要性。通过使用分子建模技术对一系列10种可用的结构刚性二苯并氮杂双环[xyz]烷烃的结合进行分析,发现亲和力与拟议的配体-活性位点氢键载体之间存在高度显着相关性(r = 0.950,p小于0.001)。这些结果用于产生MK-801识别位点/ PCP受体的药效基团,其解