4-[2-[5-[1-[3-[2-[[3-[2-[2-[2-[3-[4-amino-7-[(2R,5R)-4-(azidomethoxy)-5-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]prop-2-ynylamino]-2-oxoethoxy]ethoxy]-2-azidoethoxy]benzoyl]amino]ethylamino]-3-oxopropyl]-3,3-dimethyl-5-sulfamoylindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl]-3,3-dimethylindol-1-ium-1-yl]butane-1-sulfonic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-[2-[5-[1-[3-[2-[[3-[2-[2-[2-[3-[4-amino-7-[(2R,5R)-4-(azidomethoxy)-5-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]prop-2-ynylamino]-2-oxoethoxy]ethoxy]-2-azidoethoxy]benzoyl]amino]ethylamino]-3-oxopropyl]-3,3-dimethyl-5-sulfamoylindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl]-3,3-dimethylindol-1-ium-1-yl]butane-1-sulfonic acid
• 化学式: C62H78N16O23P3S2+
• 分子量: 1572.4
• InChiKey: XNFDIMAABJDXBF-FIZGAKASSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  106
• 可旋转键数：
  39
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  516
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  32

文献信息

• Dye Compounds and the Use of their Labelled Conjugates
  申请人：Barnes Colin

  公开号：US20100009353A1

  公开（公告）日：2010-01-14

  Novel rhodamine dye compounds, labelled conjugates comprising the dyes are described, together with methods for their use. The dyes and labelled conjugates are useful as molecular probes in a variety of applications, such as in assays involving staining of cells, protein binding, and analysis of nucleic acids, such as hybridization assays and nucleic acid sequencing.

  本发明涉及新的罗丹明染料化合物，以及由这些染料组成的标记共轭物，以及它们的使用方法。这些染料和标记共轭物在多种应用中作为分子探针非常有用，例如在涉及细胞染色、蛋白质结合和核酸分析的检测中，如杂交检测和核酸测序。
• US8178360B2
  申请人：——

  公开号：US8178360B2

  公开（公告）日：2012-05-15