1-(4-amino-2-methyl-pyrimidin-5-ylmethyl)-pyridinium | 54997-93-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(4-amino-2-methyl-pyrimidin-5-ylmethyl)-pyridinium
• 英文别名: 1-[(4-Amino-2-methylpyrimidin-5-yl)methyl]pyridinium；2-methyl-5-(pyridin-1-ium-1-ylmethyl)pyrimidin-4-amine
• CAS: 54997-93-2
• 化学式: C₁₁H₁₃N₄
• 分子量: 201.251
• InChiKey: SPQICHFDXHERAC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  55.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  吡啶 、 硫胺素 生成 4-甲基-5-(beta-羟乙基)噻唑 、 1-(4-amino-2-methyl-pyrimidin-5-ylmethyl)-pyridinium
  参考文献：
  名称：

  来自解氨化芽孢杆菌的硫胺素-I的晶体结构，分辨率为2.0A。

  摘要：

  硫胺素-I催化硫胺素的噻唑部分被多种亲核试剂例如吡啶，苯胺，儿茶酚，喹啉和半胱氨酸的取代。通过多次同晶置换以2.5 A的分辨率确定了来自硫解芽孢杆菌的酶的晶体结构，并将其精制为0.195的R因子（Rfree = 0.272）。通过从第二种晶体形式进行分子置换，以2.0 A的分辨率确定了另外两种结构，一种是天然的，一种是含有共价键合的抑制剂，并被精制为R系数0.205和0.217（Rfree = 0.255和0.263）。整体结构包含两个由大裂缝分开的α/β型结构域。Cys113位于裂口的底部，以前被确定为关键的活性位点亲核试剂。具有共价结合的硫胺素类似物的结构，用作基于机制的灭活剂，它确定了活性位点的位置。Glu241似乎充当了一个活性位点碱基，以增加Cys113的亲核性。制备了突变体Glu241Gln，其没有活性。硫胺素-I在序列数据库中没有显示与其他蛋白质的序列同一性，但是三维结构显示

  DOI：

  10.1021/bi981673l

文献信息

• Extracellular thiaminase I of Bacillus thiaminolyticus. I. Purification and physicochemical properties
  作者：James L. Wittliff、Robert L. Airth

  DOI：10.1021/bi00842a032

  日期：1968.2.1