allyl 2-(N-(2-(Fmoc)ethyl)-2-(6-(tert-butoxycarbonylamino)pyridin-3-yl)acetamido)acetate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: allyl 2-(N-(2-(Fmoc)ethyl)-2-(6-(tert-butoxycarbonylamino)pyridin-3-yl)acetamido)acetate
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl 3-[[2-[6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pyridin-3-yl]acetyl]-(2-oxo-2-prop-2-enoxyethyl)amino]propanoate
• 化学式: C₃₄H₃₇N₃O₇
• 分子量: 599.7
• InChiKey: IOCAXKDLDLIOCY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  124
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  allyl 2-(N-(2-(Fmoc)ethyl)-2-(6-(tert-butoxycarbonylamino)pyridin-3-yl)acetamido)acetate 、 N-乙基苯胺 在 四(三苯基膦)钯 乙酸乙酯 、 potassium hydrogensulfate 、 水 、 Brine 、 Sodium sulfate-III 、 silica gel 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以to give 0.24 g of 2 (79%)的产率得到2-(N-(2-(Fmoc)ethyl)-2-(6-(tert-butoxycarbonylamino)pyridin-3-yl)acetamido) acetic acid
  参考文献：
  名称：

  COMPOSITIONS AND METHODS FOR RECOGNITION OF RNA USING TRIPLE HELICAL PEPTIDE NUCLEIC ACIDS

  摘要：

  含有胸腺嘧啶和2-氨基吡啶（M）碱基的肽核酸，在生理条件下与双链RNA形成稳定且序列选择性的三联体。M修饰的PNA通过比同一DNA序列高两个数量级的亲和力，显示出独特的RNA选择性。初步结果表明，碱基修饰的PNA可以结合并识别microRNA的双螺旋前体。

  公开号：

  US20140206838A1

文献信息

• Compositions and methods for recognition of RNA using triple helical peptide nucleic acids
  申请人：The Research Foundation for the State University of New York

  公开号：US10260089B2

  公开（公告）日：2019-04-16

  Peptide nucleic acids containing thymidine and 2-aminopyridine (M) nucleobases formed stable and sequence selective triple helices with double stranded RNA at physiologically relevant conditions. The M-modified PNA displayed unique RNA selectivity by having two orders of magnitude higher affinity for the double stranded RNAs than for the same DNA sequences. Preliminary results suggested that nucleobase-modified PNA could bind and recognize double helical precursors of microRNAs.

  在生理相关条件下，含有胸苷和 2-氨基吡啶（M）核碱基的肽核酸与双链 RNA 形成了稳定且具有序列选择性的三螺旋。M 修饰的 PNA 对双链 RNA 的亲和力比对相同 DNA 序列的亲和力高两个数量级，显示出独特的 RNA 选择性。初步结果表明，核碱基修饰的 PNA 可以结合并识别 microRNA 的双螺旋前体。
• Compositions and methods for recognition of RNA using triple helix forming peptide nucleic acids
  申请人：The Research Foundation for The State University of New York

  公开号：US10385100B2

  公开（公告）日：2019-08-20

  Peptide nucleic acids containing thymidine and 2-aminopyridine (M) nucleobases formed stable and sequence selective triple helices with double stranded RNA at physiologically relevant conditions. The M-modified PNA displayed unique RNA selectivity by having two orders of magnitude higher affinity for the double stranded RNAs than for the same DNA sequences. Preliminary results suggested that nucleobase-modified PNA could bind and recognize double helical precursors of microRNAs.

  在生理相关条件下，含有胸苷和 2-氨基吡啶（M）核碱基的肽核酸与双链 RNA 形成了稳定且具有序列选择性的三螺旋。 M 修饰的 PNA 对双链 RNA 的亲和力比对相同 DNA 序列的亲和力高两个数量级，显示出独特的 RNA 选择性。 初步结果表明，核碱基修饰的 PNA 可以结合并识别 microRNA 的双螺旋前体。