1-(β-D-arabinofuranosyl)-5-phenylcytosine | 178616-31-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(β-D-arabinofuranosyl)-5-phenylcytosine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R,3S,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-phenylpyrimidin-2-one
• CAS: 178616-31-4
• 化学式: C₁₅H₁₇N₃O₅
• 分子量: 319.317
• InChiKey: NXZDBARVIPFCNZ-NRWUCQMLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  乙酸酐 、 1-(β-D-arabinofuranosyl)-5-phenylcytosine 以 吡啶 为溶剂， 反应 5.0h， 以34%的产率得到5-phenyl-1-(2,3,5-tri-O-acetyl-β-D-arabinofuranosyl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 5-Phenylcytosine Nucleoside Derivatives

  摘要：

  使用锡四氯化物催化，将硅化5-苯基胞嘧啶与1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰-D-核糖反应，随后进行甲醇解，得到5-苯基胞苷（2）。该化合物与乙腈中的亚磺酰氯反应，生成环状亚磺酸（3），在二甲基甲酰胺中加热后转化为2,2'-脱水-1-(β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（4）。将化合物2与亚磺酰氯在回流下反应，得到5'-氯-5'-脱氧-2',3'-环状亚磺酸（5）。在二甲基甲酰胺中加热，得到5'-氯-2,2'-脱水衍生物（6），温和的碱性水解导致5'-氯-5'-脱氧-5-苯基胞苷（7）。5-苯基-2,2'-脱水胞苷（4）的碱性水解得到5-苯基胞苷阿拉伯苷（8），而2,2'-脱水衍生物（6）则生成1-(5-氯-5-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（11）。在较高温度下，最终反应产物为2,5'-脱水-5-苯基胞苷（12）。5'-氯-5'-脱氧核苷（7）和（11）与三正丁基锡反应，得到5'-脱氧核糖和5'-脱氧阿拉伯核糖衍生物（15）和（16）。将5-苯基胞苷（2）转化为N4-醋酸酯（17），使用乙酸酐和氢溴酸在乙酸中进一步反应，得到2'-溴和3'-溴的过乙酰化混合物（18）和（19）。与锌/铜偶对反应，得到5'-O-乙酰基-5-苯基-2',3'-双去氢衍生物（20）和2',3',5'-三-O-乙酰基-5-苯基胞嘧啶（21）。化合物（20）去保护后得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（22）。化合物（20）在钯催化下进行催化氢化，随后去保护2',3'-二脱氧衍生物（23）得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pentofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（24）。

  DOI：

  10.1135/cccc19960645
• 作为产物：
  描述：

  5-苯基胞苷 在 氯化亚砜 、 Dowex 1 (CO₃^2- form) 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 1-(β-D-arabinofuranosyl)-5-phenylcytosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 5-Phenylcytosine Nucleoside Derivatives

  摘要：

  使用锡四氯化物催化，将硅化5-苯基胞嘧啶与1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰-D-核糖反应，随后进行甲醇解，得到5-苯基胞苷（2）。该化合物与乙腈中的亚磺酰氯反应，生成环状亚磺酸（3），在二甲基甲酰胺中加热后转化为2,2'-脱水-1-(β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（4）。将化合物2与亚磺酰氯在回流下反应，得到5'-氯-5'-脱氧-2',3'-环状亚磺酸（5）。在二甲基甲酰胺中加热，得到5'-氯-2,2'-脱水衍生物（6），温和的碱性水解导致5'-氯-5'-脱氧-5-苯基胞苷（7）。5-苯基-2,2'-脱水胞苷（4）的碱性水解得到5-苯基胞苷阿拉伯苷（8），而2,2'-脱水衍生物（6）则生成1-(5-氯-5-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（11）。在较高温度下，最终反应产物为2,5'-脱水-5-苯基胞苷（12）。5'-氯-5'-脱氧核苷（7）和（11）与三正丁基锡反应，得到5'-脱氧核糖和5'-脱氧阿拉伯核糖衍生物（15）和（16）。将5-苯基胞苷（2）转化为N4-醋酸酯（17），使用乙酸酐和氢溴酸在乙酸中进一步反应，得到2'-溴和3'-溴的过乙酰化混合物（18）和（19）。与锌/铜偶对反应，得到5'-O-乙酰基-5-苯基-2',3'-双去氢衍生物（20）和2',3',5'-三-O-乙酰基-5-苯基胞嘧啶（21）。化合物（20）去保护后得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（22）。化合物（20）在钯催化下进行催化氢化，随后去保护2',3'-二脱氧衍生物（23）得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pentofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（24）。

  DOI：

  10.1135/cccc19960645

文献信息

• Synthesis of 5-Phenylcytosine Nucleoside Derivatives
  作者：Marcela Krečmerová、Hubert Hřebabecký、Antonín Holý

  DOI：10.1135/cccc19960645

  日期：——

  Reaction of silylated 5-phenylcytosine with 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-D-ribose, catalyzed with tin tetrachloride, and subsequent methanolysis afforded 5-phenylcytidine (2). This compound reacted with thionyl chloride in acetonitrile to give cyclic sulfite 3 which on heating in dimethylformamide was converted into 2,2'-anhydro-1-(β-D-arabinofuranosyl)-5-phenylcytosine (4). Analogous reaction of compound 2 with thionyl chloride at reflux gave 5'-chloro-5'-deoxy-2',3'-cyclic sulfite 5. Its heating in dimethylformamide afforded 5'-chloro-2,2'-anhydro derivative 6, mild alkaline hydrolysis led to 5'-chloro-5'-deoxy-5-phenylcytidine (7). Alkaline hydrolysis of 5-phenyl-2,2'-anhydrocytidine (4) gave 5-phenylcytosine arabinoside 8, whereas the 2,2'-anhydro derivative 6 afforded 1-(5-chloro-5-deoxy-β-D-arabinofuranosyl)-5-phenylcytosine (11). At higher temperature, the final reaction product was 2,5'-anhydro-5-phenylcytidine (12). 5'-Chloro-5'-deoxynucleosides 7 and 11 reacted with tri-n-butyl- stannane to give 5'-deoxyribofuranosyl and 5'-deoxyarabinofuranosyl derivatives 15 and 16. 5-Phenylcytidine (2) was converted into the N⁴-acetate 17 with acetic anhydride. Further reaction with acetic anhydride and hydrogen bromide in acetic acid afforded a mixture of peracetylated 2'-bromo and 3'-bromo derivatives 18 and 19. Reaction with Zn/Cu couple gave 5'-O-acetyl-5-phenyl-2',3'-didehydro derivative 20 and 2',3',5'-tri-O-acetyl-5-phenylcytidine (21). Compound 20 was deblocked to 1-(2,3-dideoxy-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)-5-phenylcytosine (22). Catalytic hydrogenation of compound 20 over palladium and subsequent deblocking of the protected 2',3'-dideoxy derivative 23 gave 1-(2,3-dideoxy-β-D-glycero-pentofuranosyl)-5-phenylcytosine (24).

  使用锡四氯化物催化，将硅化5-苯基胞嘧啶与1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰-D-核糖反应，随后进行甲醇解，得到5-苯基胞苷（2）。该化合物与乙腈中的亚磺酰氯反应，生成环状亚磺酸（3），在二甲基甲酰胺中加热后转化为2,2'-脱水-1-(β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（4）。将化合物2与亚磺酰氯在回流下反应，得到5'-氯-5'-脱氧-2',3'-环状亚磺酸（5）。在二甲基甲酰胺中加热，得到5'-氯-2,2'-脱水衍生物（6），温和的碱性水解导致5'-氯-5'-脱氧-5-苯基胞苷（7）。5-苯基-2,2'-脱水胞苷（4）的碱性水解得到5-苯基胞苷阿拉伯苷（8），而2,2'-脱水衍生物（6）则生成1-(5-氯-5-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（11）。在较高温度下，最终反应产物为2,5'-脱水-5-苯基胞苷（12）。5'-氯-5'-脱氧核苷（7）和（11）与三正丁基锡反应，得到5'-脱氧核糖和5'-脱氧阿拉伯核糖衍生物（15）和（16）。将5-苯基胞苷（2）转化为N4-醋酸酯（17），使用乙酸酐和氢溴酸在乙酸中进一步反应，得到2'-溴和3'-溴的过乙酰化混合物（18）和（19）。与锌/铜偶对反应，得到5'-O-乙酰基-5-苯基-2',3'-双去氢衍生物（20）和2',3',5'-三-O-乙酰基-5-苯基胞嘧啶（21）。化合物（20）去保护后得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（22）。化合物（20）在钯催化下进行催化氢化，随后去保护2',3'-二脱氧衍生物（23）得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pentofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（24）。