bind proteins, we require cyclic peptides (or peptidomimetics) that are severely constrained such that they adopt one predominant conformation in solution. This paper describes syntheses of the 13-membered cyclic tetrapeptides 1 containing aminopyrrolidine carboxyl (APC) residues. A linear precursor was prepared and used to determine optimal conditions for cyclization of that substrate. A special linker
作为设计与蛋白质结合的小分子的程序的一部分,我们需要严格限制的环肽(或拟肽),以便它们在溶液中采用一种主要的构象。本文描述了13元环四肽1的合成含有
氨基
吡咯烷羧基(APC)残基。制备了线性前体并用于确定该底物环化的最佳条件。制备了特殊的接头,以使类似的线性拟肽在固相上环化,并且溶液相环化条件也显示适用于此。然后使用立体
化学变化来确定用于线性前体环化的理想APC配置(在固相上,使用先前确定的条件)。因此,制备了一系列代表化合物1的化合物。
DMSO溶液中代表性化合物的构象研究主要使用(i)NOE研究,(ii)使用不受实验限制的淬灭分子动力学模拟和(iii)具有NMR限制的MacroModel计算进行。所有这三种策略都得出了相同的结论:基于1的分子主链倾向于在溶液中采用一种优先构象,并且可以从所涉及的
α-氨基酸的立体
化学中预测构象。