5-chlorochromane-3-carboxylic acid | 1269695-63-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: 5-chlorochromane-3-carboxylic acid
• 英文别名: 5-chlorochroman-3-carboxylic acid；5-Chlorochroman-3-carboxylic acid；5-chloro-3,4-dihydro-2H-chromene-3-carboxylic acid
• CAS: 1269695-63-7
• 化学式: C₁₀H₉ClO₃
• 分子量: 212.633
• InChiKey: LJVZJTXYAQJLQD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  46.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 海关编码：
  2932999099

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-chlorochromane-3-carboxylic acid 在 N-甲基吗啉 、 二氯乙酸 、 sodium nitrate 、 1-羟基苯并三唑 、 1,2-二氯乙烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 5-chloro-N,N-dimethyl-6-nitrochroman-3-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Syntheses and Binding Testing of N1-Alkylamino-Substituted 2-Aminobenzimidazole Analogues Targeting the Hepatitis C Virus Internal Ribosome Entry Site

  摘要：

  我们合成了一系列 2-氨基苯并咪唑类似物，并测试了它们与丙型肝炎病毒（HCV）内部核糖体进入位点（IRES）中先前确定的病毒翻译抑制剂 RNA 靶点的结合情况。新抑制剂化合物的合成采用了一种高度趋同的策略，该策略允许以较高的总产率（8 个步骤，4-22%）加入不同的三级氨基取代基。结构-活性关系（SAR）研究的重点是在抑制剂结合部位与 RNA 主干发生氢键作用的叔胺取代基。SAR 研究进一步与硅学对接实验相关联。类似化合物显示出良好的活性（半数最大有效浓度，EC50：21-89µM）。合成的类似物的结构及其结合模式的相关性为探索选择性靶向 HCV IRES IIa 亚域所需的参数提供了机会，该亚域在 HCV 翻译过程中起着 RNA 构象转换的作用。

  DOI：

  10.1071/ch19526
• 作为产物：
  描述：

  5-chloro-2H-chromene-3-carbaldehyde 在 sodium amalgam 、 silver nitrate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 5-chlorochromane-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  An Efficient New Route to Dihydropyranobenzimidazole Inhibitors of HCV Replication

  摘要：

  最近发现了一类二氢吡喃苯并咪唑抑制剂，具有以新方式对抗丙型肝炎病毒（HCV）的作用，它们与病毒RNA高度保守的5'非翻译区的IRES-IIa亚域结合，从而阻止核糖体启动翻译。然而，这些化合物的合成报道过程漫长且产率较低， intermediates的纯化则相当麻烦，而且该合成路线不利于库的构建。我们报告了一种精简的合成途径，能够显著提高产率，并且大多数中间体是晶体。此外，关键的可变侧链在合成后期引入，使得容易合成类似物以优化抗病毒活性。

  DOI：

  10.3390/molecules16010281

文献信息

• An Efficient New Route to Dihydropyranobenzimidazole Inhibitors of HCV Replication
  作者：Matthew A. Parker、Emily Satkiewicz、Thomas Hermann、B. Mikael Bergdahl

  DOI：10.3390/molecules16010281

  日期：——

  A class of dihydropyranobenzimidazole inhibitors was recently discovered that acts against the hepatitis C virus (HCV) in a new way, binding to the IRES-IIa subdomain of the highly conserved 5' untranslated region of the viral RNA and thus preventing the ribosome from initiating translation. However, the reported synthesis of these compounds is lengthy and low-yielding, the intermediates are troublesome to purify, and the route is poorly structured for the creation of libraries. We report a streamlined route to this class of inhibitors in which yields are far higher and most intermediates are crystalline. In addition, a key variable side chain is introduced late in the synthesis, allowing analogs to be easily synthesized for optimization of antiviral activity.

  最近发现了一类二氢吡喃苯并咪唑抑制剂，具有以新方式对抗丙型肝炎病毒（HCV）的作用，它们与病毒RNA高度保守的5'非翻译区的IRES-IIa亚域结合，从而阻止核糖体启动翻译。然而，这些化合物的合成报道过程漫长且产率较低， intermediates的纯化则相当麻烦，而且该合成路线不利于库的构建。我们报告了一种精简的合成途径，能够显著提高产率，并且大多数中间体是晶体。此外，关键的可变侧链在合成后期引入，使得容易合成类似物以优化抗病毒活性。
• Syntheses and Binding Testing of N1-Alkylamino-Substituted 2-Aminobenzimidazole Analogues Targeting the Hepatitis C Virus Internal Ribosome Entry Site
  作者：David Schmit、Urszula Milewicz、Mark A. Boerneke、Scott Burley、Kevin Walsworth、Joann Um、David Hecht、Thomas Hermann、B. Mikael Bergdahl

  DOI：10.1071/ch19526

  日期：——

  A series of 2-aminobenzimidazole analogues have been synthesised and tested for binding to a previously established RNA target for viral translation inhibitors in the internal ribosome entry site (IRES) of the hepatitis C virus (HCV). Synthesis of new inhibitor compounds followed a highly convergent strategy which allowed for incorporation of diverse tertiary amino substituents in high overall yields (eight-steps, 4–22%). Structure–activity relationship (SAR) studies focussed on the tertiary amine substituent involved in hydrogen bonding with the RNA backbone at the inhibitor binding site. The SAR study was further correlated with in silico docking experiments. Analogous compounds showed promising activities (half maximal effective concentration, EC50: 21–89µM). Structures of the synthesised analogues and a correlation to their mode of binding, provided the opportunity to explore parameters required for selective targeting of the HCV IRES at the subdomain IIa which acts as an RNA conformational switch in HCV translation.

  我们合成了一系列 2-氨基苯并咪唑类似物，并测试了它们与丙型肝炎病毒（HCV）内部核糖体进入位点（IRES）中先前确定的病毒翻译抑制剂 RNA 靶点的结合情况。新抑制剂化合物的合成采用了一种高度趋同的策略，该策略允许以较高的总产率（8 个步骤，4-22%）加入不同的三级氨基取代基。结构-活性关系（SAR）研究的重点是在抑制剂结合部位与 RNA 主干发生氢键作用的叔胺取代基。SAR 研究进一步与硅学对接实验相关联。类似化合物显示出良好的活性（半数最大有效浓度，EC50：21-89µM）。合成的类似物的结构及其结合模式的相关性为探索选择性靶向 HCV IRES IIa 亚域所需的参数提供了机会，该亚域在 HCV 翻译过程中起着 RNA 构象转换的作用。
• Structure-based virtual screening of unbiased and RNA-focused libraries to identify new ligands for the HCV IRES model system
  作者：Elisabeth Kallert、Laura Almena Rodriguez、Jan-Åke Husmann、Kathrin Blatt、Christian Kersten

  DOI：10.1039/d3md00696d

  日期：——

  Using structure-based virtual screening, FRET and MST assays, novel ligands of the hepatitis C virus internal ribosome entry site were identified. This proof-of-concept study demonstrated the feasibility of RNA–ligand docking for hit identification.