Sequence-specific cleavage of DNA by N-bromoacetyldistamycin. Product and kinetic analyses
作者:Brenda F. Baker、Peter B. Dervan
DOI:10.1021/ja00189a054
日期:1989.3
N-Bromoacetyldistamycin (BO) is a designed molecule with two structural domains with distinct functions: sequence specific binding to double helical DNA and cleavage of the DNA backbone. An electrophilic bromoacetyl group is appended to the amino end of the tripeptide from the natural product distamycin A. Footprinting studies reveal that N-bromoacetyldistamycin binds within minutes to a 167 base pair
N-溴乙酰双霉素 (BO) 是一种设计好的分子,具有两个具有不同功能的结构域:与双螺旋 DNA 的序列特异性结合和 DNA 主链的切割。亲电溴乙酰基团附加到来自天然产物多他霉素 A 的三肽的氨基末端。 足迹研究表明,N-溴乙酰双霉素在几分钟内与 167 个碱基对 (bp) 限制性片段结合,位于四个富含 A、T 的位点 5 个碱基对尺寸为 5'-TTTAA、GTTTA、AAATT 和 GAAAT-3'。在 37 °C 下反应 5 小时后,该 167 bp 限制性片段中 GTTTA 位点的单个腺嘌呤处发生切割,并遵循哌啶处理程序。BD 的共价连接发生在腺嘌呤的 N3。3-(乙酰基二霉素)腺嘌呤是 BD 与 15 碱基对寡核苷酸双链体 5'-CGGTAGTTTATCACA-3' 在 37 °C 下反应释放的产物。哌啶处理后切割位点的 3' 和 5' DNA 末端是磷酸基团。BD 对双链 DNA