methyl (E)-6-(((allyloxy)carbonyl)amino)-5-methyl-6-phenylhex-3-enoate | 1098197-64-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl (E)-6-(((allyloxy)carbonyl)amino)-5-methyl-6-phenylhex-3-enoate
• 英文别名: (5R,6S,E)-methyl 6-(allyloxycarbonylamino)-5-methyl-6-phenylhex-3-enoate；methyl (E,5R,6S)-5-methyl-6-phenyl-6-(prop-2-enoxycarbonylamino)hex-3-enoate
• CAS: 1098197-64-8
• 化学式: C₁₈H₂₃NO₄
• 分子量: 317.385
• InChiKey: WKFHOKWRWFXMPU-KPBXEYHCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  64.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (E)-6-(((allyloxy)carbonyl)amino)-5-methyl-6-phenylhex-3-enoate 在 盐酸 、 四(三苯基膦)钯 、 1,3-二甲基巴比妥酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 10.75h， 生成
  参考文献：
  名称：

  发现紫杉醇/嘧啶核糖核酸内切酶1的大环抑制剂。

  摘要：

  apurinic / apyrimidinic核酸内切酶1（APE1）是必不可少的碱基切除修复酶，在许多癌症中均被上调，有助于对用DNA烷化剂或氧化剂治疗的肿瘤产生抵抗力，并且最近被确定为重要的治疗靶点。在这项工作中，我们通过实验确定了APE1高分辨率晶体结构中小有机分子结合的热点，并通过使用FTMAP分析（http://ftmap.bu.edu/）进行了计算。在这些热点的引导下，停靠了一个类似药物的大环化合物文库，然后筛选了对APE1核酸内切酶活性的抑制作用。在迭代过程中，热点引导对接，APE1核酸内切酶抑制作用的表征以及癌细胞的细胞毒性被用于设计下一代大环化合物。为了评估细胞中的靶标选择性，分析了选定的大环化合物对DNA损伤的调节作用。综上所述，我们的研究表明，大环化合物代表了一种有前途的抑制癌细胞中APE1的化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b01529
• 作为产物：
  描述：

  烯丙基氨基甲酸酯 、 苯甲醛 、 (E)-(3R)-Methyl 3-(dimethylphenylsilyl)hex-4-enoate 在 对甲苯磺酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 以66%的产率得到methyl (E)-6-(((allyloxy)carbonyl)amino)-5-methyl-6-phenylhex-3-enoate
  参考文献：
  名称：

  使用大环的反应发现：大环双内酰胺的跨环环化

  摘要：

  大环双内酰胺是通过高烯丙基氨基酯的环二聚反应合成的，采用 Zr(IV) 催化的酯-酰胺交换方案。已确定碱基介导的环环化以良好的产率和非对映选择性访问双环 [5-11] 和三环 [5-8-5] 框架。初步机理研究支持烯烃异构化 - 分子内共轭加成途径。

  DOI：

  10.1021/ol802729f

文献信息

• Discovery of Macrocyclic Inhibitors of Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 1
  作者：Richard Trilles、Dmitri Beglov、Qiujia Chen、Hongzhen He、Randall Wireman、April Reed、Spandan Chennamadhavuni、James S. Panek、Lauren E. Brown、Sandor Vajda、John A. Porco、Mark R. Kelley、Millie M. Georgiadis

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b01529

  日期：2019.2.28

  for inhibition of APE1 endonuclease activity. In an iterative process, hot-spot-guided docking, characterization of inhibition of APE1 endonuclease, and cytotoxicity of cancer cells were used to design next generation macrocycles. To assess target selectivity in cells, selected macrocycles were analyzed for modulation of DNA damage. Taken together, our studies suggest that macrocycles represent a promising

  apurinic / apyrimidinic核酸内切酶1（APE1）是必不可少的碱基切除修复酶，在许多癌症中均被上调，有助于对用DNA烷化剂或氧化剂治疗的肿瘤产生抵抗力，并且最近被确定为重要的治疗靶点。在这项工作中，我们通过实验确定了APE1高分辨率晶体结构中小有机分子结合的热点，并通过使用FTMAP分析（http://ftmap.bu.edu/）进行了计算。在这些热点的引导下，停靠了一个类似药物的大环化合物文库，然后筛选了对APE1核酸内切酶活性的抑制作用。在迭代过程中，热点引导对接，APE1核酸内切酶抑制作用的表征以及癌细胞的细胞毒性被用于设计下一代大环化合物。为了评估细胞中的靶标选择性，分析了选定的大环化合物对DNA损伤的调节作用。综上所述，我们的研究表明，大环化合物代表了一种有前途的抑制癌细胞中APE1的化合物。
• Reaction Discovery Employing Macrocycles: Transannular Cyclizations of Macrocyclic Bis-lactams
  作者：Chong Han、Sathish Rangarajan、Alicia C Voukides、Aaron B. Beeler、Richard Johnson、John A. Porco

  DOI：10.1021/ol802729f

  日期：2009.1.15

  Macrocyclic bis-lactams have been synthesized by cyclodimerization of homoallylic amino esters employing a Zr(IV)-catalyzed ester-amide exchange protocol. Base-mediated transannular cyclizations have been identified to access both bicyclic [5-11] and tricyclic [5-8-5] frameworks in good yield and diastereoselectivity. Preliminary mechanistic studies support an olefin isomerization−intramolecular conjugate

  大环双内酰胺是通过高烯丙基氨基酯的环二聚反应合成的，采用 Zr(IV) 催化的酯-酰胺交换方案。已确定碱基介导的环环化以良好的产率和非对映选择性访问双环 [5-11] 和三环 [5-8-5] 框架。初步机理研究支持烯烃异构化 - 分子内共轭加成途径。