1-<3-deoxy-3-C-(hydroxymethyl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>uracil | 130351-54-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-<3-deoxy-3-C-(hydroxymethyl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>uracil
• 英文别名: 3'-Hydroxymethyl Ara U；1-[(2R,3S,4S,5S)-3-hydroxy-4,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 130351-54-1
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₆
• 分子量: 258.231
• InChiKey: CCLQDVIPKKSCHR-MTSNSDSCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-<3-deoxy-3-C-(hydroxymethyl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>uracil 在 碘 、 硝酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 3.0h， 以97%的产率得到1-[3-脱氧-3-(羟甲基)-β-D-呋喃阿拉伯糖基]-5-碘嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷的合成及其抗病毒活性。

  摘要：

  已经合成了一系列的3'-支链糖核苷，特别是3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷，并将其评估为抗病毒剂。尿嘧啶和胸腺嘧啶的1-（2,3-环氧-5-O-三苯甲基-β-D-lyxo-五氟呋喃糖基）衍生物12和13分别与5,6-二氢-2-lithio-5-甲基-1,3,5-二噻嗪14分别提供相应的3'-官能化核苷15和16。用叔丁基二苯基甲硅烷基取代三苯甲基可高产率地水解3'-官能团，得到3'-脱氧-3'-C-甲酰基-β-D-阿拉伯糖基-戊呋喃糖基核苷21和22。甲硅烷基化得到1-（ 3-脱氧-3-C-甲酰基-β-D-lyxo-戊呋喃糖基）3'，5'-O-半缩醛核苷33和34。还原21和22的甲酰基，然后进行甲硅烷基化，分别产生3'-脱氧-3'-C-（羟甲基）-β-D-阿拉伯糖基-呋喃呋喃糖基）类似物7和8。将7的尿嘧啶碱基部分转化为5-碘尿嘧啶，然后转化为（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶，以提供B

  DOI：

  10.1021/jm00171a025
• 作为产物：
  描述：

  1-[(2R,3S,4S,5S)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]pyrimidine-2,4-dione 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.03h， 以89%的产率得到1-<3-deoxy-3-C-(hydroxymethyl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>uracil
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷的合成及其抗病毒活性。

  摘要：

  已经合成了一系列的3'-支链糖核苷，特别是3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷，并将其评估为抗病毒剂。尿嘧啶和胸腺嘧啶的1-（2,3-环氧-5-O-三苯甲基-β-D-lyxo-五氟呋喃糖基）衍生物12和13分别与5,6-二氢-2-lithio-5-甲基-1,3,5-二噻嗪14分别提供相应的3'-官能化核苷15和16。用叔丁基二苯基甲硅烷基取代三苯甲基可高产率地水解3'-官能团，得到3'-脱氧-3'-C-甲酰基-β-D-阿拉伯糖基-戊呋喃糖基核苷21和22。甲硅烷基化得到1-（ 3-脱氧-3-C-甲酰基-β-D-lyxo-戊呋喃糖基）3'，5'-O-半缩醛核苷33和34。还原21和22的甲酰基，然后进行甲硅烷基化，分别产生3'-脱氧-3'-C-（羟甲基）-β-D-阿拉伯糖基-呋喃呋喃糖基）类似物7和8。将7的尿嘧啶碱基部分转化为5-碘尿嘧啶，然后转化为（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶，以提供B

  DOI：

  10.1021/jm00171a025

文献信息

• 3'-Substituted methyl nucleosides as antiviral agents
  申请人：Bristol-Myers Squibb Company

  公开号：EP0391411A2

  公开（公告）日：1990-10-10

  Certain 3′-substituted methyl nucleosides are disclosed which are useful in the treatment of viral infections, e.g., infections caused by herpes simplex virus types 1 and 2, and/or are useful as intermediates in the preparation of 3′-substituted methyl nucleosides having antiviral activity. In accordance with one aspect of the invention, there are provided novel 3′-substituted methyl nucleosides represented by Formulas I and II wherein: B indicates that B can be either alpha or beta; B is a member selected from the group consisting of the pyrimidine and purine nucleoside bases connected to the tetrahydrofuran ring through the N¹ heterocyclic nitrogen atom of the pyrimidines and the N⁹ or N⁷ heterocyclic nitrogen atom of the purines including the naturally occurring nucleoside bases and 5-fluoro, 5-bromo, 5-iodo, 5-chloro, 5-trifluoromethyl, 5-ethyl, 5-(2-bromovinyl)­uracil; triazolecarboxamide; 2-aminopurine; 2,6-diaminopurine; 4-chloropyrimidine; pyrimidine; azapyrimidine; purine; 2,6-dichloropurine; 2-amino-6-­chloropurine; and deazapurine; R and Q are either both hydrogen or halogen, especially fluorine, or one is hydrogen and the other one is hydroxy or halogen, especially fluorine; in Formula I at least one of R and Q is halogen; and X and Y can be the same or different and are selected from the group consisting of O-alkyl, O-aryl, O-acyl-, halogen, especially fluorine, azido, amino, acylamido, -SH, S-alkyl and S-aryl, or one of X or Y can be hydroxy, or X may be the group R¹O and Y may be the group R²O wherein R¹ and R² are hydrogen or hydroxy-protecting groups. Preferred O-alkyl and S-alkyl groups contain from one to four carbon atoms; preferred O-aryl and S-aryl groups contain from 6 to 10 carbon atoms; and preferred O-acyl groups contain from one to four carbon atoms.

  本发明公开了某些3′-取代的甲基核苷，它们可用于治疗病毒感染，例如由单纯疱疹病毒1型和2型引起的感染，和/或可用作制备具有抗病毒活性的3′-取代的甲基核苷的中间体。根据本发明的一个方面，提供了由式 I 和 II 表示的新型 3′-取代的甲基核苷 其中 B表示B可以是α或β； B 是选自以下组成的组的成员：通过嘧啶的 N¹ 杂环氮原子和嘌呤的 N⁹ 或 N⁷ 杂环氮原子与四氢呋喃环连接的嘧啶和嘌呤核苷碱基，包括天然存在的核苷碱基和 5-氟、5-溴、5-碘、5-氯、5-三氟甲基、5-乙基、5-(2-溴乙烯基)尿嘧啶；三唑甲酰胺； 2-氨基嘌呤； 2,6-二氨基嘌呤；4-氯嘧啶；嘧啶；氮杂嘧啶；嘌呤；2,6-二氯嘌呤；2-氨基-6-氯嘌呤；以及去氮嘌呤； R 和 Q 要么都是氢或卤素，特别是氟，要么一个是氢，另一个是羟基或卤素，特别是氟；在式 I 中，R 和 Q 中至少有一个是卤素；以及 X 和 Y 可以相同或不同，选自由 O-烷基、O-芳基、O-酰基、卤素（尤其是氟）、叠氮、氨基、酰氨基、-SH、S-烷基和 S-芳基组成的组，或者 X 或 Y 中的一个可以是羟基，或者 X 可以是基团 R¹O，Y 可以是基团 R²O，其中 R¹ 和 R² 是氢或羟基保护基团。 优选的 O-烷基和 S-烷基含有 1 至 4 个碳原子；优选的 O-芳基和 S-芳基含有 6 至 10 个碳原子；优选的 O-酰基含有 1 至 4 个碳原子。
• BAMFORD, MARK J.;COE, PAUL L.;WALKER, RICHARD T., J. MED. CHEM., 33,(1990) N, C. 2494-2501
  作者：BAMFORD, MARK J.、COE, PAUL L.、WALKER, RICHARD T.

  DOI：——

  日期：——
• Synthesis and antiviral activity of 3'-deoxy-3'-C-hydroxymethyl nucleosides
  作者：Mark J. Bamford、Paul L. Coe、Richard T. Walker

  DOI：10.1021/jm00171a025

  日期：1990.9

  allowed high yielding hydrolysis of the 3'-function to give the 3'-deoxy-3'-C-formyl-beta-D-arabino-pentofuranosyl nucleosides 21 and 22. Desilylation afforded the 1-(3-deoxy-3-C-formyl-beta- D-lyxo-pentofuranosyl) 3',5'-O-hemiacetal nucleosides 33 and 34, respectively. Reduction of the formyl group of 21 and 22, followed by desilylation, yielded the 3'-deoxy-3'-C-(hydroxymethyl)-beta-D-arabino- pentofuranosyl)

  已经合成了一系列的3'-支链糖核苷，特别是3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷，并将其评估为抗病毒剂。尿嘧啶和胸腺嘧啶的1-（2,3-环氧-5-O-三苯甲基-β-D-lyxo-五氟呋喃糖基）衍生物12和13分别与5,6-二氢-2-lithio-5-甲基-1,3,5-二噻嗪14分别提供相应的3'-官能化核苷15和16。用叔丁基二苯基甲硅烷基取代三苯甲基可高产率地水解3'-官能团，得到3'-脱氧-3'-C-甲酰基-β-D-阿拉伯糖基-戊呋喃糖基核苷21和22。甲硅烷基化得到1-（ 3-脱氧-3-C-甲酰基-β-D-lyxo-戊呋喃糖基）3'，5'-O-半缩醛核苷33和34。还原21和22的甲酰基，然后进行甲硅烷基化，分别产生3'-脱氧-3'-C-（羟甲基）-β-D-阿拉伯糖基-呋喃呋喃糖基）类似物7和8。将7的尿嘧啶碱基部分转化为5-碘尿嘧啶，然后转化为（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶，以提供B