N-(5-cyano-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl)pivalamide | 1000982-07-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并嘧啶类
• 英文名称: N-(5-cyano-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl)pivalamide
• 英文别名: N-(5-cyano-4-oxo-3,7-dihydropyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2,2-dimethylpropanamide
• CAS: 1000982-07-9
• 化学式: C₁₂H₁₃N₅O₂
• 分子量: 259.268
• InChiKey: CDIKDZNKOAGFFX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(5-cyano-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl)pivalamide 在 苄基三乙基氯化铵 、 三氯氧磷 作用下， 以 N,N-二甲基乙酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 N-(4-氯-5-氰基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-2,2-二甲基丙酰胺
  参考文献：
  名称：

  鸟嘌呤修饰的氟化无环核苷膦酸酯衍生物的合成及其抗HIV活性。

  摘要：

  描述了其（R）和（S）对映体纯净形式的一系列前所未有的核碱基修饰的3-氟-2-（膦氧基甲氧基）丙基（FPMP）无环核苷的制备。合成侧重于Mitsunobu烷基化反应，以构建手性氟化侧链残基与6-或7-修饰的鸟嘌呤类似物之间的CN（9）键。FPMP-7-脱氮鸟嘌呤的前药还通过将相应的膦酸官能团与（双）二甲基天门冬氨酸酰胺基团衍生化而合成，从而导致了针对1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）的中等活性。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201800532
• 作为产物：
  描述：

  三甲基乙酰氯 、 2-氨基-4-氧代-4,7-二氢-3H-吡咯并[2,3-D]嘧啶-5-甲腈 在 三乙胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 以80.28%的产率得到N-(5-cyano-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl)pivalamide
  参考文献：
  名称：

  通过建模，底物和酶工程靶向大肠杆菌腈还原酶QueF的底物结合位点

  摘要：

  腈还原酶QueF催化将2-氨基-5-氰基吡咯并[2,3- d ]嘧啶-4-酮（preQ 0）还原为2-氨基-5-氨基甲基吡咯并[2,3 - d ]嘧啶-4-酮（preQ 1）在超修饰核苷quesusine的生物合成途径中。它是已知的唯一一种将腈还原为相应的伯胺的酶，因此可以扩大腈的生物催化反应工具箱。为了评估这种新的氧化还原酶在生物催化反应中的应用，研究其底物范围是必要的。我们在这里报告对大肠杆菌的腈还原酶QueF的活性位点结合特性和底物范围的研究。具有简单腈结构的筛选显示了高底物特异性。因此，根据大肠杆菌QueF的新同源性模型以及天然和非天然底物的复杂结构模型，确定了底物与活性位点的结合相互作用。合成了天然底物preQ 0的各种结构类似物，并用来自大肠杆菌的野生型QueF和几个活性位点突变体进行了筛选。已显示两个氨基酸残基Cys190和Asp197在催化机理中起重要作用。通过使用野生型和

  DOI：

  10.1002/chem.201300163

文献信息

• Stereoselective synthesis of carbocyclic analogues of the nucleoside Q precursor (PreQ₀)
  作者：Sabin Llona-Minguez、Simon P Mackay

  DOI：10.3762/bjoc.10.135

  日期：——

  A convergent and stereoselective synthesis of chiral cyclopentyl- and cyclohexylamine derivatives of nucleoside Q precursor (PreQ0) has been accomplished. This synthetic route allows for an efficient preparation of 4-substituted analogues with interesting three-dimensional character, including chiral cyclopentane-1,2-diol and -1,2,3-triol derivatives. This unusual substitution pattern provides a useful

  已经完成了核苷 Q 前体 (PreQ0) 的手性环戊基和环己胺衍生物的收敛和立体选择性合成。这种合成路线允许有效制备具有有趣的三维特征的 4 取代类似物，包括手性 cyclopentane-1,2-diol 和 -1,2,3-triol 衍生物。这种不寻常的取代模式为发现新的生物活性分子提供了一个有用的起点。
• Structure-Based Design and Synthesis of Antiparasitic Pyrrolopyrimidines Targeting Pteridine Reductase 1
  作者：Abedawn I. Khalaf、Judith K. Huggan、Colin J. Suckling、Colin L. Gibson、Kirsten Stewart、Federica Giordani、Michael P. Barrett、Pui Ee Wong、Keri L. Barrack、William N. Hunter

  DOI：10.1021/jm500483b

  日期：2014.8.14

  The treatment of Human African trypanosomiasis remains a major unmet health need in sub-Saharan Africa. Approaches involving new molecular targets are important; pteridine reductase 1 (PTR1), an enzyme that reduces dihydrobiopterin in Trypanosoma spp., has been identified as a candidate target, and it has been shown previously that substituted pyrrolo[2,3-d]pyrimidines are inhibitors of PTR1 from Trypanosoma

  非洲人类锥虫病的治疗仍然是撒哈拉以南非洲地区未满足的主要健康需求。涉及新分子目标的方法很重要；蝶啶还原酶 1 (PTR1) 是一种在锥虫属中减少二氢生物蝶呤的酶，已被确定为候选靶标，之前已表明取代的吡咯并 [2,3- d ] 嘧啶是布氏锥虫PTR1 的抑制剂( J. Med. Chem. 2010 , 53 , 221–229)。在本研究中，61 个新的吡咯并 [2,3- d]嘧啶已经制备，设计了 23 种与 PTR1 复合的化合物的新晶体结构，并在屏幕上评估了对 PTR1 的酶抑制活性和体外抗锥虫活性。八种化合物在两个筛选中都具有足够的活性，可以进行体内评估。因此，尽管获得了小鼠 I 期疾病模型中锥虫杀灭活性的证据，但这些化合物对小鼠的毒性太大，无法进一步开发。
• Design and Synthesis of Pyrrolo[2,3-<i>d</i>]pyrimidine-Derived Leucine-Rich Repeat Kinase 2 (LRRK2) Inhibitors Using a Checkpoint Kinase 1 (CHK1)-Derived Crystallographic Surrogate
  作者：Douglas S. Williamson、Garrick P. Smith、Gitte K. Mikkelsen、Thomas Jensen、Pamela Acheson-Dossang、Lassina Badolo、Simon T. Bedford、Victoria Chell、I-Jen Chen、Pawel Dokurno、Morten Hentzer、Samantha Newland、Stuart C. Ray、Terry Shaw、Allan E. Surgenor、Lindsey Terry、Yikang Wang、Kenneth V. Christensen

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00720

  日期：2021.7.22

  Inhibitors of leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) and mutants, such as G2019S, have potential utility in Parkinson’s disease treatment. Fragment hit-derived pyrrolo[2,3-d]pyrimidines underwent optimization using X-ray structures of LRRK2 kinase domain surrogates, based on checkpoint kinase 1 (CHK1) and a CHK1 10-point mutant. (2R)-2-Methylpyrrolidin-1-yl derivative 18 (LRRK2 G2019S cKi 0.7 nM, LE

  富含亮氨酸重复激酶 2 (LRRK2) 和突变体的抑制剂，如 G2019S，在帕金森病治疗中具有潜在的效用。基于检查点激酶 1 (CHK1) 和 CHK1 10 点突变体，使用 LRRK2 激酶结构域替代物的 X 射线结构对片段命中衍生的吡咯并[2,3- d ]嘧啶进行优化。(2 R )-2-甲基吡咯烷-1-基衍生物18 (LRRK2 G2019S c K i 0.7 nM, LE 0.66) 被鉴定，其效力增加，与18 /CHK1 10-pt的 X 射线结构一致。突变体显示接近 Ala147 的 2-甲基取代基（LRRK2 中的 Ala2016）。18 的进一步结构导向阐述给出了 2-[(1,3-二甲基-1 H-吡唑-4-基)氨基]衍生物32。32 的优化提供了非对映异构的 oxolan-3-yl 衍生物44和45，它们表现出良好的体外PK 特征，尽管它们在体内PK 特征中显示出物种断开连接，以及
• A practical synthesis of archaeosine and its base
  作者：Natsuhisa Oka、Akane Fukuta、Kaori Ando

  DOI：10.1016/j.tet.2018.08.003

  日期：2018.9

  A practical synthetic route to 7-formamidino-7-deazaguanosine (archaeosine), a hypermodified nucleoside observed in archaeal tRNA, has been developed, which involves the addition of hydroxylamine to the cyano group of 7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0-nucleoside) and a subsequent Pd-catalyzed hydrogenation. PreQ0-nucleoside was obtained from an optimized β-selective glycosylation developed by Hocek et al

  一种实用的合成路线至7-亚胺甲基氨-7-脱氮（archaeosine），在古细菌的tRNA中观察到的hypermodified核苷，已经被开发出来，其中包括加入羟胺至氰基-7-氰基-7-脱氮的（PREQ 0 -核苷）和随后的Pd催化的氢化反应。从Hocek等人开发的优化的β-选择性糖基化获得PreQ 0-核苷。随后从其前体7-氰基-7-脱氮鸟嘌呤（preQ 0）以高收率合成相应的古植物碱。
• [EN] PRODRUGS OF FLUORINATED ACYCLIC NUCLEOSIDE PHOSPHONATES<br/>[FR] PROMÉDICAMENTS DE PHOSPHONATES DE NUCLÉOSIDES ACYCLIQUES FLUORÉS
  申请人：UNIV LEUVEN KATH

  公开号：WO2018055071A1

  公开（公告）日：2018-03-29

  The present invention relates to novel phosphonoamidate prodrugs of acyclic nucleoside phosphonates with a 3-fluoro-2-(phosphonomethoxy)propyl side chain. The invention also relates to the use of these novel phosphonate-modified nucleosides to treat or prevent viral infections and their use to manufacture a medicine to treat or prevent viral infections, particularly infections with viruses such as the hepatitis B virus, the human immunodeficiency virus, the human cytomegalovirus and the varicella zoster virus.

  本发明涉及具有3-氟-2-(磷酸甲氧基)丙基侧链的无环核苷酸磷酸酯的新型磷酸酯酰胺酯前药。该发明还涉及利用这些新型磷酸酯修饰的核苷酸来治疗或预防病毒感染，以及用于制造用于治疗或预防病毒感染的药物，特别是用于治疗或预防乙型肝炎病毒、人类免疫缺陷病毒、人类巨细胞病毒和水痘带状疱疹病毒等病毒感染。